萎蔫病又称猝倒病、枯萎病，引起该病的病原是镰刀菌。菌种受镰刀菌污染后，出现砖红色、淡红色或紫罗兰色斑块，不可再使用。镰刀菌广泛存在于土壤、有机物质或寄生在多种植物寄主上，主要侵染双孢菇菌柄。菌柄感病后髓部萎缩变褐色，使菇体不再长大，最后变成“僵菇”或“萎缩菇”。病原菌可分泌一种毒素，毒死菌丝和小菇蕾，因而上一潮菇感病后，下一潮菇不会生长或小菇蕾长不大就死亡。
该病主要是由覆土带菌引起的，病害的发生与菇房的环境条件密切相关，通风不良或覆土过厚是导致病害发生的主要原因。
萎蔫病的防治措施：
（1）选用新鲜无霉变的培养料，尽可能减少病菌来源。
（2）培养料进行后发酵，利用高温杀灭病菌。
（3）严格消毒覆土。
（4）覆土层不宜过厚，加强菇房通风。
（5）一旦发生该病，喷施70％甲基托布津或50％多菌灵500倍液杀菌。