（1）白灵菇与其他木腐菌或草腐菌宜分场所制种和种植，特别是草腐菌类菇种的制种和栽培都需将培养料发酵处理。在发酵期间，病菌和蚊蝇虫害大量繁殖，同时木腐菌类菌种也处于制种发菌期，相互间在同一时间和同一环境下生长，病虫害易于交叉感染，容易造成木腐菌制种上的污染。只有分开场所，分别制种，才能保持木腐菌类菌种场和栽培场地的清洁卫生。
（2）选用抗病虫性强的品种，培育生活力强、高纯度的菌种。抗性强的品种是体现出品种的遗传优势，而菌种的生活力和纯度则由供种单位的技术和条件所决定。栽培者在引进优良菌种的同时选择适宜于出菇季节温度出菇的品种，才能消除或减少病虫害侵染的机会，安全发菌顺利出菇。
（3）保持环境清洁干燥。制种发菌场所提高菌种成品率的重要措施之一就是保持整个制种场所清洁、干燥、无污染菌袋，无积水，排水沟通畅，空气、水源清新、干净。这样空气中杂菌指数低，接种和发菌期间感染的机会也随之降低。
（4）在能保证正常出菇的条件下，并适当降低菇房内的湿度，增加通气量，有助于减少病菌的生存条件。采菇后及时清除残菇、断根，清除污染菌袋，保持菇房清洁，极大程度地降低病虫滋生条件。