（1）接种后检查定植情况时，接种穴周围没有“菌丝圈”，树皮盖或者种木干缩松动，甚至脱落，锯木屑菌种变成干糠状，这就说明菇木含水不足，且环境过于干燥；污染杂菌后的菌种往往变成黑色，也表示接种失败。
（2）菇木树皮破裂翘起，严重时菇木开裂，手摸树皮毫无松软的感觉。这是菇木过于干燥，也可能是被阳光直接照射造成的。出现这种现象，说明菇场荫蔽不够，前期保湿工作做得不好，必须尽快浇水保湿，改善荫蔽条件。
（3）由于砍树太迟，段木干燥不够，接种后又遇多雨天气，或者浇水太多，菇场湿度太大，导致段木再生发芽。如不尽早摘除树芽，让菇木迅速干燥，最终必将导致营腐生生活的香菇菌丝体饥饿而死。
（4）发菌不均匀。菇木堆中不同部位的菇木，香菇菌丝体蔓延情况差别很大，应该尽快改变堆放方式，增加翻堆次数，调节菇木干湿度。
（5）大量出现杂菌。通常把菇木上除了香菇以外的其他菌类统归为杂菌，包括可以食用的银耳和木耳类。