那一年，以色列人与非利士人打仗，安营在以便以谢；非利士人安营在亚弗。两军交战，以色列军队战败，非利士人在战场上杀了以色列士兵4000人。以色列人撤回营地，长老们聚在一块儿开会，他们说：“摩西和约书亚那会儿，打仗从不离耶和华的约柜。显然，这一仗失利的原因就是未带约柜。我们应该马上派人去把约柜抬来。”
于是，前线打发人回到首都示罗，从那里把坐在两个基路啪天使之上的万军之耶和华的约柜抬来。大祭司以利对这件事非常重视，他派了自己的两个儿子何弗尼和非尼哈押送着前去。
耶和华的约柜抬到了营中后，以色列人齐声欢呼，声音很大，有地动山摇之势。这样非利士人就知道以色列人抬来了约柜，一定是要来决一死战。他们赶忙动员士兵说：“非利士人哪！你们要刚强，要作大丈夫，免得作希伯来人的奴隶，如同他们现在作你们的奴隶一样。”
以色列人与非利士人再度交锋，败得更惨。以色列军队的营地被冲破，战士四散逃去，有3万人阵亡，其中包括来不及逃跑的何弗尼、非尼哈也死在非利士人的乱刀之下。最令以色列人痛心的是，耶和华的约柜被非利士人掠去了。
当天，有一个便雅悯人从阵地上逃跑出来。他衣衫破裂，灰尘满面，来到示罗。他一边跑，一边向街上的人们报告战败的消息。全城人听见这个噩耗，就一阵阵地呼喊起来。
98岁高龄的以利老态龙钟，双目发直，正坐在大殿外的甬道边，忧心如焚地等待战斗的结局。听到全城人的呼喊，他就问：“百姓为什么喧闹呢？”
身边的人也不知道是什么缘故，就说：“说不清楚，会不会是战报到了。”
正说着，那个便雅悯人来到以利跟前，对他说：“我是从阵地上下来的，我是逃回来的。”
以利迫不及待地问：“情况怎样了？”
便雅悯人说：“情况不妙。以色列人在非利士人面前逃跑，死伤甚多；您的儿子何弗尼、非尼哈也阵亡了；神的约柜被掠去了。”
那人一提神的约柜被掠，老以利就吓得从椅子上栽下来，头撞在门楣上，折颈而死。以利就这样结束了他40年的士师生涯。
那一天，以利的儿媳、非尼哈的妻子正在临盆生产。她听到战败的消息，又听说丈夫和公公相继身亡，因惊吓过度难产而死。
以利作以色列士师的时代就这样结束了。
以利死后，撒母耳受命于危难之际，继承了大祭司和士师的职位。撒母耳虽然年轻睿智，也难以挽回已成定局的战争趋势，以色列人仍然节节败退。非利士人长驱直入，占领了以法莲部落的全部领地；铁蹄所至，把以色列的宗教政治中心示罗踏为废墟；示罗神殿也在大火中化为灰烬。他们把在战争中缴获的以色列约柜抬到亚实突，放在大衮神庙里，跟大衷神像放在一起。
第二天清早，亚实突人发现，大衮神像仆倒在耶和华的约柜前，脸俯伏于地，便把它扶起来立在原处。可是到了第三天早晨，人们又发现大衮神像倒在地上，匍伏在约柜跟前，而且头和两只手都在门槛上折断了。与此同时，亚实突地区鼠疫盛行，大人小孩都生了痔疮。
于是，亚实突人去找非利士人的头领，对他们说：“以色列人的约柜不可留在我们这里，因为他们的神耶和华重重地降灾在我们的神大衮神身上。”
非利士人就把约柜运到迦特，没多久，迦特也鼠疫成灾，人人都长了痔疮。迦特人强烈要求把约柜抬走，约柜就被抬往以革伦。
约柜还没有进入以革伦城，以革伦人就拦住抬约柜的队伍，说：“你们不要来害我们，这是以色列人的神的约柜，还是归还给以色列人吧。”
非利士的首领们聚集起来开会，商量如何处置约柜，他们对约柜的神力已经害怕至极，只好决定将约柜给以色列人送回去。他们把约柜放在一辆刚刚造好的新车上，套上2头刚刚下过牛犊的母牛，又把装着非利士5个城市赔罪的礼物的箱子放在旁边。那个箱子里边放着5个金痔疮像，5个金老鼠像。
他们在母牛的屁股上狠抽一鞭，那2头母牛撒开四蹄，径直朝以色列境界走去；尽管它们都处在哺乳期，牛犊还关在身后农户的牛棚里。非利士人这回确信，大灾是耶和华降在他们身上的，是上帝的手打击他们。
两头母牛沿着通往伯示麦（以色列与非利士交界上的小镇）的大道一直往前走，一面走一面叫。伯示麦人正在平原上收割麦子，举目看见约柜，便欢呼起来。他们立即将约柜和箱子抬到一尊大磐石上，把牛车劈碎作为木柴，把牛杀死作为播祭献给耶和华。
没有多久，就有5万人聚集在约柜周围。有70个胆大的人忍不住心头的好奇，擅自打开约柜观看里面的东西，亵渎了神灵，被耶和华当场击杀在众人面前。
就这样，约柜在离开以色列人7个月后，又重新物归原主。
后来，约柜被运到基列耶琳，放在山上亚比拿达的家中，由他的儿子以利亚撒看守。约柜在这里停放了很多年，直到大卫王把约柜迁移到耶路撒冷为止。