发酵床模式并无严格要求，既可因陋就简也可做得精致一些，按具体情况而定。总的来说，发酵床有地上式和地下式。南方地区较湿润，地下水位较高，一般采用地上式发酵床为宜；北方地区较干燥，且地下水位较低，一般采用地下式发酵床为宜。地下式发酵床要求向地面以下深挖90~100厘米，填满有机垫料后将仔猪放入。在地下水位低的地区，也可采用地上式发酵床，地上式发酵床在地面上砌成，要求具有一定的深度，填入制好的有机垫料即可使用。
猪舍最重要的是要求通风采光好。规范的发酵床式猪舍一般要求通风采光良好，呈东西走向，坐北朝南，南北可以敞开，采光充分、通风良好。25平方米的猪圈，可饲养生猪15~20头。猪舍墙高约3米，屋脊高约4.5米，朝南的中部制成具有可自由开闭的窗子，使阳光可以照射到整个猪床三分之一以上的面积，且从早到晚，阳光尽可能照射到整栋猪床的每个角落，有利于利用阳光照射带来的温度或热量积累来滋润微生物的发酵、生长、繁殖。猪舍北侧可建自动给食槽，南侧建自动饮水器，可按对角线方式分布。若采用大棚养猪，效果更佳。因为大棚易通风采光、保温，造价低，小气候容易快速形成，也便于调节，冬天保温性好，可使猪安全越冬；夏天放下遮阳膜，把四周裙膜摇起，又可创造非常好的通风降温环境。