阿姆河是中亚最大的河流，发源于阿富汗与克什米尔地区交界处兴都库什山脉北坡海拔约4900米的维略夫斯基冰川，源头名瓦赫集尔河。瓦赫集尔河的下游称瓦罕河。瓦罕河与帕米尔河汇合后叫喷赤河。喷赤河北流后又大转弯，直抵达答尔瓦查山脉的山脚，又折向南流与瓦赫什河相汇后向西北流，进入土库曼斯坦后始称阿姆河。干流继续向西北流经阿富汗、土库曼斯坦、乌兹别克斯坦等国，最后汇入咸海。
阿姆河干流全长1427千米，如果由喷赤河河源算起，则全长为2540千米，流域面积46．5万平方千米。1960年以前，克尔基城附近的年平均径流量为630亿立方米。
阿姆河支流较多，但多集中在上游180千米内，中下游河段的河水一部分用于灌溉，一部分被蒸发，径流逐渐减少。阿姆河主要支流有苏尔哈勃河（即孔杜兹河）、卡菲尔尼干河、苏尔汉河和舍拉巴德河等。
根据水文地理特征，右岸另外两条大支流——泽拉夫尚河与卡什卡达里亚河也应属阿姆河流域，但这两条河的水流均未到达阿姆河，因此，它们又可作为各自独立的河流看待。
喷赤河几乎全程穿流于深山峡谷之中，形成很多石滩与瀑布。河流全长921千米，流域面积11．35万平方千米。在瓦赫什河汇流处以上200千米处，喷赤河的河谷扩展，流速减小。该河在下游分出两条汊流，形成一个50千米长、近15千米宽、多沼泽的乌尔塔土盖伊岛，岛上满覆芦苇丛。喷赤河主要支流来自右岸，如贡特河、巴尔塘河、亚兹古列姆河、万奇河及基泽尔河等。由左岸注入的支流很少，只有科克恰河。
瓦赫什河是组成阿姆河的第二条河流，河长524千米，流域面积3．91万平方千米。是由克泽尔河与牟克河汇合而成。牟克河源自费德钦珂冰川。克泽尔河与牟克河汇流后，称苏尔霍布河，在唯一的左岸大支流鄂毕兴高河注入后，才叫做瓦赫什河。瓦赫什河上游大多穿流在深山峡谷中，最后150千米才流动在满布棉田与土盖的宽阔河谷中。瓦赫什河的河槽分成许多汊流。瓦赫什河总落差835米，多年平均流量645立方米/秒，年径流量202亿立方米，径流主要由融雪和冰川补给，5—9月的径流量占全年径流量的77%。
阿姆河流域位置位于北纬34°30′—43°45′、东经58°15′—75°07′之间。该流域由北至南延伸1230千米，由西向东延伸1470千米。阿姆河流域46．5万平方千米的总面积中有22．68万平方千米是位于帕米尔高原最高的山地部分，山脉平均高度达到了5000米—5500米，个别高峰超过了6000米甚至7000米。
阿姆河河谷在由喷赤、瓦赫什两河汇流处到克尔基城一段呈弧形扩展，河漫滩覆盖茂密的芦苇丛，并有许多湖泊与沼泽。从克尔基城到伊尔吉克峡谷，阿姆河河谷的宽度变化在4千米—25千米之间，河谷的缓斜坡无形中与周围的地形连成一片。在伊尔吉克与秋亚木云峡谷间，河流穿流于主要由砂层与第三纪松脆砂岩组成的基岩中。河谷具有高10米—20米的陡坡。在秋亚木云峡谷以下，阿姆河谷扩展到几十千米，到珠木尔套与塔希峡谷才变窄。
阿姆河所在的中亚细亚位于大陆内部，离大洋很远，其北面的山峦并没有对它起到屏障作用，这些都决定着它的强烈的大陆性气候：夏季干燥而酷热，冬季凛冽寒冷；7月的平均气温26℃—30℃，冬季1月的气温有时会下降到零下30℃或零下30℃以下。该流域的山脉几乎是由东向西延伸，并顺着这个方向逐渐降低。山脉的这种位置使西面的潮湿气团能深入山区。近于饱和的气团与高的横断山脉相遇，引起水分的凝结和高地上的大量降水，而紧邻的平原和山麓降水却很少。山地的年降水量有的地方超过1000毫米甚至达2000毫米，而平原降水量却只有100毫米。
阿姆河的主要补给来自雪水，雨水补给对河流径流的作用不大。地下水补给在该流域内占重要地位，常常超过年径流量的30％。另外，流域的高度对径流的年内分配也有很大的影响。这是因为山中积雪不是同时在全部集水面积内融化，而是在各个高度地带依次融化：首先在低的地带，然后逐步转移到最高地带。阿姆河流域径流的年内分配特征是多峰式的，汛水延续很长，约6个月。流域下游由于季节性积雪融化而引起的春汛开始于3月，延续到6月底。这期间的径流一般占20％—30％左右。在7月或8月，亦即在全年最热的时候，有永久积雪与冰川融化而引起的主要洪峰通过。夏季汛水一直延续到10月，直至冬季平水期来临时。克尔基城附近的最大流量通常发生在7月，最小水流往往在1—2月，偶尔也会在3月。
阿姆河流域的悬移质泥沙含量在中亚细亚河流中均居于前列。阿姆河的年平均含沙量在克尔基城附近大约为3.6千克/立方米，瓦赫什河的含沙量大约为4.24千克/立方米。5月可见到悬移质泥沙含量的最高值，从6月起其数量减少，在11—12月达到最低值。沿河而下，含沙量通常大大增加。阿姆河在克尔基城附近一年内的输沙量2．17亿吨，泥沙顺流而下，沉积在河谷中。阿姆河带到咸海里去的泥沙大约为克尔基城附近输沙量的11％。