（1）垫料层组成。猪舍发酵床主要由有机垫料制成，有机垫料的主要成分包括锯末、木屑或切短铡碎的秸秆、土和少量粗盐。锯末或木屑约占垫料总重的90%，其质地松软，可吸收水分多。泥土要求新鲜干净无杂菌。
（2）垫料层厚度。一般猪舍中垫料的总厚度约为50~100厘米，每平方米垫料重约150千克。有条件的可先铺30~40厘米厚的木段作为疏松通气底层，然后铺锯末或木屑；若木屑来源不足，也可先铺30~50厘米厚的玉米秸秆或30厘米厚的稻壳，然后再铺木屑，泥土的用量约占垫料总重的5%~10%，要求使用未施过化肥或农药的干净泥土。垫料中加适量的盐有利于木屑的分解，用量为垫料总重的0.1%~0.3%左右。
（3）混料。将微生物发酵菌种、木屑、泥土按一定比例混合，加入一定量的活性剂、食盐，有条件的还可加入少量的米糠、酒糟等，使水分含量达到60%，以保证功能微生物菌种能够大量繁殖，经一周左右即可开始发酵，垫料可常年不换。饲养几天后，因微生物菌种发酵作用，猪舍内臭味消失，蝇蛆停止繁殖。20~30天后，猪舍床底层也进入自然繁殖状态，中部形成白色的菌丝，温度可达50℃~60℃或更高（表层温度控制在25℃~30℃之间），猪粪发酵后成为饲料或肥料。
（4）活性剂的使用。合理使用活性剂可使发酵床的利用形成良性循环。但其使用与否，视不同的发酵菌种而定，有的发酵菌种因其活性强，一般不需使用活性剂。发酵床经一段时间的使用以后，当微生物活性降低时，将发酵菌种用活性剂稀释至适当的比例，泼洒到发酵床床面，以便提高微生物菌种对排泄物的降解、消化速度。平时若发现猪大便堆积较多，也可再加撒一点已用活性剂稀释后的发酵菌种，促使其加快对排泄物的分化降解，活性剂使用要适合发酵床中微生物的种类，并根据猪舍实际情况使用，无必要时可不用。