（1）消化道投药，口服投药。一般多为散剂、煎剂、溶液，有的可以直接拌在饲料里，让鹿自己采食，只要无特殊异味鹿都能采食。在大群投药时，要尽量拌匀、撒匀，防止鹿因强弱采食不均而引起中毒，从而不能取得很好的疗效。所以，在投药前最好停饲1～2次，将药混入鹿喜食的饲料中给予。易溶于水的药物，如高锰酸钾等，可以放在饮水中让鹿饮用。人工经口投药，必须在很好保定的情况下进行。用汽水瓶、橡胶投药瓶等灌入，或用胃管投入。
（2）直肠投药。直肠投药的优点是，药物不经肝而直接吸收到血液中，不受小肠及消化酶的影响，吸收好，副作用少。投药前先给鹿进行温水灌肠，排除宿粪，然后用胶管将药液灌入直肠。如为了麻醉可灌水和氯醛溶液，为了清洁直肠软化内容物可灌钾肥皂水等。
（3）瘤胃内投药。在瘤胃膨胀、瘤胃积食时，用套管针可直接进行瘤胃穿刺，并将药液注入鹿的瘤胃内，这种方法能造成局部损伤，非紧急情况下不用。如瘤胃膨胀时，可在穿刺放气的同时注入30％鱼石脂100毫升或10％来苏儿100毫升。
（4）皮下与皮内注射。将药液注射到皮下组织内，经毛细血管、淋巴管吸收到血液中，凡易溶解、无强刺激性的药液和疫苗、菌苗均可皮下注射。
皮下注射部位通常选在颈两侧、胸腹侧皮肤容易移动的地方。对于驯化较好的鹿，注射少量药液时，可用金属注射器吸入药液，在鹿一侧迅速拈起皮肤，瞬间注入药液，当鹿发生反应出现疼痛时已注完。皮内注射是把药液注射到皮肤的真皮层内，如卡介苗就注射在尾内侧皮内。
（5）肌肉注射。肌肉内血管丰富，神经少。因此，有刺激性不宜皮下和静脉注射的药物均可肌肉注射。肌肉注射药物比静脉吸收慢，可持续发挥作用。对于驯化良好的易接近的鹿，同皮下注射方法一样，而且不用拈皮肤，注射更方便；对于凶悍不驯服的鹿则需在保定器过道内注射或保定注射。近几年，使用国产麻醉枪保定鹿，效果不错，但因气囊充气费时费事，因此，使用的并不多。很多鹿场用长杆注射器，即把金属注射器装在2～3米长的长杆上，注射时只要对准鹿身上注射部位用力一捅即可。
（6）静脉注射。将药液直接注入静脉管内，随血流分布全身。这种注射方法作用迅速、奏效快，但排泄也快。鹿的静脉注射需在保定条件下进行，多在耳静脉或颈静脉处注射，局部注射时需剪毛、消毒，注射药液要缓慢。
（7）腹腔内注射。鹿的腹腔内注射多用于仔鹿，特别在仔鹿下痢，因肺炎脱水、静脉不怒张，加上仔鹿皮肤干涩进针困难时，则应通过腹腔给药，药物包括葡萄糖、林格尔氏液等。注射部位可选在右侧肷部中央或乳房前方，稍提起后肢，使肠管前移，这样进针不易损伤脏器。注射部位要求消毒彻底，药液温度与体温相同。