易王刘非，是汉武帝的哥哥，平日里骄横跋扈，好勇斗狠。董仲舒走马上任后，对他晓之以礼，进行了许多劝谏，董仲舒因此受到敬重。与董仲舒相处时间长了，易王请教董仲舒：“越王勾践与大夫泄庸、文种、范蠡，图谋攻伐吴国，并来了吴。孔子称殷有三仁，我认为越有三仁。齐桓公有什么事都请教管仲，我因此请教于你”。尽管齐非的态度比较谦恭，其用意却是不言自明。他把董仲舒比作辅助齐桓公称霸诸侯的管仲，也就是希望董仲舒像管仲辅助齐桓公一样，辅助自己，篡夺中央大权。董仲舒深知其意，却回答他说：我知识浅薄、愚钝，不能够很好地回答你的问题。我听说从前鲁君问柳下惠：“我想攻代齐国，怎么样？”柳下惠回管说：“不可以”。回到家中，柳下惠面带忧色地说：“我听说一般不能向仁义之人请教攻代别国之事，今天国君怎么来问我呢？”只是被问到攻伐之事，柳下惠都感到羞愧，更何况设计去攻伐吴国呢？从这点可以看出，越国没有仁义之人。所谓仁义之人，所谓仁义之人，端正道理，不图谋种益，阐明其道，不计较是否成功。所以，孔子的门徒中，连小孩子都以谈沦上霸为羞耻。因为他们先用武力来欺骗，然后谈仁义。如果只是搞此苟且之计，根本不足以在孔子之门中谈论。五霸同其他诸侯比是贤能的，但与三王相比，犹如石头与美玉相比啊！董仲舒酹览群书，通晓古今，他一贯主张“大一统”，他不可能去“助纣为虐”。他的一番言语，说得易王哑口无言，只说了声好，也就作罢。不久，汉武帝废董仲舒为中大夫。
董仲舒治国思想的核心，就是根据《春秋》中灾异的变的化来摔倒导当今阴阳的变化、四季的交替更迭。当初辽东高庙、长陵高园的便殿曾发生火灾，董仲舒在家写篇文章推导出现灾异的原因。草篙刚写完，尚未呈给皇帝，恰好主父偃去见董仲舒，文章被主父偃俞偷看见了，主父偃一贯嫉贤妨能，就偷走了董仲舒的这篇文章，并将它上奏给了皇帝。汉武帝把这篇义章拿给诸儒生看，董仲舒的学生吕步舒不知道是老师写的，也没有认出董仲舒的笔迹，认为这篇义章写得愚昧荒诞。于是，汉武帝免去了董仲舒中大大的官职，判处死刑尚未执行，汉武帝义赦免了他一从此，董仲舒再不敢写文章谈论灾异了。
当初，公刊。弘曾和董仲舒一起帅从胡母生学习春秋公羊学，但是公孙弘没有把心思全部用于学习，学问赶不上董仲舒。公孙弘凭借察言观色丁。阿谀逢迎，获得官位，升迁很快，位至公卿董仲舒为人廉洁正直，对公孙弘的为人十分痛恨。公孙弘深知葡仲舒讨厌他，囚此，时董仲舒恨之入骨，不断寻机陷害董仲舒他上书汉武帝，让董仲舒改任胶的干相。胶西王刘端也是武帝的哥哥，比起易王刘非，更加骄横放纵，多次陷害二千石的官吏董仲舒深知公孙弘的阴毒用心，知道他是想借刀杀人。董仲舒平日里以贤能著称于世，胶西王刘端也有所耳闻，知他是当世大儒，学问高深，治同有道，刘端对董仲舒非常客气，非常敬重，给予他优厚的生活待遇。董仲舒为相两国，总是奉事阶王。他以身作则，为民表率，多次上疏地道义劝谏、匡正骄王，骄王居然能够听进他的话，这样，他的政令能够在国中推行。
董仲舒的两相骄王，两次破害，他深知伴君如伴虎。于是，他决定退休不干了。他以自己上了年纪、身体有病为借口，申请免去胶西王相的职务，汉武帝满足屯他的心愿。
三著书立说的晚年生活
董仲舒离职归家后，闭门深居，潜心研究春秋公羊学学’书立说，再没有出任官职，甚至连家中有多少产件都不去过问。
虽然董仲舒退休回家，但朝廷如里有什么大事，皇帝都要派使者或廷尉张汤到他的家中向他询问。他每次都有高深的见解和贤明的对策，深得皇帝之意。皇帝还下诏太子，跟随董仲舒学习春秋公羊学。从此，掀起厂研究春秋公羊学的高潮，公羊学成为西汉一朝最主要的思想派别。
