赵构登基两个月后，派孟氏的弟弟孟忠厚负责迎奉孟氏来应天府，员外郎杨迈负责沿途粮草、船只等事宜。同年8月2日，孟氏离开了生活五十年的汴京，前往应天府。
因为赵构拥兵八万，人们都以为他要以武力夺回宋朝政权。实际上，他并不是真正想抗金的主儿。没错，当年他是拥兵八万，但是金兵裹胁着赵佶、赵恒北去，赵构并没有主持真正意义上的抗击。或许他觉得宋朝的兵力不足以抗击金兵，或许他希望不抵抗换取金兵的休战，或许他觉得战事有危险……总之，在他登基之后，每遇到金兵来犯，他总是采取拖家带口，一路逃窜的“策略”，根本没有组织起来什么像样的抵抗。这使得宋朝的百姓饱受了战乱之苦。作为一国之君，这不仅是耻辱的，同时也是不负责任的。
看看赵构逃跑的路线，就知道这位皇帝多么不容易了。建炎元年（1227年）秋，金兵来犯，赵构从应天府跑到扬州。建炎三年（1129）二月，金兵奔袭扬州，他狼狈渡江，经镇江府到杭州。又跑到镇江，于十二月初再跑到杭州。撤了帘的孟氏也只得一路随行。
赵构的政治抱负一直摇摆不定，在任用宰相问题上也是朝定夕改，先是用张邦昌当皇帝，后用黄潜善、汪伯彦当宰相，后来又换成朱胜非。高宗甚至启用被公认为“糊涂蛋”、最平庸无能的王渊，任相当于副宰相职务的枢密院的头头。
赵构不能任用贤才，而且是非不分、赏罚不明，终于酿成了大祸，丢了皇帝位。
（4）再度垂帘被逼无奈
建炎三年（1129年）三月，军队首领苗傅、刘正彦等人，见张浚、韩世忠、刘光世等大将都领兵在外，杭州城内兵少将寡，就与将官王世修、张逵等人密谋，策动军事政变。
三月九日是神宗赵顼的忌日。苗傅等人在城北桥下设了伏兵，将糊涂蛋王渊杀死，然后率兵来到行宫门外。杭州知府立即将城门关闭，决定死守。
赵构率众官员登上城楼，他问苗傅等人为什么搞政变。
苗傅等人回答：“陛下信任无能之辈，将士有功不奖不赏，黄潜善、汪伯彦误国却不流放，我等为大宋效劳，得不到赏赐晋升不说，反倒要受迫害。今天，我们已经杀了王渊，还请陛下下令将康履斩首，不然我们不撤兵。”
赵构说：“可以，我满足你们的要求，把这些人流放到海南岛，请你们回兵营吧。”
苗傅道：“不杀康履，决不回营。”
胆小如鼠的赵构不得不将康履交出来。康履立即被苗傅等人杀死。赵构还当着兵变头目的面，提升苗傅、刘正彦等人为御营都统制。不过，这样还是满足不了他们的要求。
苗傅、刘正彦等人一看赵构软弱可欺，拿出了他们的政治要求：逼赵构禅位。这时宰相朱胜非来到城门下规劝苗傅等人。
苗傅等人托朱胜非说：“让陛下退位！一切问题都迎认而解。”
赵构说：“我可以退位，但是必须由孟太后下诏才行。”并立即派人去请孟氏前来。
实际上，这是赵构的缓兵之际，他希望用时间来消磨苗傅等人的锐气，同时盼望孟太后到来以后，能用女人的智慧规劝这些叛乱者。
苗傅、刘正彦等人见孟太后到来，立即说道：“现在朝廷不明是非，希望太后做主。”
孟太后说：“前朝的变法引来国力衰退，这不是当今陛下的责任。当朝皇帝圣明，虽然曾被一些奸臣蒙蔽，但现在黄潜善、汪伯彦已经正法，难道你们不知道吗？”
苗傅、刘正彦等人说：“我们已经决议请您来主持垂帘朝政，奉皇子当朝。”
孟太后非常生气地说：“你们这是不顾大局，现在外敌进犯，我不过是一个妇道人家，皇子不过是个三岁的孩子，怎么能够统治天下呢？如果金人知道宋朝如此，他们更会欺负我们的。”
实际上，苗傅、刘正彦等人已经铁了心肠要逼宫。他们坚持由太后垂帘听政，并且威胁说，如果不答应他们将自杀，同时表示，将士们看到他们自杀，一定认为是朝廷逼迫，兵变将不可避免。
孟太后没有见过这样的场面，也不知道怎么办好了。她知道赵构心情沉痛，便对朱胜非说：“宰相有什么主意？为何一言不发？”
这时，赵构的随从告诉孟太后，赵构已经决议禅位。他们向叛军提出“禅位四条件”：
第一，尊敬皇帝，应像钦宗对道君皇帝一样；
第二，禅位之后，朝廷一切大事由孟太后及嗣皇安排；
第三，答应禅位条件后，将士应当立即返回军营，不得干扰城垣，应守信用；
第四，严禁将士抢劫、杀人、放火。
苗傅、刘正彦等人见目的达到，便同意了“禅位四条件”。于是，赵构下禅位诏书，宣布完毕，这位无能的皇帝没有反思自己执政时的功过，反倒说了一句“天下太平了”的感慨。应当说，被逼禅位的赵构，被史学家称为典型的无能皇帝，他不思进取，无法控制朝廷，最后落得个咎由自取的下场。
当天晚上，赵构迁居显忠寺。
