将已接好种的菇木按树种、大小、长短分开堆放在场地。堆积的方法很多，应以有利于香菇的生长发育为原则选择堆积方式。
（1）“井”字形堆积。“井”字形占地面积小，便于覆盖，有利于保温保湿，适合于大量栽培和平地堆积。
在冬春低温期接种的，对含水分较多，易于发芽的菇木，或随砍随接种的菇木，均采用此法为好。具体方法是在堆积的地方先于四角垫上石头，然后在石头上放两条菇木作横木，再在横木上以每10厘米的间距将菇木逐根整齐排列，纵横交错重叠，直到1～1.2米高时为止。
（2）覆瓦式堆积。覆瓦式向阳性好，吸湿均匀，环境稳定，发菌一致，适合于斜坡山地或较干燥的平地。操作方法：在准备堆积的地方，先搭两根木杈，或垫上两块石头，高度可根据堆放坡度而定，一般为30～40厘米，在两杈或两石上架一横木，然后按每根间距10厘米的密度，将菇木头朝下，尾朝上，逐根整齐排列。排摆好后，用一根横木摆在离排头约30厘米处，然后再放第2排，如此自山下至山上一排排地堆积上去，长度根据山势而定。排与排之间的间隔空隙应互相错开，以利于空气均匀流通。