长期以来，我国菜农一直沿用的是经验性施肥，缺乏足够的科学指导，在肥料种类上习惯于施用有机肥料和氮素化肥，而较少施用钾肥、磷肥和微量元素肥料。要做到科学施肥，必须掌握南瓜的需肥特点和需肥规律。
南瓜的需肥特点是：南瓜枝叶繁茂、根系发达、生长期长、需肥量多，整个生育期对养分的吸收量以钾和氮最多，其次为钙、镁和磷的吸收量较少。据研究，生产1千克产品需吸收速效氮4.1千克、五氧化二磷2.3千克、氧化钾5.5千克，其比例为1∶0.6∶1.3，还需钙、镁、硫、锌、铁、铜等微量元素。
南瓜的需肥规律是：生长时期不同，南瓜对养分的吸收量也不同。幼苗期生长量小，需肥量也少，进入果实膨大期对氮的吸收量急剧增加，钾和氮的吸收规律基本一致，而磷的吸收量增加较少。有关研究显示，南瓜从定植到拉秧的137天中，前1/3的时间对氮、磷、钾、钙、镁的吸收量增加缓慢，中间1/3的时间增加迅速，在最后1/3时间内增长最为显著。另外在不同生长时期需肥种类不同，幼苗期和茎叶生长期需生长健壮，避免徒长，需氮、磷和钾均衡供应，如果过多的氮肥往往造成徒长，反而延迟开花；进入结瓜期，是典型的营养生长和生殖生长并进的阶段，养分争夺比较突出，氮、磷和钾的供应必须充足、均衡，才能保证二者的正常生长。
了解了南瓜的需肥特点和需肥规律后，南瓜施肥要遵循平衡施肥原则，即做到有机肥料与化学肥料配合施用、大量元素之间（氮、磷、钾）养分供应要平衡、大量元素与微量元素之间供应要平衡。