十月初五日，公弟国荃击贼，大破之，俘斩数万。自闰月二十日以后，贼三十馀万围扑营盘，百计攻轰，公弟国荃苦守四十六日，至是大捷，贼乃解围窜江北。十一日，唐公训方启行赴临淮关，袁公甲三回籍。十二日，公驰摺奏水陆官军迭获胜仗，力保芜湖、金柱关要隘，贼舟存留无几，江介肃清，阵亡副将郭明鳌请照提督例议恤，将弁洪得胜、王明元请恤。又摺奏毛有铭一军，在颍州西路迭破捻圩，毁其老巢，仍回驻皖、豫边境。附片奏报金陵扑营之贼解退，芜湖等处，防守稳固。前奏可虑者四端，今三患稍舒，所虑专在宁国一路，若能支持一月，新募之勇渐集，或能力遏凶氛。是日，又具摺奏保鲍超一军迭克青阳、石埭等四城，出力员弁开单请奖。又奏保曾国荃一军迭克太平、芜湖等各城隘出力员弁，开单请奖。附片奏称：保案所开之员，有随后病故者。鲍公超军在宁国府，贼扰湾，断其粮路。公派陆军由繁昌、南陵护陆运以接济之。贼攻旌德县，公咨商左公宗棠，调所部王文瑞一军援旌德。十七日，贼大股攻扑九洲李世忠之营，旋渡江北窜。十八日，张公运兰离营至安庆见公。公令其买舟回籍养病，其所部老湘营，以总兵易开俊、刘松山分领之。朱品隆等军破贼于旌德。十九日，贼解围去。湘军在寿州正阳防守者，时为苗练所杀害。僧王督师河南，奏请抚苗以剿捻。苗沛霖上书僧王，极诋楚军之失。公察苗沛霖有意挑衅，恐其沮坏大局也。又因皖北兵单，贼方北窜，调蒋凝学一军移营而南，毛有铭、萧庆衍等军皆移驻庐州之境，以避苗练，即以防皖境也。二十七日，驰摺奏缕陈金陵官军苦守四十六日，力战解围情形，道员刘连捷等七十三员开单请奖，阵亡副将倪桂等二百七员名开单请恤。附片奏：金陵援贼虽退，伤亡将卒太多。宁国、旌德两城，同时吃紧。自金陵以至徽州，地段太长，贼股太众，皖北十馀城，毫无准备。实恐溃败决裂，尽堕前功。仍请简派大臣会办诸务，稍分臣之责任。又片奏湘勇驻防寿州正阳关，与苗练逼处太近，挑衅构怨，无有已时。刻下皖北正苦无调防之兵，拟撤出蒋凝学一军，并抽拨霍邱防兵，调防庐州、巢县一带，以遂苗练之私，以成僧格林沁急欲灭捻之志。是日，又具摺奏保张运兰、朱品隆、唐义训战守徽州军中出力员弁，开单请奖。附片奏张运兰因病回籍，请旨将易开俊、刘松山二员授总后实缺，以资铃束。又奏请展缓三省查阅营伍之期一摺。贼之窜江北者，攻和州，陷含山县。二十八日，陷巢县。公乃札留新募淮勇之张树声、吴长庆等军暂缓赴沪，分守无为州及庐江县，调霍邱之湘军驻防舒城。公弟国荃派军回守西梁山，寻又派军扎东梁山。广德州贼窜隐绩溪县。是月浙东官军会洋兵收复上虞、嵊县、新冒三城。江忠补授安徽布政使。
十一月初一日，贼陷和州。初二日，唐义训、王文瑞收复绩溪县。初三日，旌德之贼窜扰太平、黟县之境，直趋祁门。初四日，贼围泾县，易开俊引军入城守御，却之。初七日，祁门县失守。初八日，奉上谕：“江苏布政使曾国荃著赏给江绸黄马褂料一件、小卷江绸袍料一件、白玉喜字翎管一枝、白玉柄小刀一把。
曾贞干著加恩以知府用。“钦此。初十日，唐义训、王文瑞收复祁门县城。贼回窜石埭。十二日，公驰奏汇报军情一摺，江北含山、巢县、和州失守，调度防剿，并陈明宁国各军战守情形，绩溪、旌德、太平、黟县贼踪，奏称：秋冬以来，群盗如毛，南北环逼，前奏请多隆阿移师东剿，今则秦人方痛深水火，何敢渎请？
惟请饬贵州提督江忠义统率所部赴皖防剿，大局幸甚。附片奏报祁门失守。又片奏撤回蒋凝学一军分防颍州、霍邱两处，调毛有铭、萧庆衍两军移驻舒城，以防贼上窜。是日，又具摺奏保水师迭克沿江城隘出力员弁，开单请奖。又摺奏浙江省城失守时溃走之副将陈步高等，讯明定拟。十八日，公弟靖毅公贞干卒于军。
是日奉到以知府用之旨。公出城巡视盐河，委弁勇修濠墙一百八十六丈，核定工程。十九日，水师破贼于三汊河。二十日，鲍超闻讣丁忧。公以宁国军情紧急，批令在营穿孝。二十一日，公出城巡视城濠。二十二日，闻靖毅公之卒，公哭之恸，派弁赴金陵护其丧。二十七日，驰奏钦奉谕旨分条复陈一摺：其一，毛有铭、萧庆衍之军由舒城拔营，取道巢湖之南，进攻运漕镇。其一，李世忠军于九洲。
