汉章帝元和元年（公元84年），东汉政府又派假司马和恭率领800人来到西域，来增强班超的力量。这时乌孙国同汉朝已恢复了关系，攻打莎车的时机已经成熟。班超便率领汉朝派来的1800人，并集合疏勒、于阗的军队，准备向莎车大举进攻。
莎车王提前获得了消息。莎车虽然有北道强国龟兹作后盾，但乌孙已经同汉朝建立关系，万一乌孙也派兵来援助，事情可就不好办了。最好是能够避免正面冲突，看看有什么办法能牵制班超，使他不能进兵。于是，莎车王便派人带着大量金银珠宝去见疏勒王忠，把这些财宝都送给他，唆使他发动内乱，使班超腹背受敌，并答应他成功之后再给他更多的珠宝。
疏勒王看到这些财宝，眼花缭乱，垂涎三尺。他是个见利忘义的小人，于是疏勒王就接受了财宝，满口答应制造叛乱。当前的情况是，疏勒王忠已率领部众向西南方撤退至乌即城（今新疆乌恰），宣布倒入莎车阵营，同时对疏勒国与班超宣战。于是，班超果断再立疏勒王室府丞“成大”为疏勒王，让他率军前去攻打乌即城。至此，历时半年的疏勒内战爆发。这段期间，班超三面受敌，西边儿疏勒王忠，南边儿莎车王齐黎，东边儿龟兹王尤利多，轮番跟班超对峙，班超以一敌三，也不落下风。但就在这时，北边儿的康居国突然也掺和进来，派兵支援疏勒王忠，这下班超以一敌四，顿时险象环生——不久，姑墨石城被龟兹夺回，鄯善、乌孙等盟国见势不妙，忙脱身而出，来个坐山观虎斗。这下糟糕了，班超面临近十年来最危险时刻，他该怎么办？
疏勒是班超的根据地，是他进攻莎车的大本营。后方不稳定，前方是打不了胜仗的。班超将后队作前队，前队变后队，赶回疏勒去镇压忠的叛乱。忠自知不是班超的对手，便请求康居王支持，康居王派来了精兵援助疏勒，于是便同班超对峙形成对峙的局面。
班超不想在镇压叛乱中损失军队，便对疏勒人民说：“你们的国王是我们汉朝一手扶助起来的。在这个时期，你们国泰民安，生活得很好，可是忠背信弃义，违背了你们的愿望，挑起叛乱，这意味着你们要重新过提心吊胆，朝不保夕的日子，所以我们一定要把忠发动的叛乱平息下去，这样你们才能过舒心的生活。”
班超发动疏勒人民去攻打乌即城，双方相持了足有半年之久。班超想，长此下去并非良策，便决定另寻途径解决问题。他认为忠之所以能坚持那么久，都是因为有了康居的支持，康居要能撤兵，就等于釜底抽薪了。怎么才能劝说康居呢？康居最近和大月氏国联了姻，而大月氏国与汉朝一向友好。大月氏本有五个部落，至西汉中期，贵霜部落吞并其余四部落，建立了强大的佛教帝国，从此表现出旺盛的扩张性，先是向西攻打西亚强国安息（即原波斯帝国），占领高附（今伊朗高原东部），取其为都城，接着向东击灭塞族人（Scythians）之罽宾国（Kasmira，今克什米尔至伊斯兰堡一带），后又南下击破天竺（印度），占领恒河上游地区，终在公元91年（汉和帝永元三年）后维摩伽迪腓斯二世（中国史书称阎膏珍）统治时期达到鼎盛，成为横跨中亚、南亚与西亚的庞大帝国，与东汉、安息、罗马并称世界四大强国。
班超想，若是大月氏王出面劝康居王退兵，那一定能行。于是，班超便派使者带着许多贵重礼物去见大月氏王，希望他能说服康居王退兵。大月氏王答应了汉使的要求，去说服康居王撤回了人马，但康居王没把忠交出来，而是把他带回了康居国。
当初，班超“杀龟联盟”一成立，康居就表现出异乎寻常的热情，成为助班超发兵攻打姑墨的唯一西域外围国家。现在，疏勒接连爆发内乱，康居却忽然倒戈，又成为援助疏勒王忠的唯一西域外围国家。种种迹象表明，康居加入“杀龟联盟”，也许只是他们插足西域事务的一个幌子，康居怀有不可告人之阴谋。甚至有可能康居才是莎车叛变与疏勒内乱的真正幕后黑手。班超一直忙于交好乌孙，却无意间漏掉了康居这个可怕的隐患。
好在，一切都有挽回的余地。还有大月氏强大的贵霜帝国使班超可以利用。康居面对如此强大的邻邦大月氏贵霜帝国，说他们没有危机感那是假的，所以康居才未雨绸缪，先与贵霜和亲，换取后方稳固，然后再想法儿控制疏勒这个国际著名商埠与物资集散地，进而掌控整条丝路，以为争霸中亚的强大资本。
分析到这儿，班超豁然开朗，他的目光又变得无比坚定犀利，于是急遣使者，给大月氏贵霜王送上大批财物，要他帮忙开导一下康居王，叫康居别过分嚣张，干涉疏勒内政。贵霜王最爱中国的锦帛，又觉得不能让康居这一强邻坐大，于是亦遣一使臣，去与康居王言明利害。康居王不敢失和于贵霜，只得宣布退兵，却顺带把疏勒王忠带回康居，以为日后讨价还价的资本。如此，乌即城群龙无首，只得投降。疏勒内乱宣告结束，同时贵霜与康居之间的联盟关系又出现了裂痕。班超此次外交行动，一则平乱，二则离间，轻轻松松一举两得。
