双孢菇生产的工艺流程如下：
（1）二次发酵生产双孢菇的工艺流程。在生产中应用二次发酵技术后可明显降低病虫危害，提高双孢菇的产量和质量。该技术适宜在早秋高温阶段栽培双孢菇时采用，其生产工艺流程如下：粪草收集、贮藏→预湿→建堆→翻堆→进料→后发酵→通风降温→铺料接种→发菌管理→覆土→调水→秋菇管理→越冬→春菇管理→清理废料。
（2）一次发酵生产双孢菇的工艺流程。在冬季进行双孢菇栽培时，由于气温偏低，不宜进行二次发酵，同时低温阶段杂菌及害虫活动较低，所以可以采用传统的一次发酵进行栽培，其生产工艺流程如下：粪草收集、贮藏→预湿→建堆→翻堆→进料→通风降温→铺料接种→发菌管理→覆土→调水→出菇管理→清理废料。