双孢菇喜欢生长在阴暗、潮湿、温暖的环境中，这些环境条件也非常适于害虫的生长与繁殖，所以生产中受到害虫的侵染也就不足为奇了。双孢菇害虫以培养料、菌丝或子实体为食，并可以加剧病害的传播，一旦大面积暴发，就会严重降低双孢菇的产量和质量。
危害双孢菇的害虫种类很多，发生普遍、危害较重的害虫主要包括昆虫类、螨类、线虫及其他有害动物，它们通过咬食菌丝和子实体，导致菌丝萎缩、死亡，或者使子实体产生缺刻、孔洞、变色、腐烂、死亡等。
昆虫纲害虫是双孢菇生产中危害最严重的害虫，发生较为普遍、为害较重的种类包括俗称为菌蚊、菇蝇、瘿蚊和跳虫的害虫。