肃宗一生颇有波折：在初生之日，即险遭不测；幼年、少年时代，又耳闻目睹了皇宫内院的纷争与倾轧；成年之后，他眼见大唐帝国由繁荣昌盛转向衰落。在他个人的政治历程中，平静的皇子生活与动荡的太子生涯形成了鲜明的对比；太平之世的皇子与纷乱之世皇帝的身份，也形成了强烈反差。
景云元年（710）八月与杨氏成婚前几天，李隆基刚被册立为太子。不久，杨氏怀孕，生儿育女本来是人之常情，天之大伦。可是由于此时李隆基与太平公主关系紧张，他担心太平公主会借题发挥。李隆基内心焦虑，便让属下秘密弄来一些堕胎药，打算将这一小生命扼杀于母腹之中，但思来想去，最终没有施行。
李亨出生以后，没有能够与生母杨氏生活在一起。因为杨氏仅是太子姬妾，而太子妃则是后来做了玄宗皇后的王氏。在等级森严的宫廷中，太子妃（正妻）的地位要比其他姬妾优越得多。此时的太子妃王氏一直没有生养，杨氏自觉班次在王妃之下，不敢独享为人母的喜悦。王氏便把李亨接到自己身边，对他百倍呵护，极为疼爱，“慈甚所生”。
开元二十六年（738）六月被立为皇太子。这是太子瑛被废以后，玄宗经过斟酌做出的决定。立李亨为皇太子的制书是在开元二十六年（738）六月三日颁布的，举行册礼是在七月二日。韦氏也在七月十二日被册为太子妃。从被推上政治前台的那一刻起，李亨就被显而易见的政治威胁所包围。威胁首先来自宰相李林甫，在开元末年之后的李林甫以及后来的杨国忠等宰相成员成为对太子威胁最大的政治势力。
公元756年七月十二日，李亨在灵武即位，史称肃宗。遥尊玄宗为太上皇，改年号为“至德”。肃宗继位后，便图谋收复两京（西京长安、东京洛阳），宰相房琯请求带兵去收复长安，肃宗平时很重用房琯，同意了他的请求。结果房琯在陈涛遭遇叛军，全军覆没。至德二年（757年）正月，安史叛军内讧，安禄山为其子安庆绪所杀。肃宗任用名将郭子仪、李光弼，借用回纥兵，乘机反攻。先后于至德二年（公元757年）6月、10月收复西京长安、东京洛阳。肃宗曾与回纥兵约定：“克城之日，土地、士庶归唐，金帛、子女皆归回纥。”致使洛阳遭受很大的破坏。
乾元元年（公元758年）九月，唐肃宗命郭子仪，与河东节度使李光弼等九节度使60万军队围攻相州，讨伐安庆绪。参加作战的九节度使中，郭子仪、李光弼战功最多，威信最高，肃宗不愿把军权交给他们，所以不设主帅，只命宦官鱼朝恩为“观军容宣慰使”，统帅大军、总揽全局。安禄山部将史思明率部13万赶来救援安庆绪。于乾元二年（公元759年）三月，与唐军展开激战，鱼朝恩根本不懂兵法，不知用兵，致使唐军大败，鱼朝恩将相州失利的责任推到郭子仪身上，肃宗不明是非，罢免了郭子仪兵权。此时，安史叛军再次发生内乱，史思明杀安庆绪，自称大燕皇帝，并于同年五月，从李光弼手中，夺取了洛阳，史思明占据洛阳不久，就被自己的儿子史朝义所杀。
在朝中，自鱼朝恩之后，肃宗开始信用宦官李辅国、程元振等操纵军政大权，宦官势力日益嚣张。肃宗同时又宠信皇后张良娣，纵容她干预政事。张皇后和李辅国起初连成一片，结为一党。后来，张皇后恨李辅国专权，欲谋立越王李系为嗣君，张皇后、李系与李辅国、程元振开始对立。
公元762年，肃宗患病，接连几个月不能上朝视事。四月，玄宗病死，他悲恸不止，病情加剧。张皇后召见太子，皇后说：“李辅国久掌禁兵，权柄过大，他心中所怕的只有我和你。眼下陛下病危，他正在勾结程元振等人阴谋作乱，必须马上先诛杀他们。”太子流着泪说：“父亲皇病情正重，此事不宜去向他奏告，如果我们自行诛杀李辅国，父亲皇一定震惊，于他贵体不利，我看此事暂缓再说吧。”张皇后送走太子，马上召肃宗次子，越王李系入内宫商议。李系当即命令宦官段恒俊，从太监中挑选了200多名强健者，发给兵器，准备动手。太监狱中有人将此情报告了李辅国。李辅国、程元振带着党徒到凌宵门探听消息，正遇太子要进宫探望父皇。李辅国谎称宫中有变，阻止太子入宫，并命令党徒将太子动持进飞龙殿监视起来，李辅国假传太子的命令，鼓动禁兵入宫将李系、段恒俊等人抓住，投入狱中。张皇后闻变，慌忙逃入肃宗寝宫躲避。李辅国带兵追入寝宫逼张皇后出宫。张皇后不从，哀求肃宗救命。肃宗受此惊吓，一时说不过话来，李辅国乘机将张皇后拖出宫去。肃宗因受惊而病情陡然转重，又无人过问，当天就死于长生殿。