董仲舒以著书为事，却也不忘关心国计民生，多次因国策民生之事上疏皇帝。元狩三年（前120年），关中一带发生水灾，董仲舒立即上疏武帝，建议关中农民尽快种冬小麦。汉武帝十分重视此事，派大司农到关中一带监督种植冬小麦。第二年，朝廷实行盐铁国有，设官总管天下盐铁，不出铁的郡置小铁官，统属所在县的盐铁事务，凡是敢私铸铁器、煮盐的，剁去脚趾，没收其器物。盐铁收归国有，给大盐铁商人带来了好处，而老百姓没有得到丝毫利益，造成贫富不均。董仲舒看到盐铁专卖的害处，元狩五年（前118年），他再次上疏给汉武帝，要“限民名田，以澹不足，害兼并之路，盐铁皆归于民。”（《汉书·食货志》）
董仲舒晚年的时间多用于研究学问，著有《春秋繁露》一书。可以说，这本书是他一生哲学观点和政治思想的总结。其中谈阴阳、五行、仁义礼智信等消极内容的，占十分六七，讲受命改制、制度以及各家各派思想之长处的，占十分三四。我国现存最早《春秋繁露》的版本，是南宋嘉定四年（1211年）江右计台刻本。现藏于北京图书馆。其校注本很多，最详尽的当数清末人苏舆的《春秋繁露义证》。
太初元年（前104年），董仲舒在家中寿终正寝。据清代刘于义的《陕西通志》说，董仲舒死后葬在长安故城南二十里。汉武帝巡幸芙蓉园，每次路经此地，均下马。所以，又称董仲舒陵墓为下马陵，年代久远误为虾螟陵。
四一代宗师，开儒学正统之先声
董仲舒辛勤忙碌一生，没有高官厚禄。但是，他以天人三策得到了汉武帝的赏识，他的“罢黜百家，独尊儒术”的主张，为汉武帝推崇和推行。至此，自春秋以来，孔孟一生奔波忙碌却未能实现并遭秦朝残暴禁绝的儒家思想，焕发出了生机和活力，成为正统思想，被定为官学，得到大力提倡。从此以后的2000多年的封建社会中，儒学始终居于指导国家与社会管理的官方意识形态的地位。儒家思想焕发出的生机与活力，源于董仲舒对先秦儒家思想的继承和发展，源于董仲舒重新构建的以先秦儒家思想为中心，以天人感应为目的，杂糅阴阳、五行学说精髓的博大精深的新的儒学思想体系。
（一）天人合一、天人感应的神学目的论
天人合一、天人感应是董仲舒哲学思想的基础。他认为，天是有意志、有目的有人格的至高无上的神，是百神之君，万物始祖，主宰人类社会与自然，通过阴阳五行之气的变化来发挥其作用。在董仲舒看来，阴阳二气再分而成木。火、土、金水五行，五行相生相胜，终而复始，循环不止，因而有春、夏、秋、冬四时和东、西、南、北四方，由此产生万物，万物统一于五行，五行统一于阴阳，阴阳统一于天。阴为天的刑罚的表现，阳为天的恩德的表现，五行相生体现了天的恩德，五行相胜体现了天的刑罚。大有目的地创造万物和人类，创造万物是为了养人，通过寒暑四时成熟养育万物，生养万物是“阳”的作用，是天的仁德。而创造人类是为了实现天的意志，天为人世安排了正常的秩序，又用权力来监督这种秩序的正常实现，派一人来统治人世，是天的儿子，称天子，代表天治理人世。如果他治理得好，赢得天的赞赏，天就降祥瑞来褒奖他，比如出现灵芝、麒麟、凤凰等；如果治理得不好，天就降灾异来警告他，令他改过，如不思悔改，天就降怪异来惩罚他。徭役赋税太重，天就出现春凋秋荣；不赏善罚恶，天就冬温夏寒；不敬父兄，天就出现大风；弃义贪财，天就出现冬天多雾，春夏多雹。这就是所谓的“谴告说”。君主的行为与天是密切相通的，具有一种感应的关系。之所以如此，是因为人的一切都是天给予的，人是天有目的创造出来的，人是天的缩影、副本，人副天数。天与人是合一的，人有喜怒哀乐，天亦有“喜怒之气，哀乐之心”；天有四季，人有四肢；天有12月，人有12块大骨节；天有366日，人有366块小骨；天有五行，人有五脏；天有昼夜，人有醒睡；天有冬夏，人有刚柔；天有度数，人有伦理。天和人是一体相连，互相对应的，“天地的标记，阴阳的标记”，在人身上都表现出来。董仲舒的天人合一思想是对儒家子思、孟子和阴阳家邹衍天人合一思想的继承，并有相当大的发展。董仲舒天人感应的神学目的论是其思想的基石，贯穿其思想的始终，他的所有思想观念都由此派生出来。
（二）罢黜百家，独尊儒术的大一统的政治思想