玉竹，一般在栽种后的第3年收获。南方秋季采收，北方春季采收，以便与栽种时间衔接。秋季地上部分枯萎后，或在春季萌动前，选晴天，土壤比较干燥时收获。采挖时，先割去地上茎秆，再用锄挖起根状茎，抖去泥土，防止折断。留作种的根茎选出后，另行堆放。图12玉竹
加工：①分等级。将挖出的根状茎，按长、短、粗、细挑选，分等级。②摊晒。将不同等级玉竹分别摊晒。夜晚待玉竹凉透后加覆盖物。切勿把未凉透的玉竹堆放或装袋，以免发热变质。一般晒2～3天至玉竹既柔软又不易折断。③搓揉。放入箩筐内撞去须根和泥沙，再取出根状茎放在石板或木板上搓揉。搓揉时要先慢后快，由轻到重，至粗皮去净、内无硬心、色泽金黄、呈半透明、手感有糖汁黏附时为止，再晒干即成商品玉竹。④其他方法。也有采用蒸揉结合的加工方法，即先将鲜玉竹晒软后蒸10分钟，用高温促其发汗，使糖汁渗出，再用不透气的塑料袋装好，约30分钟以后，用手揉或整包用脚踩踏，直到色黄半透明为止，然后取出摊晒至干透。
加工时要防止搓揉过度，否则色泽变深，甚至变黑，影响商品质量。