亚纳河位于俄罗斯雅库特自治共和国，由上扬斯克山脉的萨尔坦格河和杜尔加拉赫河汇合而成。河流由南向北流，最后注入拉普捷夫海的扬斯克湾。河流全长872千米，流域面积23．8万平方千米，河口年平均流量为1000立方米/秒。
亚纳河主要支流有：右岸的阿迪恰河、奥利召河、阿贝拉贝特河、萨尔坦格河等；左岸的贝坦塔伊河、巴克河、杜尔加拉赫河等。
阿迪恰河长715千米，流域面积8．98万平方千米。发源于切尔斯基山脉的西部坡地，河水在宽阔的河谷中流淌，主要河水补给是融雪水和雨水。河口处年平均流量为485立方米/秒。主要支流有：左岸的杰尔别克河、涅利格谢河、博鲁拉赫河，右岸的杰拉卡格河、恰尔克河、图奥斯塔赫河。
奥利召河长330千米，流域面积1．61万平方千米。发源于哈达拉尼亚山脉东坡，流向由北向南。河水补给主要是融雪水和雨水。通过奥利召河，可以由亚纳河直达因迪吉尔卡河。
萨尔坦格河长620千米，流域面积1．78万平方千米。该河流发源于上扬斯克山脉北部坡地上的锡斯丘耶列湖，主要是往北沿扬斯克台地流动。河水补给以融雪和雨水为主。在距河口68千米处的年平均流量为47．4立方米/秒。河流在10月初封冻，次年5月底解冻。
贝坦塔伊河长586千米，流域面积有4．02万平方千米。发源于上扬斯克山脉的东部坡地，大部分河段是在其支脉上流过。该河河水补给为融雪水和雨水。主要支流有：右岸的比尔利亚赫河、坚基河，左岸的霍博尔河、阿奇格萨克雷尔河、乌拉汉—萨克雷尔河、库尔加加—苏奥赫河。流域内有2000多个湖泊。
杜尔加拉赫河长507千米，流域面积2．73万平方千米，发源于上扬斯克山脉的北部坡地，上游穿过休尤莱恩—丘约利湖。
亚纳河流域地势为三面环山、向北开口的半圆环。西面有上扬斯克山脉，是东西伯利亚各河与勒拿河流域之间的分水岭；南面是一些高地与谢姆昌山脉；东面是科雷马山脉，山脉间有亚纳与奥伊米亚康两高地，构成了亚纳河流域的大部地区。
亚纳河在其两条源流汇合之后，即在宽阔而较深的河谷中流淌，阿迪恰河汇口以下，河岸远离河流，有些地方河宽增至10千米，河槽中出现许多岛屿和沙洲，河床被分成许多河汊。在穿过库拉尔山脉的北端时，河谷逐渐缩窄，河床中有石滩。亚纳河的下游横穿孔久棱山脉，沿着亚纳—因迪吉尔卡低地流淌，河床蜿蜒曲折，并被分成许多河汊。在注入拉普捷夫海的扬斯克湾时，形成了面积为10200平方千米的三角洲。
亚纳河流域地处东北西伯利亚气候区，大陆性气候特别显著，其特征是夏季温暖，冬季漫长而寒冷。亚纳河流域最冷的月份是1月，1月平均气温是零下45℃左右，年平均气温大约在零下14℃左右。最热的7月平均温度达到18℃—20℃。
亚纳河流域里的年降水量为200毫米—250毫米。冬季很长，全年约有8个月封冻期。
亚纳河流域内约有40000个湖泊。但该流域里的年内径流分配极不均匀。在融雪和下雨的时候，洪水流速大，冲刷力强。河槽很不稳定，沙洲与岛屿常常移动。冰锥对河槽的形成有很大影响。长久不融化的厚冰锥层迫使河流绕过它，另外开辟河槽。
河水补给为雨水和融雪，在亚纳河储雪量不大的山地部分，河流主要靠雨水补给。冰川与冰锥的融化在该流域的补给中也有一定的作用，地下水的补给因有永久冻土层而不大。
夏季高流量靠冰川与冰锥的融化来维持，汛期始于5月底或6月初，汛期持续整个暖季。冬季河流径流很少，甚至完全断流。头年10月至第二年5月的径流在亚纳河的上扬斯克地方占5%，其中3%是在融雪开始时的5月。最热而多降水的月份是6—8月，其径流占全年径流量的90%。
亚纳河的河水流量一年内有急剧的变化。在上扬斯克附近的平均流量为150立方米/秒，距河口381千米处的平均流量为925立方米/秒（河口附近为1000立方米/秒），最大流量相应为：春季2840立方米/秒和12400立方米/秒，夏季2300立方米/秒和13000立方米/秒。个别年份，冬季因河流冻结到底，最小流量等于零。在9月底—10月初封冻，于次年的5月的下半个月和6月的上半个月解冻，在上扬斯克附近每年的冻透期历时70—110天。