香菇病毒颗粒存于子实体中非常普遍，我国近年来发现香菇在菌丝生长阶段，菌种瓶或菌种袋中出现“秃斑”，在子实体生长阶段，一是出现畸形子实体，二是子实体早开伞，菌肉薄，产量低，经鉴定均为病毒感染。
防治病毒主要采取预防措施，如选育抗病毒的优良菌株，确保菌株不带病毒；注意培养料的消毒，以杜绝病毒传播感染。菇房及生产工具可用0.5%～1%苏打水（碳酸钠）或2%～4%浓度的五氯酚钠溶液喷或洗后太阳下晒干，即可杀灭病毒。播种后菌棒最好用一层旧报纸覆盖，防止带有病毒的孢子掉落菇床。注意防治菌蛆及线虫传播病毒。
