这与深圳、上海等城市的企业相比，南京的企业负担要重得多，大大地增加了企业的运营成本和商务成本。
（6）市场竞争与开放环境
市场竞争环境。该指标南京竞争力排名较后，第27位。下设同行业竞争程度、企业与供应商竞争、生产要素发育三项子因素，其中同行业竞争程度同企业与供应商竞争指标，据问卷调查统计结果，被视为表现较好的指标。问卷面向全国50个城市，共发放2000份，样本数量相对偏少，样本代表性与合理性仍有待斟酌。
就南京市产业竞争发展而言，主导产业为石化工业、汽车制造业与电子信息业，发展尚可，但由于这些产业生产技术度与成熟度及国际化标准化要求相对较高，竞争相当激烈，南京的这些产业在国内国际市场上并无绝对优势。此外，南京虽具有比较完备的工业体系，但尚未形成真正的产业集群，在石油化工、生物工程、制药、电子信息等重点支柱产业中，很多产业水平不高，产业的前后联系较少，未形成产业层次的集团经济、范围经济，如珠江路电子产品虽竞争激烈，但产品趋同，基本也不存在研制、销售的分工环节。此外，南京市政府的管理效率仍有待加强，如征税环节、行政审批手续繁琐，直接影响了南京的市场竞争环境。
在生产要素发育方面，南京区位便捷，毗邻上海，广接内地，能够吸引与扩散各种生产要素，有一定的集聚力与扩散力，推动经济的增长。南京高等教育机构与科研机构数目众多，人才要素素质较高，且劳动力要素成本低，科技要素较高，但资本要素中国有资本比重相对偏高，民营资本的活跃程度不够。
总体而言，该指标能够部分反映南京的现实情况，但竞争力排名略有偏后。
此外，政府管理与效率市场竞争环境也有一定相关性，仅此三项指标还不能完全反映城市市场的竞争发育程度。
市场开放环境。该指标南京竞争力排名第7位，下设对民间资本的开放度、对城外资本的开放度、对弱小企业的扶持程度三项子因素。南京对民间资本与城外资本的态度总体持宽容、鼓励与谨慎的态度。如杭州人、宁波人开办的诸如红泥、万家灯火、向阳渔港等杭帮菜、宁波菜，在南京发展势头红火，温州人在江宁区则开设了温州一条街。近几年，南京各区县政府根据“谁投资、谁开发、谁拥有”的原则，承诺承租30年不变，吸引民间资本开发旅游。2004年3月，在民营经济工作会议上，江苏省提出鼓励民间资本参与公共基础设施建设。此外，2003年6月，南京出台鼓励、扶持中小企业发展的措施，对中小企业提供与大企业一样的国民待遇。总体而言，该指标基本反映了南京的现实开放情况，南京市场的开放环境尚属上游。
市场国际化。该指标南京竞争力排名第21，位置靠后。下设对外贸易依存度、外资占总投资比重与企业国际交流程度。
从纵向看，近几年南京市场国际化发展迅速，但从横向看，相对于国内一些先进的中心城市，尤其是珠江三角洲，表现出一定的差距。2002年，从江苏省内看，南京实际利用外资只及苏州的五分之一，只相当于县级昆山市。对外贸易依存度较低，外资在产业投资中比重较低，南京至今没有真正意义上的跨国公司研发中心，仅有少数外资研发机构。原因在于，上述主导产业发展缺乏当地配套中间产品的支持，成本提高，竞争力下降，影响了对外资的吸引力，此外，南京国有经济的比重偏高，制约了当地企业与国外跨国公司的合资合作。
同时，相对于其他中心城市，南京市企业国际交流程度还有待提高。虽有金秋经贸洽谈会、国际梅花节等交流活动，但并未真正发挥自身优势。南京是六朝古都，风景名胜居多，但分布分散，缺乏统一规划。旅游与经贸活动的结合，一方面可促进经济交流，带动相关产业，提高人流、物流的发展，另一方面也可扩大城市的知名度和影响力。
总体来说，倪鹏飞《中国城市竞争力报告No.2》一书中开放竞争力指标内容较2003年有较大增删，但指标对南京竞争力水平描述与排名较之上年浮动不大，基本与南京现实情况相符。唯有其中2003年开放竞争力指标中南京社会交流指数排名第8，位置靠前，表明南京对外交流程度尚可，这与南京国际化程度较低的事实不相吻合。
（7）政府管理与政府营销战略
