所谓“其阳多玉，其阴多金”，表明当时已对不同矿物的成矿分布规律有了某种认识。彘即野猪，鬣指兽类颈部上的长毛。猾褢是一种穴居冬眠动物，“褢”，古“怀”字，从它的字形来看意思是给鬼穿衣，以示怀念。鬼字本义是戴面具的人，后引申为已故先祖的木乃伊或其灵魂。猾褢的出现预示当地的民众会有更多的劳役或动乱。
羽山·瞿父山·句余山
又东三百五十里，曰羽山，其下多水，其上多雨，无草木，多蝮虫。又东三百七十里，曰瞿父之山，无草木，多金、玉。
又东四百里，曰句余之山，无草木，多金、玉。
羽山多水多雨多蛇类，却没有草木生长，与理不合，或许“无草木”乃“多草木”之误。在古史传说中，羽山又称羽郊、委羽之山，是个常见的地名，《墨子·尚贤中》：“昔者伯鲧，帝之元子，废帝之德庸，既乃刑之于羽之郊，乃热照无有及也，帝亦不爱。”不过，郭璞认为南次二经的羽山并非鲧遇难的地方。或许，凡候鸟换羽的地方，都可称之为羽山。
浮玉山·彘
又东五百里，曰浮玉之山，北望具区，东望诸。有兽焉，其状如虎而牛尾，其音如吠犬，其名曰彘，是食人。苕水出于其阴，北流注于具区，其中多鮆鱼。
野猪是一种非常凶猛的杂食性动物，在古代曾对人类的安全构成严重威胁；此处的彘，似乎是一种皮毛有虎状花纹的野猪。郭璞认为具区即太湖，古又称震泽，据说系陨星撞击而成。如果具区就是太湖，那么南次二经这几座相邻的山，应该在今日太湖以南。
成山·会稽山·夷山·仆勾山·咸阴山
又东五百里，曰成山，四方而三坛，其上多金、玉，其下多青雘。水出焉，而南流注于虖勺，其中多黄金。
又东五百里，曰会稽之山，四方，其上多金、玉，其下多砆石。勺水出焉，而南流注于湨。
又东五百里，曰夷山，无草木，多沙、石。湨水出焉，而南流注于列涂。
又东五百里，曰仆勾之山，其上多金、玉，其下多草木，无鸟兽，无水。
又东五百里，曰咸阴之山，无草木，无水。
成山是一座外观结构非常独特的山，如果我们能够组织成立“山海经地理方位考察队”，或许可以在南方的江西、浙江一带找到它。列涂与诸的字词结构相同，如果诸指远处连绵的山丘，那么列涂可能就是指远处一片一片水中有陆、陆中有水的沼泽湿地。
会稽山是华夏名山之一，相传大禹治水来到此地召开天下诸侯大会，商议治水大计，后人便称这里为会稽。今日浙江绍兴境内的会稽山有大禹陵，据说大禹就葬在这里。值得注意的是，《山海经》记述众帝葬所，唯独没有提及禹帝葬所，似乎表明在《山海经》撰写时代或其资料来源时期，大禹尚在人世。
安徽怀远县境内的涂山，相传也是大禹会诸侯计议治水的地方，当地有禹会村、禹王宫、涂山祠等名胜，苏东坡《濠州涂山》诗云：“川锁支祁水尚混，地埋汪罔骨应存；樵苏已入黄能庙，乌鹊犹朝禹会村。”
洵山
又东四百里，曰洵山，其阳多金，其阴多玉。有兽焉，其状如羊而无口，不可杀也，其名曰。洵水出焉，而南流注于阏之泽，其中多芘蠃。
由于有特殊之处，因此当地人相信它有神性，不可伤害它。芘蠃即紫螺。
虖勺山·区吴山
又东四百里，曰虖勺之山，其上多梓、楠，其下多荆、杞。滂水出焉，而东流注于海。
又东五百里，曰区吴之山，无草木，多沙、石。鹿水出焉，而南流注于滂水。
此处的滂水，可能即浙江境内的富春江，它发源于安徽黄山南麓。
鹿吴山·蛊雕·漆吴山
又东五百里，曰鹿吴之山，上无草木，多金、石。泽更之水出焉，而南流注于滂水。水有兽焉，名曰蛊雕，其状如雕而有角，其音如婴儿之音，是食人。
