软腐病又名蛛网病、湿腐病、霜霉病，在双孢菇整个发育阶段都会受到该病菌侵染，但经常小面积发生，很少发生大流行。该病主要发生在菇床的覆土上，往往在11月（秋菇）和3月（春菇）盛发。在覆土过湿及低温、高湿（相对湿度90％以上）情况下易发此病。一般在出菇后期pH值降低后发生。
软腐病的防治措施：
（1）选择合适的覆土并加以暴晒和药剂消毒处理，调节覆土的pH值为7.5左右，并在出菇后期喷施2％石灰水。
（2）合理喷水，加强菇房通风，降低土面和菇房空气的相对湿度。
（3）及时清除菇房和菇房周围的菇根和死菇，保持菇房环境卫生。
（4）覆土表面局部发生时，在感染区喷盐水或用食盐、石灰粉覆盖霉斑，使近处健康菇不致受损害。
（5）菌床染病后，要及时摘除病菇，并加强通风，减少喷水，降低床面湿度。感染严重部位的土层要更换。
（6）覆土后床面喷施50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液、20%甲醛溶液或2000倍施保功溶液对软腐病防治效果在90％以上。