南京政府管理服务排名第22位，比较靠后，其中政府管理成本排在第35位，政府服务质量排名第15位。政府营销战略排名第7位，整体排名比较靠前，只有政府规划能力指数较低，排在第17位。这种排位基本符合南京的实际情况。
在商务环境竞争力中，政府管理的相对瓶颈使其地位提高，政府管理的改进，能够大大提高城市的商务环境竞争力。客观地讲，南京市在政府管理和政府服务方面确实存在着一定的问题：
第一，政府职能转变不到位。从政府和企业的关系看，政府还没有完全从企业活动中超脱出来，行政干预在某些领域依然存在。
第二，政府服务效率较为低下，官僚主义作风比较严重。管理手段存在一定的问题，工作作风也存在一定的问题。有的政府部门存在着“门难进、脸难看、事难办”的现象。如部分行政审批过多的问题还没有从根本上得到解决，有的审批手续繁琐，办事效率低下，来宁投资者在北京一周能办完的事在南京有时要一个月还办不好。另外，乱收费现象较为严重，这使得企业和投资者不堪重负。
第三，政府创新能力有待提高，政府主体性不够强。
第四，政府战略规划的科学性和透明性不够好，尤其是政府长远规划的执行力度不够。已经制定好的规划，随着新一届政府班子的成立通常被废弃，实行另一套新的规划，这样不利于南京市的长远发展。
第五，政府管理体制存在一定的问题。南京市政府管理体制存在的多头管理、政出多门、统一规划不力、组织协调困难的状况没有得到根本的改变，总体效率不高。如南京市在信息化建设过程中，由市政府办公厅主要负责电子政务工作；市科学技术局主要负责组织协调软件产业和软件园区建设；市经济委员会主要负责全市电子信息产业的管理和协调企业信息化工作；市无线电管委会负责无线电相关资源、台站的管理等，各部门难以形成合力，资源整合不够。
近年来南京市的政府管理改革也取得了一定的成效，主体是推进服务型政府的建设，一是实行政务公开。二是深化行政审批制度改革。三是推进政务服务便捷化。四是加快电子政务建设。南京市政府在自己的网站上正式设立南京市网上政务大厅，首批工商、国税、地税、物价、市政公用、劳动和社会保障、人事、统计、海关、外经贸等10个部进“厅”办公，为社会公众提供业务指南及相关表格下载功能，在线受理报批事项及市民投诉、咨询监督等政务。五是强化政务投诉监督机制。建立行政效能、外商投资、民营科技企业、私营和个体经济四个投诉中心，以及相应的责任追究制度。六是实行城市管理综合执法。将原先分散于多个部门的58项城市管理执法权统一集中到城市综合执法局，使执法效率明显提高。七是加强社会保障体系建设。
总体来讲，《中国城市竞争力报告No.2》在33个解释性指标及其分指标的分析和排名上比较客观地反映了南京在竞争力比较上的优势和劣势；但是其中也存在一定的不合理之处，我们在研究中普遍感到解释性指标中的主观问题太多，并且问卷的发放数量比较少，每个城市大约仅有150份，而且受访者的面较窄（主要是专家和有代表性的企业家），这样调查出来的结果只能代表这一小部分人的意见，并不能代表这个城市广大居民的真正想法，会产生以偏概全的现象，得到的结果也就难以令人信服。
此外，我们也对指标设计的体系产生了一些疑问：如政府管理成本仅通过各种税收总额、部门非规划收费两个方面来反映和体现；文化氛围用文化乡土性、文化国际性和文化多样性3个分指标来反映是否合适；人才本体竞争力仅通过能力、创业、创新和价值取向指数这4个二级指标来反映，且均为软指标，主观性、不确定性都较大，能否真正反映人才本体竞争力的强弱等等。
第二节南京城市综合竞争力的强弱项分析
一、南京城市综合竞争力的强项分析
1.全国性的区域中心城市
南京是着名历史文化名城，具有深厚的文化底蕴，丰富的科技、人才等人文资源和优良的文化禀赋，使南京成为当之无愧的全国性区域性中心城市。
2.明显的集聚优势
