李秀成的功过是非，头绪纷纭，一言难尽。笔者在此文中只想解决一个问题，那就是根据历史事实，说明李秀成不是叛徒。
第一，敌人攻破天京，他不顾自己的老母和全家，只保护幼天王突围，并且把自己的战马让给幼天王，以致自己掉队。
第二，敌人千方百计向他了解洪仁 与幼天王的去向，与太平军下一步的行动计划，他是在天京陷落之前制订这个计划（南下江西，绕道湖北，与西北太平军陈得才部会合）的决策人，但却一个字也不透露。敌人追急了，他就在《自述》中搪塞说：“（幼天王）十六岁幼童，自幼至长，并未骑过马，又未受过惊慌，九帅四方兵追，定言（然）被杀矣。若九帅马步在路中杀死，亦未悉其是幼主，一个小童，何人知也。”曾国藩果然相信了他的话，放松了对幼天王的追击，并且在奏折中说：“洪福（幼天王）以十六岁童，纵未毙于烈火，亦必死于乱军，当无疑义。”可见李秀成在敌人的囚笼中仍然努力保护幼天王等人。
第三，根据曾国藩的幕僚赵烈文《能静居士日记》所记，李秀成在得到曾国藩要杀他的通知后，“无戚容”，在赴刑场的途中，还是“谭笑自若”。这种视死如归的态度，绝不是一个叛徒所能做得到的。
《李秀成自述》写得很长，有3万余字和5万余字两种说法。其中所写的太平天国史实，已经是真假难分；写他自己的思想变化，又使人捉摸不定。这篇文章让读者看得扑朔迷离，一点也不奇怪。因为它是在非常特殊的情况下写出来的，我们也得用非常特殊的眼力去看它。首先，它是一篇供词，是一位非常人物（太平天国的后起之秀、国之栋梁）在非常情况下（囚笼之中）用非常速度（每天7000字）写出来的。《自述》写好之后立刻被收走，连回头看一遍的机会也没有，全无斟酌修改的余地。
其次，这是绝笔。李秀成虽然文化程度不高，但是头脑清楚，精明干练，一点也不糊涂。他知道《自述》写完之时，就是自己离开这个世界之日。“安能忘情如太上，生无欢乐死无哀”，国难家仇，生离死别，他的感情波动是可想而知的。在感情激烈波动之时所写出来的文字，就很难做到有条有理，头绪分明。
还有，他写这篇《自述》，一不是为了交差，二不是为了乞降，他是在利用最后一点时间，最后一次机会，为太平天国的大业尽自己最后一份力量。他希望用《自述》来说服自己的对手——清方的实力派、老奸巨猾的曾国藩。目的是什么？这也不难设想：
一、把对方的注意力吸引到别的方面，不让对方了解幼天王、洪仁 等人的去向与绕道江西、湖北与西北太平军扶王陈得才会师的计划。（所以在《自述》中对这一方面的活动一字不提。）
二、建议实行一项“收齐章程”。从表面上看，这是建议招降大江南北太平军余部，为敌人出力；从实际效果来看，是在“招降”的掩护下联络太平军余部，伺机卷土重来。
三、在太平天国复国无望的情况下，策动曾国藩反清，建立一个汉人政权。让“收齐章程”为这个新政权服务。当时，以曾国藩为首的湘军淮军势力已经控制了江、浙、皖、赣各省，如果能够策动成功，并不违背“驱除鞑虏，恢复中华”的起义初衷。（可惜这一部分内容已被曾国藩撕毁，以致《自述》有头无尾。）他既想把这层意思告诉曾国藩，又不能明说，只能一再暗示，让对方去体会。因此，这种文字看起来就不明不白，欲言又止，欲说还休。
李秀成文化程度不高，错别字连篇，文章中又夹用大量方言土语，本来已经很不容易看懂，再加上经过曾国藩的窜改（曾国藩怕被清廷看出破绽，不得不作删改），自然更加难懂，几乎成了天书。
其实，能不能看懂《自述》，能不能看出李秀成的真意，并不影响我们对李秀成的评价。李秀成的功过是非，是由他的一生事迹所决定的，不应该受到《自述》的影响。不过，在了解《自述》出笼的经过之后，我们对《自述》的解释与评价就应该更加慎重，不宜轻易表态，以免厚诬古人。那么复杂的内容，那么复杂的背景，其中的一言一语，岂是不了解内情的人所能轻率解释的，所能轻易表态的！
一部太平天国史扑朔迷离，这是因为历代“借他人酒杯浇自己块垒”的古为今用的人太多了；一篇《李秀成自述》扑朔迷离，这是因为作者用心太深而背景又太复杂的缘故。正是：
扑朔迷离自有因，
今人难度古人心。
百年遗恨能记取，
便是古人有知音。