东五百里，曰漆吴之山，无草木，多博石，无玉。处于东海，望丘山，其光载出载入，是惟日次。
蛊雕是一种食人猛兽，生活在水里，样子却又像食肉飞禽雕，还长着兽角，看来可以称之为三栖动物了。望丘山“其光载出载入，是惟日次”，当指某神人在此观测日出日落的方位和时间，据此来确定一年四季时辰。因此，望丘山所处的东海，应当就是今日我国的东海，具体来说望丘山也就是今日的舟山群岛。
南次二经之神
凡南次二经之首，自柜山至于漆吴之山，凡十七山，七千二百里。其神状皆龙身而鸟首。其祠：毛用一璧瘗，糈用稌。
居住在南次二经区域的人，供奉龙身鸟首之神；对比之下，居住在南次一经区域的人则供奉鸟身龙首之神，两者正好相反。或许这是因为，两地居民的父系图腾和母系图腾恰好相反的缘故，也表明两地居民存在着长期通婚的关系。
天虞山·祷过山·瞿如
南次三经之首，曰天虞之山，其下多水，不可以上。
东五百里，曰祷过之山，其上多金、玉，其下多犀、兕，多象。有鸟焉，其状如，而白首、三足、人面，其名曰瞿如，其鸣自号也。泿水出焉，而南流注于海。其中有虎蛟，其状鱼身而蛇尾，其音如鸳鸯，食者不肿，可以已痔。
天虞山为南次三经之首，按惯例此处经文应当有描述其东南西北各有什么地貌景观的文字，估计原文有缺简或遗失。兕即大犀牛，蛟状似蛇而有四足。
南次三经是《五藏山经》26条山脉里最靠南方的一条山脉，因此这里的泿水，可能即今日北江上游的浈水，它向南流入的大海即今日中国的南海。
丹穴山·凤凰
又东五百里，曰丹穴之山，其上多金、玉。丹水出焉，而南流注于渤海。有鸟焉，其状如鸡，五采而文，名曰凤凰。首文曰德，翼文曰义，背文曰礼，膺文曰仁，腹文曰信。是鸟也，饮食自然，自歌自舞，见则天下安宁。
此处渤海即我国北方的渤海，按地理方位丹穴山应当归属北次三经，由于竹简错乱而误蹿入南次三经之中（《五藏山经》文字载体最初不一定是竹简，但它在流传过程中曾经以竹简为载体，而竹简很容易脱落错位）。
所谓凤凰“首文曰德”云云，当是春秋战国或秦汉时人的注释文字而又被后人误认成了《山海经》正文，这种情况在古代是经常发生的。凤凰是一种比野鸡更大、更漂亮的鸟，十二生肖里的鸡原本应当是凤凰，它是飞禽类的总代表，正如龙是水族类的总代表一样。
发爽山·旄山尾·非山首·阳夹山·灌湘山
又东五百里，曰发爽之山，无草木，多水，多白猿，汎水出焉，而南流注于渤海。
又东四百里，至于旄山之尾，其南有谷，曰育遗，多怪鸟，凯风自是出。
又东四百里，至于非山之首，其上多金、玉，无水，其下多蝮虫。
又东五百里，曰阳夹之山，无草木，多水。
又东五百里，曰灌湘之山，上多木，无草；多怪鸟，无兽。
发爽山的汎水向南流入渤海，此山的原文亦应属于北次三经，由于竹简脱落而蹿入南次三经。一般来说，成卷的竹简虽然易脱落，但每卷都有一定的竹简数，因此错位的竹简很可能是不同卷的竹简被互换了；这就意味着北次三经的某竹简记录的某山，原本应属于南次三经。凯风即南风。
鸡山
又东五百里，曰鸡山，其上多金，其下多丹雘。黑水出焉，而南流注于海。其中有鱄鱼，其状如鲋而彘毛，其音如豚，见则天下大旱。
武夷山脉江西与福建交界处有一座鸡公岽，汀江从这里发源向南流入韩江，再向南经汕头湾流入台湾海峡；此处鸡山即鸡公岽，黑水即汀江。鱄鱼的样子像鲫鱼却长着猪毛，表明它是一种生活在海洋或江河的水生哺乳动物，类似海狮、海豹、海狗，也可能是江猪、江豚。鱄鱼出现预示天下大旱，属于物候学现象，即某种生物的出现或变化与某种气候的来临或变化，两者存在着某种联系。例如，海洋中有一种厄尔尼诺（圣婴）现象，它能够造成气候异常，如果有某种鱼类对“圣婴”特别敏感而提前迁徙，那么人们就可以根据这种鱼的迁徙判断气候将异常。