南京市的城市综合实力和快速良好的经济增长态势决定了南京能吸引、占领、集聚更多的生产要素，占领更广阔的市场空间，更持久地保持这种创造更大城市价值的能力和潜力。根据社会经济物质实体的总量指标，社会经济发展人均创造价值指标和每平方公里创造价值指标计算城市集聚度，南京市在15个副省级城市中名列第3位，仅次于深圳和广州。
3.优越的综合环境
（1）居民生活环境竞争力非常强。南京市在基础设施质量、城市自然环境、社会治安环境、制度文化环境等方面在全国独占鳌头，分列全国第3、5、2和7位。通过综合考评，关于生活环境整体竞争力，南京在全国200个城市中，名列第6位，在15个副省级城市中排名第3位。
（2）区位优势明显。南京市具有通江达海的优越地理位置，水、陆、空、地下管线等各种交通运输渠道发达，历史上已经成为全国着名的政治文化中心城市，在新的经济形势下，又以自身的优势地位成为全国最重要的经济区——长三角经济区中的重要城市之一。
（3）商业文化环境优越。南京这座古老的城市历史上形成的包容精神和悠久的历史文化，培育了南京优越的社会人文环境，塑造了南京优越的综合商业文化环境。
4.丰富的人才与科技资源
南京不仅拥有丰富的受过良好基础教育和专业技术教育的智力资源，同时也具有由众多具备相当知识与专业技能的人才所共同组成的教育机构、科研单位、研发部门等智力资源的培训组织机构，这就决定了南京市的智力资源的密集程度非常高。同时，南京科技资源丰富，科技竞争力较强。
5.较高的市场综合占有率
南京市综合市场占有率较高，尤其是商贸市场相当繁荣，是长江中下游的商贸中心，是华东地区除上海以外最为重要的商贸流通中心和市场中心。根据中国社科院课题组的研究，南京市的综合市场占有率在全国50个城市中排名第8位。
6.较发达的制造业工业基地
南京制造业基础较好，已初步形成电子化工、石油化工、车辆制造、钢铁、电力等五大支柱产业。近年来，坚持走新型工业化的道路，调整五大产业的发展目标，着力引进投资强度高、技术先进、产业关联效应强的重大项目，推进产业集聚发展，构筑现代制造业基地。在全国200个城市中排名第6位，在15个副省级城市中排名第3位。
二、南京城市综合竞争力的弱项分析
1.城市定位缺乏持久性
多年来，南京的城市定位多追求“高、大、全”，最近逐步趋向务实和特色化，但与上海、苏州、温州、东莞等定位明确的城市相比，南京的城市定位应精炼并更趋准确。目前国内很多城市发展定位很明确，城市特色也很鲜明，如上海的经济和金融、深圳的效率和速度、香港的自由和法制、西安的古都和历史等，个性化的发展为这些城市的成长增添了力量和价值。
2.创业创新精神不足
根据中国社科院课题组的研究，南京人创业精神指数和创新意识指数排名比较靠后。这是历史文化传统、市民价值观念、经济社会环境的综合结果。南京文化兼容并蓄，居民稳重踏实，思想观念趋于保守，这样就不利于创新思想的形成，不利于标新立异、更加开放的创业创新氛围的形成。
3.政府管理成本居高不下
南京的部分政府部门在管理中存在多头管理、政出多门、统一规划不力、组织协调困难等现象，推诿扯皮、人浮于事、官僚主义作风在一定程度上导致交易成本的增加，也影响了投资创业。此外，南京的一些政府战略规划科学性不够强，透明度不够高，尤其是政府长远规划的执行力度不够，影响了政府管理效能的提高。
4.居民人均可支配收入不高
南京居民人均可支配收入较低，与国内乃至省内先进城市的差距还有拉大的趋势。综合人均收入在15个副省级城市中排名第6位。原因主要是：南京没有形成全民创业的社会氛围，个体私营经济发展相对较慢；经济结构、产业结构调整尚未到位，第三产业总量相对偏少，现代服务业不够发达，对劳动力就业的吸纳力有限；就业矛盾突出，结构性失业问题突出；居民收入来源单一，缺少经商、投资理财等其他增收渠道。
然而，相对于较低的居民收入水平，南京居民的生活成本却很高。居民生活的各种水电煤气、通讯信息、道路交通等费用过高，与市民的人均收入水平偏离度较大。尤其值得注意的是，南京几年来连续走高的房价让老百姓不堪重负，住房绝对价格和涨幅均位于全国前列，与市民人均收入在全国的排名不相称。