原料的配比与袋栽的一样，即木屑与麦麸的比例为5∶1，另加1 ％的石膏。含水率以60％～62％为宜。培养基拌好后闷半个小时后就可装瓶。
瓶栽滑菇所用的培养瓶有两种类型，一种是用玻璃特制的广口瓶，另一种是用耐高温塑料制成的蘑菇瓶，两种瓶的容量均为700毫升。装料可人工装料，一边装料，一边用手指压料，达到实而不紧的程度。当培养料装到瓶口时，用手指将表面料压平，使料面距瓶口留有2厘米的距离，如果装料高度不够，还要继续装料，达到所要求的高度。装完料后，用直径1BF.BFQ5厘米的打孔锥在料中央穿一个通气孔，用聚丙烯塑料薄膜常压灭菌可用低压聚乙烯和牛皮纸捆扎封住瓶口，并擦净沾在瓶壁的培养料。灭菌可采用高压灭菌或常压灭菌方式进行，由于栽培瓶的容量大，高压灭菌排净冷气后，在1BF.BFQ5千克／平方厘米压力条件下持续1BF.BFQ5小时；常压灭菌上大气后需要持续8小时。灭菌后不能急于打开锅，以防高压气流将瓶盖冲掉。
在接种室内按无菌操作要求进行。菌瓶入接种室前，必须冷却到20℃以下，否则不能接种。