咖啡对人体虽然有好处但也不能多喝，每天以不超过两杯为宜。对于容易紧张焦虑的人，喝多了可能就会有害。咖啡因有助于提高警觉性、灵敏性、记忆力及集中力，但饮用超过平常所习惯饮用量的咖啡，就会产生类似食用相同剂量兴奋剂的作用，会造成神经过敏。对于倾向焦虑失调的人而言，咖啡因会恶化手心冒汗、心悸、耳鸣等症状。
咖啡因本身具有很好的利尿效果，如果长期且大量喝咖啡，容易造成骨质流失。对于妇女来说，可能会增加骨质疏松的威胁。但前提是，平时食物中本来就缺乏摄取足够的钙，或是不经常活动的人，或者更年期后的女性因缺少雌激素造成的钙质流失，以上这些情况再加上大量的咖啡因，才可能对骨造成威胁。