早在康熙二十年九月份，康熙任命施琅担任福建提督的消息传到台湾后，郑氏集团紧张起来了。
他们知道，施琅是个很难对付的水师将领。但是，对清军作战的意图，一时也搞不清楚，所以防守的重点放在哪里，一时左右不定。
可巧这时候，他们破获了两名要员给姚启圣的一封密信，内容大体是：澎湖没有防备，可速派兵前来，一鼓可得。如果攻占澎湖，台湾就空虚了，就可以容易进攻了。
这样，郑氏集团才确定加强澎湖的防守。郑克塽命刘国轩担任澎湖总督，派水陆军两万余人、战船两百余艘守卫澎湖。
施琅接到康熙命其专征台湾的命令，是在二十一年的十月。接到命令后，他仍旧继续练兵，等待南风。
康熙二十三年六月十一日。这天清晨，施琅按老习惯照常骑马出城，登高遥望海面。只见茫茫海平线上渐渐涌出一轮血红的朝阳，把南边一带大团大团的云全镀成紫红色。
海面上，波涛不安地喧腾着，泛着白沫、裹着海藻，一次比一次更有力地撞击礁石，推向沙滩。
“风候！”施琅心情立刻一阵激动，他站在岩石上沉思片刻，猛地一抬腿，匆匆下来，疾驰回城。
姚启圣正和前来劳军的钦差大臣李光地一起下棋，见他进来，急急匆匆地换上朝服，又把宝剑系在了腰间，全都大吃一惊。
李光地赶忙站了起来，问道：“出了什么事？”
施琅已披挂齐整，正系着帽带，脸上激动的红潮已逐渐退去，他平静缓缓地说：“李大人、启圣兄，等了多少年，多少天，总算皇天开眼，南风就要刮起来了，今日立刻渡海作战！”
事情来得太突然，李、姚二人一时都怔住了，姚启圣灼热的目光扫视了施琅一眼，身上忽然一震，脸涨得通红，嘴唇蠕动了一下，却什么也没有说出来。
李光地的面孔一下子变得苍白，跨前一步，急急问道：“这是……真的？”
“真的！”施琅饱经风霜的面孔上，皱纹一动不动，仿佛一个石头人。他接着说：“今天南风一定大起，正是进攻澎湖的好时机！”
李光地事到临头，反而显得有点不安，他踱了两步，想了一下问道：“我已经把这里的情况打了奏折飞报皇上，这两天一定有圣旨，能不能稍等一下？”
施琅咬着牙，说道：“将在外，君命有所不受，此刻就是皇上变卦，我也是箭在弦上不得不发，还等什么？”
姚启圣眉头紧锁，双手按着桌子，盯着庭院中纹丝不动的椰树，思索了好一阵，然后猛地拍了一下桌子，激动地说道：“好，时势造英雄！千古机遇！传令升帐！”
施琅算好时机，一看来南风，率三百余艘战船向澎湖列岛进发。
澎湖是进攻台湾的要地，驻守澎湖的是郑成功手下有名的大将刘国轩。施琅的战船刚刚接近小岛，岛上的大炮就震天地响起来了。
刘国轩集中火力向施琅所在的指挥舰袭来。施琅不顾自己的安危，命自己的战舰冲在最前面。将士们深受鼓舞，个个奋勇向前。
施琅手持一面红旗，指挥舰队排开阵势，向岛上还击。此刻，前锋与敌舰已经接阵，双方都有几只战船燃着了，熊熊的火光中，炮火声、战鼓声、呐喊声、战舰的碰击声音和海浪声混成一片。
施琅的左右两翼攻上了海滩，刘国轩势单力薄，边退边命放火箭。突然，一支冷箭“嗖”地射来，正中施琅的左目。
姚启圣大叫了一声扑了过来。两旁守护的亲兵都惊呆了，施琅一使劲就拔出了带着眼珠的箭，紧紧拿在手中，恶狠狠地喝道：“慌什么！快命令蓝氏兄弟强攻，天时就要变了！”
“施琅兄！”姚启圣的泪水夺眶而出。施琅喘了口气，笑道：“亏你还是有名的姚大胆，不必担心！”说着竟将箭上的眼珠塞进嘴里，一口就吞了下去，咬着牙命令道：“打！打！”说完，亲自擂起战鼓。
蓝氏兄弟是施琅手下的虎将，见主帅如此英勇，更加拼命地冲向敌军。在冬冬的战鼓声中，施琅的军队终于攻上澎湖，刘国轩仓皇地逃走了。
在武装进攻的同时，施琅在姚启圣的配合下，用大船把金丝银币运到前线，对投诚过来的台湾兵发给重奖，然后用小船放他们回去，叫他们鼓动更多的人前来投诚。
康熙接到施琅澎湖大捷的报告后，立即命令把这个胜利消息，传给朝廷内外的各级官员，又特派一名侍郎赴福建，慰问全体官兵。
并传圣旨：“凡是官员都官升一级，士兵全部重赏，死者家属给以优厚的抚恤金，以示鼓励。”