马云从摔倒之处爬起来，舔干血迹重新上路了。1997年10月，马云偶然认识了外经贸部的王建国。不久，外经贸部中国国际电子商务中心（EDI）诚邀马云加盟，共创大业。马云考虑再三决定再次北上。1997年年底，马云带走了中国黄页的8个人。后来黄页中还有人陆续北上进京。
1997年，当马云离开中国黄页时，外经贸部对马云说：到北京来吧，来这儿你能干得更好！于是也就在这一年，马云带着自己的创业班子远走北京，加入了当时的外经贸部，继续开发网上贸易站点。就这样，马云在北京租了一个不到20平方米的小房间，没日没夜地干活，给外经贸部做网站，让外经贸部成为了中国第一个上网的部级单位。
马云当时的确做出不小的成绩，所以后来他敢于在任何场合口出狂言：我做阿里巴巴网站不是不能赚钱，而是不急于赚钱！”
外经贸部另成立了一家公司——中国国际电子商务中心（EDI），由马云组建、管理，马云占30%的股份、外经贸部占70%的股份，不过实际上马云一个月就几千元的工资，其他什么也没有。长期以来，马云发现很多事情在政府的编制里很难做，存在着许多说不清的问题。尽管那时，提起马云与外经贸部的合作，人们都说那是“中国的梦之队”，但事实上是怎么一回事连马云自己也说不清楚就在这不清不楚的尴尬境地中，不甘心受制于人的马云天天都在思量着一个问题：下一步该怎么走？马云所面临的无非是两条路：留在北京，或者离开北京。若留在北京，机会倒是有，比如当时的新浪和雅虎都希望马云去加盟，但马云认为北京的网络太浮躁，很难成事；况且马云已经受够了在政府企业里做事时条条框框的束缚、磕绊与畏首畏尾。马云敏感的直觉告诉自己：中国的网络形式已经在开始发生变化，全世界互联网高潮马上就要到来，留在政府里对不起这千载难逢的良机。 在一番内心的痛苦挣扎与拷问之后，马云又一次做出了他人生中颇具里程碑意义的决定：南下杭州。
1999年，在一番内心的痛苦挣扎与拷问之下，马云又一次做出了他人生中颇具里程碑意义的决定：南下，回老家重新创业！
就在做出决定的那一夜，马云约齐了团队的所有人，他觉得有必要跟他们打个招呼。一两年前，马云第二次北上时，带着当年从中国黄页时期就跟着他的8名伙伴一起出来的。现在，他自己要回老家了，觉得应该把他们都安排好。
在马云宣布他要回杭州创业的决定时，几乎所有的人都惊呆了。按常理说，马云简直是在“穷折腾”。在北京干得好好的，而且是为政府部门做事，为什么要再回去过那种苦不堪言的日子呢？
马云理解他们的想法，也知道自己的想法不一定会被他们接受。但他还是诚恳地说：“我给你们三个选择，第一，你们去雅虎，我推荐，雅虎一定会录取你们的，而且工资会很高；第二，去新浪、搜狐，我推荐，工资也会很高；第三，跟我回家，只能分800块钱人民币，你们住的地方离我5分钟以内，你们自己租房子，没办法打出租车，没办法上下班，而且必须在我家里上班。走还是留，你们自己做决定。”
他本来准备3天时间给大伙考虑，但5分钟之后，包括他的夫人和5个患难兄弟在内的团队成员，一致决定“一起回杭州去！”
那一刻，一直坚强的马云流泪了，他感到了一股暖流在身上涌动。也就是那一刻，马云对自己说：“朋友从来没有对不起我，我也永远不会做对不起朋友的事情”。我们回去，从头开始，从零开始，建一个我们这一辈子都不会后悔的公司。
