产菇菌棒一般采收2～3茬菇后就应开始补水，否则菇蕾很难形成。以后每采一茬就补一次水。补水的方法有以下几种：
（1）补水器补水。补水时接通补水器电源，将插管刺入菌袋，把菌袋完完全全浸没在水中，袋内空气全部被抽出，造成负压，水分便均匀地自然浸入袋内，达到水量后，拔出插管，刺入另一袋。
注水器是用空心金属管制成的，管长25厘米，尖锥空心.钻有20多个出水小孔。注水时先在菌袋一端，用同样规格钢筋打一个注水孔。把农用喷雾器喷水头取下，换上注水器，把注水器插入菌袋注水孔内，借助喷雾器的压力把水输入菌袋。
（2）浸泡补水法。利用专设的浸水池或菇棚周围现有的沟畦，铺上塑料薄膜。根据菌袋失水量，用8号钢丝在菌袋两端打几个15厘米左右深的孔。失水多的可深些，失水少的可浅些，然后把菌袋排在浸水池内，失水多的排在底部，中度失水的排在中层，失水少的排在上层。上面用木板、石头等重物紧压，防止菌袋上浮，再把清水灌入池内，以淹没菌袋为度，浸水时间第1次为2.5～3小时，以后每次增加0.5～1小时，最长浸泡时间不能超过15小时。
（3）喷淋补水法。将需补水菌袋用梅花钉板拍打几下，或用塑料拖鞋往袋四周轻轻拍打，或用双手紧抓住菌袋，用手指向菌袋表皮按压，稍有吱吱声，指痕部位略有微凹，使外膜受到震裂，有利于水分吸收。利用手压农用喷雾器或电动喷雾器向袋表直接喷水，前1～2天要小水细喷、勤喷，每天3～4次，待菌袋表皮菌膜湿润，基质吸收一定水分后，可加大喷水量，采用大水、粗喷、勤喷，并向空中和地面喷水，加速水分吸收，一般喷水3～4天即可。
补水后的菌袋，及时放回棚架，通风1～2小时，袋表水分稍晾干后，盖严菇棚薄膜，进行正常变温催蕾管理。