在银耳纯白菌丝和耳友菌丝分离中，常因分离技术不同而效果不同。无非是下列几种结果：①银耳纯白菌丝；②羽毛状耳友菌丝；③银耳纯白菌丝和耳友菌丝；④酵母状分生孢子和耳友菌丝。如果有杂菌干扰，情况就更复杂了。为了得到有生产价值的菌种，在分离时必须每天观察，才能判定纯白菌丝或羽毛状耳友菌丝是否已单独分离。
（1）银耳纯白菌丝的特征。白色、淡黄色，以及白至黄的各种中间色。气生菌丝直立、斜立或平贴于培养基表层，基内菌丝生于培养基内，菌丝直径1.5～3微米，有横隔膜，有明显的锁状连合现象，生长速度缓慢。在适宜温度和湿度条件下，菌丝在培养基表面会出现扭结的菌丝团，并逐渐胶质化，变成小原基，长成小耳片。双核菌丝移植后，或继续长菌丝，或迅速胶质化，或变成酵母状分生孢子。这些取决于菌龄、发育程度、培养基表面的游离水和机械刺激等因素。
（2）耳友菌丝的特征。初白色，常有特别细长的主干和侧生之分，略呈羽毛状的分枝。老菌逐渐变成浅黄、浅棕色，培养基逐渐由淡褐色变为黑色或黑绿色。培养基表面的气生菌丝呈灰白色、细绒状，有时有碳质的黑疤。分生孢子梗呈扫帚状，分生孢子少见，若产生时为黄绿色至草绿色，近椭圆形，直径3～5微米。在段木表面可形成扁平黑色的子座。已知羽毛状耳友菌丝决不单是1个种，可能有2个属3～4个种。