令丘山·颙
又东四百里，曰令丘之山，无草木，多火。其南有谷焉，曰中谷，条风自是出。有鸟焉，其状如枭，人面四目而有耳，其名曰颙，其鸣自号也，见则天下大旱。
令丘山多火，是一种比较少见的景观，可惜言之不详。自然界的野火，除了火山、雷火，还有自燃现象，煤炭、天然气、沼气都可自燃，磷火（俗称鬼火）亦属自燃现象。条风即东北风。自然界确实有一些鸟类的头部正面与哺乳动物或人的面孔相似，例如猫头鹰、人面鹰。不过也有另外一种可能，即这里的人面四目怪鸟，实际上是由巫师装扮成的，其他人则奋力将这种怪鸟驱赶走，他们相信如此一来“天下大旱”的灾难便可解除。这类巫术仪式，古代非常普遍，例如舞龙求雨、逐旱魃。
仑者山·禺槀山·南禺山
又东三百七十里，曰仑者之山，其上多金玉，其下多青雘。有木焉，其状如构而赤理，其汗如漆，其味如饴，食者不饥，可以释劳，其名曰白，可以血玉。
又东五百八十里，曰禺槀之山，多怪兽，多大蛇。
又东五百八十里，曰南禺之山，其上多金玉，其下多水。有穴焉，水春辄入，夏乃出，冬则闭。佐水出焉，而东南流注于海，有凤凰、鹓雏。
白又名睾苏，它的分泌物富有营养而又美味，并且可以把玉染成红色，与漆树一样都可制作涂料或颜料。在古代颜料是一种使用非常广泛的重要资源，《五藏山经》记述的众多物产，都与制作颜料有关。
闽江上游有富屯溪、建溪、南浦溪、沙溪，它们均发源于武夷山脉，其中富屯溪上游发源于黄岗山和峨嵋峰，南禺山及其佐水当在此一地区。
南次三经之神
凡南次三经之首，自天虞之山以至南禺之山，凡一十四山，六千五百三十里。其神皆龙身而人面。其祠皆一白狗祈，糈用稌。
右南经之山志，大小凡四十山，万六千三百八十里。
居住在南次三经地区的人们，他们供奉的龙身人面之神，可能是人工塑造的神像，或者干脆直接由巫师扮装。在举行祭神仪式时，主要用白狗为祭品，而且还要把白狗的血涂抹在祭地和祭品之上。
《南山经》的最后一段文字，郝懿行认为乃校书者所题，袁珂则认为系古经原有之总结。此外，《山海经》的“经”字，按袁珂解释，当初原本是经历的意思，后来才有了经典的内涵，此言甚是。其实，《山海经》中的“山”字，也不全是指山峰、山脉，而是地貌、地望、地名的通称；“海”字也不全是指海洋、湖泊，而是水泽地名的通称，有时则是大区域的代称，类似我们今天常说的瀚海、沙海、盐海、煤海、灯海、花海、人海，以及海内存知己、海外传佳音，等等。
此处统计的山数和里数，与南次一经、南次二经、南次三经的篇末统计数字的总和略有出入，可能系传抄之误。例如，南次三经只记述了13座山，但篇末却说“凡一十四山”，其中当有缺失或差误。从《南山经》的内容可知，当时的人非常重视自然资源。据徐南洲研究，《五藏山经》记录的矿产可分为12类90余种，其中玉分为20种，石有42种；并记有155处产金之地，它们多数都是金属共生矿（涉及黄金、银、铜、铁、锡、汞等）。据赵璞珊先生研究，《五藏山经》记录有种类繁多的药物，其中矿物类5种，植物类28种，木类23种，兽类16种，鸟类25种，水族类30种，其他4种；这些药物均为单味药，而且也没有说明剂量，充分显示出其年代的古远。