此次贼窜北岸，该提督亦屡接战，有所斩擒，惟贼股太众，未能堵截。其一，曾贞干已于十八日病故。由臣德薄，殃及手足。其芜湖要地，留防兵力尚厚。其一，洋将白齐文奉调赴援金陵。该将迁延不进，且毫无纪律，应由李鸿章严行惩办，其一，查贼酋李秀成踪迹。其一，催李续宜销假回营。凡六条。又奏旌德、泾县解围、绩溪祁门克复一摺。奏保王文瑞、王开琳等五员，阵亡总兵胡太旗、参将刘永胜、游击张仁兴请恤。附片奏宁国一带军务渐稳，鲍超丁母忧，请毋庸开缺，改为署理。又摺奏结金安清、汪耀奎参案。又奏采访忠义第十一案。附片奏定远县练总陈鼎霈等殉难请恤。贼自金陵解退后，其一股复由东坝拖过战船，以图出江。公所派水陆防军，破之于护驾墩，毁贼船二百馀号。鲍公超击贼于马头镇杨柳铺，大破之。是月，左公宗棠克复严州府城，李公鸿章克复常熟县城，多隆阿公奉旨授钦差大臣，接受关防，胜保革职逮问。
十二月初五日，石埭贼窜隐青阳县，朱品隆弃旌德不守，移剿青阳。初九日，靖毅公灵柩过安庆。公出迎，抚棺恸哭，入城受吊。初十日，水师击三汊河贼垒，破之。萧庆衍等会水师克运漕镇。公调蒋凝学一军移驻舒城。十二日，具摺奏遵旨筹派水师将弁兵勇演习轮船火器，奏保总兵蔡国祥堪以统辖，参将盛永清等七员堪以分领。又申明楚军水勇难以出洋，轮船配用楚勇，须坚守前议，但用之于江面。又摺奏贼由九洲分股上犯李世忠一军堵战获胜情形，请敕下山西巡抚，将应解月饷迅解该营，以资接济。阵亡副将程自有、汪德喜、知县胡学诗请恤。
附片奏报各路军情。又片奏调道员隋藏珠回营当差。是日，又具摺奏保李继宜所部成大吉、萧庆衍等军援剿颍州、霍邱出力员弁，开单请奖。又摺奏夏秋以来，厉疫繁兴，将士官吏婴疾而殒命者，殆以万计。其中功绩卓著者九十六员名汇案开单请恤，张运桂、黄庆、伍华瀚、沈宝成、周成南五员功绩尤多，请从祀湖南昭忠祠。附片奏武瀚之父文生武宏鉴，于咸丰四年在宁乡阵亡请恤。十三日，奉到上谕“曾国藩一门忠义，不避艰险，兄弟均在行间，为国宣劳，深为嘉悦。不料曾贞干遽尔病故，览奏曷胜悼惜”等因。钦此。又奉上谕：“曾贞干自赴江南军营，屡著战功，朝廷早欲擢用，因曾国藩再三恳辞，拟俟江宁克复后从优奖励。
兹以力疾督战，积劳病故，悼惜殊深。虽未经曾国藩奏请给恤，而曾贞干系效力疆场战功卓著之员，著即追赠按察使，即照按察使军营立功后病故例议恤，以示优异。“钦此。十六日，公作季弟墓志一篇。二十日，靖毅公灵柩登舟回湘，公行遣奠礼。毛有铭一军进剿巢县芙蓉岭，小挫。宣城县属之金宝圩，为贼所攻陷，杀掠甚惨。其练众及难民之脱出者，公给银米以赈之，编立营伍，安置于芜湖县，凡数千人。二十一日，公弟国荃击贼于谷里村六郎桥，破之。二十二日，萧庆衍击贼于铜城闸，连破之。二十三日，青阳之贼窜回石埭。二十四日，具摺代弟国荃、贞干奏谢天恩。二十五日，朱品隆军收复青阳县城。二十七日，复奏钦奉谕旨并案条陈一摺：其一，寿州撤回湘军以后，苗练尚无据城以叛之迹，正宜推诚相待，无庸派兵戍守，使反侧者无以自安；其一，李世忠骄亢任性，目前无甚格，将来或须示以检制。其一，杨岳斌军守金柱关以防东坝贼船，彭玉麟驻守裕溪囗以防巢湖贼股，战争方急，不能移扎下游江面。其一，洋人用兵，其长处在器械精坚，步武齐整，其短处在囗粮太重。若使官军学习其法，恐未得其长而先图增饷。其一，金陵贼势方强，未易言抚。至其自拔来归，当禁约军士，不得妄加杀戮，以寻向化之路。凡五条。附片奏报水师攻三汊河，陆军克运漕镇，及金陵官军胜仗，皖南各路军情。又奏保湖南东征筹饷局出力官绅开单请奖一摺。附片奏保江西补用道黄冕、湖南署藩司恽世临主持东征饷事，尤为出力，请旨优奖。
是月贼又由东坝拖过战船，以窥芜湖。于是贼船过东坝者，前后三起。
是岁，发逆、捻匪纠合大股迭犯湖北之西北境，官文公调楚军击退，全楚肃清。骆公秉章、刘公蓉调派湘军，大破贼酋石达开于叙州之境。江公忠义剿匪于湖南、广西之境。毛公鸿宾檄调回湘，募楚勇万人以援皖。都统富明阿帮办江北军务，吴公棠署漕运总督。