住在别人的国家过寄人篱下的流亡生活，哪里有在自己国家里当国王发号施令好呢？三年之后，在汉章帝章和元年（公元87年），忠又向康居王借兵。康居王犹豫不定，但抵不住忠的花言巧语，还是借了军队给他。忠借兵回疏勒，占领了损中。这时忠已对班超恨之入骨，因为在他叛乱后，班超就重新立了一个叫成大的府丞当疏勒王。忠一心想要杀死班超，夺回王位。
忠占领了损中后，一面赶紧通知龟兹王来助威攻打，一面又派人告诉班超，说他已经知错了，希望班超能接受他投降。班超已把忠看透了，知道他这一着是诈降。不过，忠既然自己送上门来，这下正好可以借机除掉这个叛徒。可他表面上不动声色，对下书使者抚慰一番，说他很高兴忠能迷途知返。
班超两方面都作了安排，他一面叫人杀牛宰羊，大摆宴席，说是要对忠的归来表示热烈欢迎。另一方面，他召集起汉军。他说：“忠回来那一天，你们要做好战斗准备。徐司马，你率领咱们的1800人，在四周埋伏好，准备对付忠带回来的军队。”接着他又让自己的36个随从准备在席间对付忠和他的亲信。约定以举杯为令，里外一齐动手，一定要一网打尽。他还嘱咐他的手下一定要装得很热情，对忠一伙人的归来表示欢迎，不要让他们察觉出来，有所顾虑。
忠知道班超待人一向宽厚，从前释放兜题和不久前遣送李邑回国的事，他都是亲眼所见，因此，听使者的回报说班超要欢迎自己回来，忠便信以为真。他不知班超已经将计就计，心里还自鸣得意：班超啊班超，可惜你聪明一世，糊涂一时啊！
忠率领着自己的700轻骑，大摇大摆地回来了，班超命令手下奏起鼓乐，并亲自出来迎接，言谈举止都很热情诚恳，忠对班超的态度深信不疑，仅有的一点戒心也消除了。班超挽着忠的手进了军帐。这时酒席早已摆好，班超携忠与双方主要随从落座。此时在乐曲声中大家举杯欢宴，班超故意对忠畅谈往事，回忆起当初怎样驱逐龟兹人兜题而立忠为王，后来又怎样共同固守孤城。
那叛徒忠听到这里，居然不觉得惭愧，还露出得意神色，似乎他有功于大汉。班超见他死不改悔，便故意兴致勃勃地祝酒说：“为了将来我们还能很好地合作，咱们来干上一杯，如何？”忠以为计谋得逞，也高兴地说：“请！”说罢举起了杯子。从酒宴一开始，那帐外的一千多人就等着举杯这个信号呢。哗啦一下，长剑出鞘的声音响成一片。那帐内的36人将忠和他的随从团团围住，忠的700轻骑也早已被1800名勇士包围在中间。那700轻骑都是忠的死党，见势不妙，便企图垂死挣扎。汉军无奈，只好将这700人就地歼灭。
班超此时也忽然变了脸色，他一手握剑抵住忠的胸口，一手指着他的鼻子，虎目圆睁，盯着目瞪口呆的忠，训斥了他的目光短浅，见利忘义，一番话说得忠无地自容，浑身抖得像风中的树叶。最后，班超揭露了他诈降的奸计，说：“像你这种见利忘义、不知悔改的小人，留着有何用，拉出去斩了！”
班超高举忠的人头，对疏勒军臣及军民大众说：“你们大家看看，这就是叛徒的下场。大汉虽是宽宏大量，可恨他这次不思悔改，反而勾结你们的世仇龟兹，妄想让你们重新当龟兹的奴隶。他已经成了里通外国的奸细，轻饶了他，就会危害国家和民族，我相信你们大家一定同意杀掉这个叛徒和他的死党。现在咱们还是团结一致对付龟兹的入侵吧。”
班超杀了忠，龟兹王还不知情。他率领人马，匆匆忙忙向疏勒赶来，心里还异想天开，以为这下能杀掉班超了。结果突然听到忠已被杀的消息，又见疏勒全国都拥护班超，已经摆好阵势准备打仗。龟兹王就像挨了一闷棍，灰溜溜地又带着人马撤回去了。是乘兴而来，败兴而归。班超本来定下了南破莎车、北击龟兹的部署，由于疏勒王忠的反叛，才被迫改变了计划。如今诛杀了叛逆，稳定了疏勒，班超将要征服南道的最后一个末沟通的国家——莎车。
西域诸城邦由中国、印度、希腊、波斯四大古文明与北亚游牧文化汇流而成，其人种繁杂，风俗迥异，且彼此相距遥远，故离心力甚强，实难形成合力。另外由于昆仑山脉与蒙古高原的阻隔，汉朝势力又很难透入塔里木盆地，而北方草原民族却极易进出，这些都给班超的西域战略造成了极大的困难与阻力。在这种情况下，班超最终认识到，疏勒虽有地控中枢的好处，但同时是四战之地，若还没将外交工作做到完满，便贸然发动战争，恐怕只会使局势更加复杂莫测。还是应先交后战，静观其变，一面加强疏勒与南道诸国的联合与管控，一面收揽人心，蓄势待发，积极备战。面对险恶而多变的西域局面，班超随时摆出进攻的姿态，等待时机的到来。