在北京工作的这14个月里，马云从来没带这些人出去玩过。马云决定带团队去长城玩一次。第二天马云和他的团队游览长城。来北京都一年了，大家总是在工作中渡过，从没有痛痛快快地玩一场，长城除了马云陪杨致远去过一次之外，大家都没有去过。走在长城上面，大家的心情特别沉重，没有人能想通为什么自己做了那么多，为公司赢利那么多却一分钱都没有赚到，连在北京立足之地都没有？记不清是谁，他们中的一个人突然号啕大哭，对着长城大声喊：为什么，为什么。
在离开北京的最后一个晚上，马云和这十几个年轻人聚在了北京的一个小酒馆。那天晚上下着很大的雪，众人大碗喝酒，大块吃肉，一起抱头痛哭，最后唱起了“真心英雄”，唱完“真心英雄”就唱老歌，一首接一首，这群走南闯北的汉子们都回避着“离别”这个对他们来说太过沉重的词语。
许多人都不记得那天晚上马云到底说了些什么，但是那个晚上，酒是热的，心是热的，歌是热的。大家就记得唱了一个晚上的《真心英雄》。许多年以后，这首歌伴随着阿里人度过了许多危难的时期，比如说第一次互联网低潮，比如说非典。只要阿里人一听到这首歌，每个人的心头都会浮现许多一幕幕的镜头，那首歌也许代表了阿里巴巴的一种精神。无论是谁，只要是阿里人，在最困难的时候只要一听到这首歌，心中就会立刻充满感动、充满希望。
4.阿里巴巴马云起死回生
“黑暗之中一起摸索，一起喊，我喊叫着往前冲的时候，你们都不会慌了。你们拿着大刀，一直往前冲，十几个人往前冲，有什么好慌的？”
——马云
做中国黄页的成功，和杭州电信的一拍两散，让马云悟出：要让互联网生钱，最重要的是要务实。而14个月的北京之行，让马云学会了判断国家宏观经济发展方向。更重要的是，马云在这个接触互联网最前沿的阵地上，嗅到了中国互联网大潮浪高风急的味道。那一刻对于马云来说，如何能坚持住自己的想法无疑是横亘在面前的最大考验。创业前期的失败让马云承受着难以言说的压力，但从海博翻译社到中国黄页，再到中国外经贸部，经历了大风大浪、坎坎坷坷的马云，在现实面前没有感到茫然而不知所措，相反，马云显得越发沉稳和坚强。
1999年1月15日，马云和他的团队悄然南归。从北京回到杭州，马云成了一位名副其实的“无业游民”。一向自恃颇高的马云显然不会对他的身份抱有丝毫的遗憾，因为此时的马云和他的团队正在酝酿一个更大的梦想。
马云的第一次发现，其实是一件十分有趣的事情。那还是马云一行人离开北京前集体游览长城时的一个偶然发现。马云在长城上看见了许多涂鸦者留下的痕迹，诸如“某某某到此一游”之类。在文物古迹上刻画本是一种陋习，但那时的马云却想：“大概这是中国人特别爱随手写点什么的‘历史传统’吧。”日后马云概括这个发现为，“长城上的这些涂鸦其实就是BBS的早期雏形。”马云的第二次发现，源于1999年2月在新加坡召开的亚洲电子商务大会。由于马云在中国外经贸部做网站已经使他在互联网界小有名气，所以他有幸受到了大会的邀请。之所以说有幸，是因为尽管大会美其名曰亚洲大会，但受邀的与会人员中，真正的黄皮肤黑头发的亚洲人却只有寥寥数人。走进会场，放眼望去，尽是金发碧眼高鼻子的欧美人。据说当时参加大会的欧美人竟占到了80%。当然我们不能因为来了多少老外来判断这场会议规格有多高，但是至少可以证明一点：那时的亚洲电子商务几乎还没有开始起步，不然也不会不惜重金请一批不了解亚洲国情的老外在台上高谈阔论，侃侃而谈。老外们所谈的自然是欧美式的电子商务，他们讲eBay，讲亚马逊，而在台下认真聆听的马云不禁暗暗地思考。
