采收后的黑木耳含水量大，重量约为干品的10～13倍左右，应及时干制。干制的方法有两种，即晒干和烘干。
（1）晒干。适合于晴朗天气，选择通风透光良好的场地搭载晒架，并铺上竹帘或晒席，将已采收的木耳，剔去渣质、杂物后，薄薄地撒摊在晒席上，在烈日下曝晒1～2天，用手轻轻翻动，干硬发脆，有“哗哗”响声为干。但需注意，在未干之前，不宜多用手去动，以免形成“拳耳”。
（2）烘干。用烘干房或烘干机均可，烘干时应将木耳均匀排放在烤筛上，排放厚度不超过6～8厘米，烘烤温度应先低后高，初温10℃～15℃，然后逐渐升温至30℃左右，升温速度掌握3～4小时升高5℃，当烘至五成干时，再将温度升到40℃左右，继续烘干到木耳的含水量在13％左右即可。但要注意室内通风换气，以利散潮，提高干品质量，烘干期间还应不断翻动耳片，使木耳烘干得更均匀，更迅速。
烘干后要进行选别分级，并及时包装，包装常用无毒塑料袋。装入木耳后，将袋内的空气轻轻压出，扎紧袋口，密封放置在木箱或木桶内，贮藏在干燥通风的室内或及时出售。如有条件，采用塑料薄膜抽真空外套麻袋的包装，效果更好。