官府自然是要剿匪的，国民党就曾多次围剿瞿伯阶，但此人既能打也能逃，十分狡诈，国民党几次围剿不但都以失败告终，而且每围剿一次瞿伯阶就壮大一次。
瞿伯阶从1926年为匪开始，起初只有十几个人，而正是这十几个人，越搞越大，也曾经历过几起几落，最后到1949年，已发展成为拥有1.9万人、1.2万支步机枪的一个大土匪群，其活动范围也以龙山为中心，辐射范围十分广大，北至湖北宣恩、来凤、鹤峰、咸丰，东南至湖南的桑植、大庸、永顺、保靖、古丈、沅陵，西南至四川的黔江、西阳、秀江和贵州的松桃。
在对待官军进剿上，瞿伯阶也颇有战略战术，如果单从军事角度来看，他的一套可以说就是标准的游击队战法——遇到小股军队，瞿伯阶股匪非但不避，反而要主动攻打，以夺其枪械；有大军来剿，则尽量利用地形与之周旋，寻机歼敌，或者转战其他地区，避之锋芒，或者干脆化整为零，偃旗息鼓，整个匪队竟然消失的无影无踪，有时连瞿伯阶本人也都藏匿起来，在围剿期间根本就不露面，以至大队官兵无匪可剿，最终只好以匪患灭绝向上邀功撤退，而待官军一走，瞿伯阶股匪立即恢复原状，仿佛从地里冒出来一样。总之，瞿伯阶尽量避免与强敌正面接触，决不做亏本买卖，凭着人熟地熟，与官军捉迷藏。
1939年，国民党湘鄂川黔四省绥靖主任谷正伦坐镇边区，他的主要目标就是清剿瞿伯阶，而瞿伯阶反而掉头去攻占百福司，活捉了区长金石，并自封为司令，在卯洞一带仍然强令种植鸦片，恣意妄为。
1940年国民党又派傅仲芳为总司令，以两个师的正规军和川、湘、鄂三省保安部队大军压境，对瞿部搜捕围剿。但瞿伯阶将其部属分为集十股，各自分开，又密设通联暗号，依据号令时分时合。且周转于相邻三省边区十几个县内，后来当官军围剿日紧，瞿伯阶干脆彻底销声隐迹，匪众全部隐匿于民众中，他自己也潜遁至鹤峰藏起来。傅仲芳的两个师在此空转，却连个匪影也没见到，于是傅仲芳宣布：土匪肃清。然后撤退。而当傅仲芳一离去，瞿伯阶又从鹤峰窜回来凤，再以卯洞乡的枫洞为巢穴，又树起盗匪大旗，重新聚集起旧部，并且招兵买马，扩大队伍，声势反而更大。
解放后，曾是瞿伯阶的接班人、他的族弟瞿波平回忆说：“据我亲身经历体会，国民党军队不剿，瞿伯阶搞不起来，他们剿一次，他就壮大一次。”