蘑菇病毒病又名法国蘑菇病、顶枯病、菇脚渗水病、褐色蘑菇病等，由病毒引起。该病对双孢菇孢子、子实体、菌丝体都能侵害，造成减产，损失15％～95％不等。
病毒病可引起多种不同症状，但共同特征是导致产量严重下降，子实体畸形。性状上表现为菌丝生长性状的改变和子实体形态上的改变。菇床上发生病毒的原因主要有：播种用的菌种本身带有病毒；播种后被病毒感染。
病毒病的防治措施：
（1）严格选用无病毒区的健壮蘑菇制种，以保证菌种不带病毒。对带有病毒的高产优质菌株，可采用连续高温（32℃）培养转管2～3次，转接时挑取菌落最外缘的菌丝，可以达到钝化和脱毒的目的。
（2）培养料进行二次发酵，60℃的热致死温度有助于防治病毒病。
（3）播种前用2％甲醛对菇房及培养料进行彻底消毒，降低病毒感染的机会。
（4）接种后及时用报纸或地膜覆盖，每周向覆盖物上喷洒0.5％的甲醛或其他杀菌剂，防止空气中沉降的带毒孢子萌发及其他杂菌生长，直至覆土为止。取纸之前再最后喷一次，防止孢子掉到料面上。
（5）覆土材料应严格进行消毒处理，消毒后的覆土材料不宜久置。
（6）要早采菇、勤采菇，在双孢菇开伞前采收，防治感病孢子萌发后再次侵染菌床。
（7）生产结束后要及时清除废料，彻底清理菇房，用高压水流冲洗床架和地面，并用5％的甲醛对菇房设施进行彻底消毒，以杀死材料内的菌丝和孢子，杜绝病毒通过床架材料传播。地面撒石灰粉进行碱化，进行通风干燥。