木块菌种分为楔形和棒形（包括枝条种）两种。由于种木形状不同，其接种方法也不一样。
（1）接种楔形木块菌种。先把段木梢端靠在枕木上，用斧形凿在段木上凿成深约2厘米的裂口，裂口与段木纵轴约成45°角，然后将楔形种木插入裂口中，用锤子或榔头敲紧，使种木与段木裂口密合。其接种密度应大于接种锯木屑菌种的密度。上述凿口方法，与老法种菇“砍花”相似，是砍花种菇的继承和发展。不过，由于这种方法的技术较难掌握，凿口不容易规格化，所以生产中已较少采用。
（2）接种棒形木块菌种。接种棒形木块菌种，可以用锤形打孔器或者电钻，在段木上打接种穴，其深度应与种木的长度相等或略深，接种密度也应稍大于接种木屑菌种的密度，种木植入后锤平即可。
（3）接种枝条菌种。段木上打接种穴的方法和密度与接种锯木屑菌种相同，而枝条菌种的植入方法与棒形木块菌种相同。只是因为枝条的粗细不一，接种前需要按其粗细分类，然后选用相应口径的打孔器或电钻打接种穴，再进行接种。正因为枝条菌种在利用中比较麻烦，所以已逐渐被其他种型所取代。