一般认为，发菌或出菇期适当追施一定浓度的营养液，有利于菌丝复壮，提高菌床的产菇能力，对夺取高产、改善品质有重要作用。追肥最好在子实体前期进行，接近采收期不再追肥。追肥只能起到一定的辅助作用，应注意效果，节约成本。追肥还必须掌握好使用的浓度和用量，浓度或用量太小不能发挥增产作用，浓度或用量太大会对双孢菇生长产生负面影响。使用时各种营养液最好交替使用。常用的追肥有以下几种：
（1）菇根汤。用菇脚5～10千克，加水10～15千克，煮沸15分钟，滤汁加水配成5％～10％浓度喷洒覆土层。此液中含有大量氨基酸，可以促进菇蕾生长，安全有效。
（2）培养料浸汁。将晒干发酵过的培养料搓碎，加10倍水煮沸，取滤汁并加1％碳酸钙，作为营养液喷洒可延长菌床出菇时间。
（3）尿素稀释液。用0.1％～0.2％浓度的尿素稀释液，隔2～3天喷于覆土上，喷时料面不可有子实体。此液可使子实体肥厚，但应注意浓度不可过大，避免引起菌丝细胞质反渗透而影响正常生长。
（4）糖水。2％红糖或白糖水喷洒料面，如果是葡萄糖效果更好。使用时气温应在15℃以下，气温超过18℃时严禁使用，否则易引起杂菌感染。
（5）蘑菇健壮剂。蘑菇健壮剂是一种高效复合肥，分1号和2号健壮素两种。1号健壮素可促进菌丝生长，主要喷施在料面和出菇前的覆土层中；2号健壮素可促进子实体的形成，一般在出菇后使用。