公元1129年3月5日，也就是兵变的第二天，已经年届五十二岁的孟氏，与赵构年仅三岁的儿子赵旉同时升堂，再度垂帘听政。朝廷首先颁布了大赦令，使苗傅、刘正彦等人安稳下来。之后，下诏称太上皇赵构为“睿圣仁孝”皇帝，改显忠寺为“睿圣宫”。
实际上，镇守在外的大将军张浚、韩世忠、吕颐浩等人接到赦诏，已经开始怀疑朝廷有变，他们几位合计着是否要起兵勤王。孟氏和宰相朱胜非商量，觉得首先应当不再引起内乱，于是派人前去安抚。
苗傅等人成功地逼退赵构禅位后，又进一步想影响朝廷。苗傅提出要改变年号，而刘正彦则希望迁都建康（今江苏南京市），实际上乱党内部开始发生矛盾。
孟氏和朱胜非商量，觉得这两件事情都不答应，可能会进一步引起乱党的火气，于是商议先改年号，而迁都则不考虑，理由可以用朝廷国库空虚无法实现来搪塞。他们又派人告诉赵构，赵构哪里还管这些，一脸的“爱怎么样就怎么样”的表情，于是孟氏下诏，改元“明受”。
苗傅等人也不是聋子、瞎子，他们一直观察着诸侯和军队首领的反映。听说韩世忠等人要在秀州准备起兵勤王，立刻慌了手脚，马上把韩世忠居住在杭州的妻儿抓起来当人质。战事一触即发。
孟氏立即让朱胜非出面找苗傅谈话。朱胜非对苗傅说：“太后觉得，你把韩世忠的家眷当人质，只会激怒韩世忠等大将，对谁都没有好处。你们应当放他们回家，用实际行动安抚在外的军队将军们，这样国家才能安定。”
苗傅一时没有了主意，只能表示同意。因为他自己也知道，一旦在外的将军们率兵勤王，自己和刘正彦的军队未必能够抵挡得住，所以他才同电了。实际上，孟氏和朱胜非已经商量好了计谋。苗傅把韩世忠的妻子梁红玉放出来后。孟氏和朱胜非立即把梁红玉找来，秘密晋封其为安国夫人，给了很多赏赐。
孟氏对梁红玉说道：“现在国家有难，你也知道、体验到了。朝廷需要韩世忠等在外的将军救驾，请你去找韩世忠，把情况告诉他，请他们快些回朝。”
这就是孟氏和宰相朱胜非的计谋，实际上是一步险棋。一旦苗傅、刘正彦等人狗急了跳墙，朝廷将遭到血洗屠杀。
天遂人愿！梁红玉坐着朝廷派出的马车，以探营为名一路狂奔，一天一夜便赶到韩世忠的驻地秀州。韩世忠等人弄清情况后，和诸位将军进行了周密的布置，于是汇聚了几路兵马，采取突然袭击的方式，向杭州奔来。
苗傅、刘正彦等人已经在朝廷的安抚下放松了警惕。没想到这个韩世忠能率人突然勤王，完全慌了手脚。
这时，宰相吕颐浩把苗傅、刘正彦等人请到都堂商议对策，希望他们放弃自己的主张，上疏请赵构回朝执政，这样不但可以保全性命，同时也让韩世忠等大将失去进攻的理由。
苗傅、刘正彦等人见自己的士兵都不愿意再打仗了，于是被迫同意了吕颐浩代表孟氏和朱胜非提出的条件。
孟氏知道消息后，如释重负，感慨道：“哀家的心愿实现了！我上对得起列祖列宗，下对得起赵构和群臣，徽宗、钦宗（已经被金兵掠走）也会高兴的。”
公元1129年4月20日，就是苗傅、刘正彦等人发动的宫廷政变第二十六天的时候，孟氏宣布撤帘，还政于高宗赵构。赵构觉得自己无功受禄，谦让了好几次，在孟氏的坚持下，他才继续做皇帝。
此前，韩世忠等人的部队已经进入城区，孤立无援的苗傅、刘正彦等人仓皇出逃。
实事求是地说，孟氏在苗傅、刘正彦等人发起的这次军事政变中，的确有勇有谋。虽然惊心动魄，但在她的周密部署下，圆满地完成了历史赋予她的使命。就这一点，宋朝也不应该忘记这位皇太后。
而从历史的视角看，作为一位经历坎坷的女性，虽然不断受到不公正的待遇，但是孟氏以博大的胸怀，很好地处理了个人利益和国家利益的关系，从而使不断受到金兵进犯，甚至可以用苟延残喘来形容的宋朝，在皇权方面保住了命脉，得到延续。同时，她在维护南宋朝廷的法理、秩序等方面，都做出了杰出的贡献。
从公元1129年到公元1131年，孟氏去世前的这段时间，命运坎坷的孟氏又经历了颠沛流离的生活。因为在南宋时期，金兵每年秋天都要进攻南宋，逼迫南宋朝廷每年都要逃亡，然后议和，进献大批财宝才算了事。
孟氏自己非常节俭，她对于吃穿从不讲究，只是同年轻的时候一样，喜欢每天喝一点儿酒。在礼节方面，孟氏也不过多地讲究。高宗赵构有事找她，她总是尽自己的所能为其出主意。
经历了多灾多难的生活后，赵构非常孝顺孟氏，赵构还非常关心孟氏的生活，在逃亡途中经常给孟氏买些滋补品，但孟氏总是舍不得吃。
绍兴元年（1131）春天，孟氏患上风疹，赵构从早到晚不离左右，并且多方寻医，但孟氏最终仍是撒手人寰。
孟氏就这样离开了人间，她一生的苦难让人难以忘记。