当轮到自己发言的时候，马云没有片刻犹豫，他用流利的英语说道：“亚洲电子商务步入了一个误区。亚洲是亚洲，美国是美国，现在的电子商务全是美国模式，亚洲应该有自己独特的模式。”这已不知是马云第几次语不惊人死不休了，但10岁开始就清楚地知道自己要什么的马云的很多“狂言”，其实都是经过深思熟虑的。“我经常会一个人想很久，我绝不是一个冲动的人。”
但是这一次，就是马云也几乎对自己的发言感到了震惊，但是这种震惊的背后依然是胸有成竹。因为马云思考的结论是：“小企业通过互联网组成独立的世界，这才是互联网真正的革命性所在。”什么是属于亚洲的独特模式？当时在会场谈了一个小时的马云并没有说。马云是一个聪明人，在会场上他提出了问题，却又保留了自己的想法。因为这是马云马上要着手去做的事情，或者说马云马上就要开始他的新事业了。此时的马云决定创办一种中国没有美国也找不到的模式。“互联网是一个高科技行业，人们肯定更相信一个海归的MBA，而不愿意看到一个杭州师范学院出来的老师在那里折腾。”曾有投资人这样说过。但是马云却认为，在自己并不缺乏海外文化滋养的基础上，自己远比“海归”们要幸运。
“大家都在中国做生意，他们还要耗费大量时间去学习中国国情，而我却是一个土生土长的杭州人。”和所有的互联网精英不一样，马云从小没有生活在精英人群当中，他既不像丁磊那样有着国内名校的出身，也没有杨致远的海外留学经历，一直处于草根阶层的他活在普通人当中。也正因为这个原因，使得他的决定和目前所有的电子商务不同——他不做那15%大企业的生意，只做85%中小企业的生意。用马云的话说：“只抓虾米。”很简单，大企业有自己专门的信息渠道，有巨额广告费，小企业什么都没有，它们才是最需要互联网的人。“如果把企业也分成富人穷人，那么互联网就是穷人的世界。因为在互联网上大企业与小企业发布多少PAGE是一个价钱。”马云说，“而我就是要领导穷人起来闹革命。”
1999年2月，杭州市湖畔花园，一个没有任何标志、没有半点张扬、普通得不会有人注意的小区住宅里，马云的阿里巴巴之行“羞答答”地提上了议程。
马云选择杭州的理由非常简单：“由于远离北京、深圳这些IT中心，人力资源相对便宜。”创业初期，一位香港IT高手想加盟阿里巴巴，马云说：“每月500元。”那个人说：“这点钱我连给加拿大的女朋友打电话都不够。”
而对于阿里巴巴，其实更加准确地说，马云要做的事就是提供这样的世界，将全球中小企业的进出口信息汇集起来。
“中小企业好比沙滩上的一颗颗石子，通过互联网可以把这些石子全黏起来，用混凝土黏起来的石子们威力无穷，可以和大石头抗衡。而互联网经济的特色正是以小博大、以快打慢。”
以快打慢的思路其实来自马云小时候的打架心得，自小就瘦弱的身体之所以没有妨碍他在与大块头单挑时获胜，正是靠着这一条原则——以小博大、以快打慢。循着这个思路，时不我待的马云从新加坡刚下飞机到杭州，就立刻召集了团队所有的人，紧锣密鼓地开始了他们的又一次创业历程。
马云在湖畔花园的家中召开了第一次全体会议，并按照惯例对这一“重大事件”进行了全程录像，他坚信这将有极大的历史价值。
在这个资料片里，光线昏暗的画面中，18位创业成员或坐或站，神情肃穆地围着慷慨激昂的马云，马云则站在一张桌子后，快速而疯狂地发表他那激情洋溢的演讲。
马云激动地对创业成员说：“黑暗之中一起摸索，一起喊，我喊叫着往前冲的时候，你们都不会慌了。你们拿着大刀，一直往前冲，十几个人往前冲，有什么好慌的？”
在这个“起事”会议上，“启动资金必须是闲钱，不许向家人朋友借钱，因为失败的可能性极大。我们必须准备好接受‘最倒霉的事情’。但是，即使是泰森把我打倒，只要我不死，我就会跳起来继续战斗”。
马云和他的伙伴把各自口袋里的钱掏出来，筹了50万元本钱。同时，马云约法三章——大家不要想靠资历任高职，“你们只能做个连长、排长，团级以上干部得另请高明”。每每回忆起当初的这段经历，马云的脸上总是不自觉地浮现出一丝张扬的笑意：“那天，我就像一个疯子般地讲话。我当时说，把你们的钱放到桌子上来。最后，我们一共凑了6万美元，那就是我们的第一笔资金。”当时，马云让团队中的人和自己全部没有了退路，那么在他们面前也就只剩下了一条路：不成功便成仁。
在开会的过程中，马云家里的墙壁突然渗水了，他对大家说，我出去找点材料。过了一会儿，他抱了一大卷旧报纸回来，然后大家一起把它们贴在墙上，就这样开始了公司创业的第一天。据说，后来为了保持统一，马云把报纸作为大部分房间的装饰。
一向口才极佳的马云当然也不会放弃在这个历史性的时刻发表他颇具激情的演讲：“我们要办的是一家电子商务公司，我们的目标有三个：第一，我们要建立一家生存102年的公司；第二，我们要建立一家为中国中小企业服务的电子商务公司；第三，我们要建成世界上最大的电子商务公司，要进入全球网站排名前十位。”“鹰立如睡，虎行似病。”手起刀落之间，一朝分娩的阿里巴巴横空出世。
为了实现马云提出的三个目标，在很长一段时间里，团队成员似乎从所有的公共场合中销声匿迹了。当时由于资金有限，他们没有去租写字楼，而是在马云家办公，最多的一次房间里坐了35个人。马云不断鼓动员工，“发令枪一响，你不可能有时间去看对手是怎么跑的，你只有一路狂奔”，又告诫员工“最大的失败是放弃，最大的敌人是自己，最大的对手是时间”。他们每天16～18个小时野兽一般在马云家里疯狂工作。他们日夜不停地设计网页，讨论创意和构思，困了就席地而卧。邻居们常觉得奇怪，这群人早晨六七点离开马云家，下午三四点又来了。付出就有收获。1999年3月，杭州春意盎然，春光无限，马云的阿里巴巴网站正式推出
5.痴心不改的铁心企业家
“我认为互联网就那么两大块业务能赚大钱，一是电子商贸，一是娱乐。我不认为有人会一辈子都只顾玩乐，也不相信网络游戏能够改变世界，我还是最看好电子商贸的前景。”
——马云
从那一天起，马云开始铁下心来做电子商务。不仅是为了做一个网站，更是想做一个世界级的公司，中国最伟大的公司。把创办阿里巴巴前后的所有故事都联系起来以后，我们不得不承认一个道理：时势只是给了英雄生存的土壤，内心的伟大梦想与崇高使命才是成就英雄的最大动因。今天，用“英雄”或者“教父”来称呼马云，或许有违作者一贯坚持的财经写作的中立、客观的立场，但马云的确是配得上这个光荣称号的。
2002年，阿里巴巴推出了诚信通，目的是建立网络的诚信体系。2003年，当所有人都认为阿里巴巴将在B2B领域深度挖掘的时候，它突然创建了淘宝网，正面挑战全球C2C领域的老大eBay。2005年，这一年的夏天，阿里巴巴大手笔收购雅虎中国，在搜索和门户领域插上一脚。2007年，阿里巴巴宣布成立第五家分公司——阿里软件，进入企业商务软件领域。