1535年这一年很特殊。加尔文在巴塞尔完成了《基督教原理》这部新教信仰的集大成之作，罗耀拉在巴黎写出了《心灵的操练》这本日后耶稣会会士时刻遵守的至高信条。加尔文的大名开始远近皆知，而罗耀拉还只在同学中具有影响，但他们的思想，已然形成深刻的对立。而此时塞尔维特正凭一本《论“三位一体”的谬误》踏上了隐姓埋名的逃亡之路，他选择了与所有人对立。
一年后，罗耀拉和同学们一行11人从巴黎出发，仅凭面包、水和圣歌相伴，徒步穿越法国，翻越阿尔卑斯山，前往威尼斯，打算坐船去巴勒斯坦。不料当时威尼斯正在和土耳其打仗，港口里的船只，没有一艘愿意驶往亚洲。罗耀拉和同学们商议：“我们原地等待一年，如果还是不能前往圣地，就投奔罗马，觐见教皇。”
不出所料，1537年，他们开始沿亚平宁南下，奔罗马而来。教皇保罗三世热情的接待了这些虔诚人士，并资助给他们朝圣的路费，但罗耀拉很快意识到，去东方的理想已不可能实现，于是如数返还了这比钱。教皇劝阻他们不必非要到圣地去实现理想了，天主教会更需要他们留在欧洲践行自己的信仰。于是，罗耀拉和伙伴们开始为教会服务，有的受聘为大学教授，有的从事慈善。罗耀拉选择了一份最具挑战的工作，劝导罗马城中的妓女从良，并建立了一个救助机构“玛莎之家”。
从阿尔比人，到威克利夫，再到马丁.路德，这些呼吁回归早期虔诚信仰的人士，无不将罗马比作罪恶沉沦的巴比伦，而罗耀拉却开始以实际行动改变这里。
很快，军人出生的罗耀拉开始以军事化的手段建立自己的组织，并上书保罗三世，请求批准。一些红衣主教认为罗耀拉的思想过于极端，不赞成给予他们合法地位，但是教皇力排众议，于1540年9月27日颁布谕令，正式批准这个组织的建立，后被命名为“耶稣会”。此时他还不清楚，这个仅十几个人的小团体将成为日后反击新教改革的最有利武器，而这完全取决于罗耀拉的个人意志。
次年，已年逾五旬的伊纳爵.罗耀拉被选举为耶稣会的会长，但是他并没有高高在上，坐享功成名就，而是每天依然从事着刷盘子这样卑微的劳动。耶稣会的宗旨是要重振天主教会，重树罗马教皇的绝对权威，罗耀拉着手起草规章制度，严格的军事化体制是耶稣会的最大特点。新会员加入时，除了要宣誓服从、贞洁和清贫的戒律之外，还要发誓绝对效忠罗马教皇。会内实行严格的等级制度，下级要无条件服从上级，罗耀拉说：
“耶稣会士应把自己的上级视作基督本身。”“永远毫不迟疑，奋不顾身的听从现任和将来的教皇对我们发布的命令。”“服从上级方面，应当像死尸一样可以随意处置，像一根手杖般任上级耍弄，挥舞，像一个蜡球一般可以随意揉搓。”
这些令人愕然的制度，只能从罗耀拉的脑子里产生出来。总会长为终身制，并常驻罗马，对各地会士拥有绝对的管理权。经过罗马教廷的特许，耶稣会会士被允许可以不穿修道服，不过隐修生活，可出入世俗社会、宫廷和政府部门，甚至可以不择手段的从事特务活动，“目的证明手段的正确”是耶稣会的行动口号，这比“为达目的不择手段”的说辞多少显得文雅一些，不过依然可以感觉到一股阴森森的杀气从字里行间渗透出来。
耶稣会从里到外，从思维到行动，无不带有强烈的罗耀拉个人色彩。在悟道经历和信仰坚定上，罗耀拉与方济各何其相似，但是这位西班牙人更具卓越的领导才能，这与他早年的军事生涯密切相关。
第三十二章 目的证明手段的正确（4） “去吧，将世界点燃！”
天主教一向剥夺普通人受教育的权利，甚至阅读《圣经》也属犯罪行为，但是罗耀拉的个人经历促使耶稣会十分重视教育，他们在罗马创办学校，大门上写道：“语法和基督教教义学校，免费。”
他还上书查理五世，阐明教育是匡扶天主教信仰的有力措施：“要对付目前肆虐于德意志的罪恶，最好的办法是求助于大学，以模范的宗教生活与纯正的教义引人向善。这个办法不仅是稳妥的，也是完全必要的，它来自神的启示。”知识渊博是加入耶稣会的重要条件之一，其成员要经过长年的训练，聚集在一起研究《圣经》和其它学问。耶稣会积极拓展自己的关系网，创办学校，建立出版机构，并吸引贵族和富商子弟加入耶稣会，并扶植他们成长为社会中占据重要地位的实力人物。耶稣会还广泛交结欧洲各国宫廷，上流社会，作为君主和上层人士的忏悔神父，随着耶稣会声名鹊起，其总会长开始有“黑衣教皇”之称谓。
早期耶稣会抱有勇于探索的无限乐观主义精神，不久后，法国耶稣会士成为启蒙运动的先锋。罗耀拉帮助欧洲知识界得到自我认同，好比加尔文为西欧商人、政客和社会活动家提供的自我认同。耶稣会士向欧洲知识分子表明，他们可以依循自己的兴趣做有成就的历史学家、天文学家、法学家、数学家、贵族、士兵、政客，而同时又保持圣洁，蒙神悦纳。正是这种被释放出来的热情使耶稣会士以一种对世界的使命感，前往美洲、非洲、和亚洲传教。他忠实的追随者沙勿略，自告奋勇前往东方，力争使印度、中国、日本皈依天主教，他取得了一些成就，但却再也没有回来。
罗耀拉对即将远行的传教士说道：“去吧，将世界点燃！”在他的努力下，在当时的地理知识还十分有限的情况下，耶稣会在已知的世界里设立77个教省，各省会长定期向总会长报告。耶稣会传教士以优秀的人格和一丝不苟的作风赢得了尊重，尤其是在路德宗和加尔文宗信仰影响的地区，信徒们通过耶稣会的努力而重新竖立对天主教会的信心。
到16世纪下半叶，莱茵河流域、巴伐利亚、奥地利、波希米亚、波兰和匈牙利的新教势力在耶稣会的强力反击下，失去了众多信徒。但在英国，面对伊丽莎白稳固的王权，耶稣会传教士一筹莫展，他们只能装扮成商人混入这个由女王领导教会的岛国，并以地下活动鼓励天主教徒坚定对罗马的忠诚，劝说新教徒改宗。但英国的统治者对他们毫不客气，不少传教士受到迫害，甚至为天主教殉道，英国公教依然严密的掌控着这个国家。
1553年，塞尔维特被加尔文烧死在日内瓦的火刑场上，三年后，罗耀拉功成名就，病逝于罗马的宫殿中，1622年，天主教会尊奉其为圣徒。这两位从西班牙北部山区走出来的信仰战士，以不同的结局淹没在宗教改革的大潮中。
耶稣会在天主教会中的实力日渐强大，并在欧洲各天主教国家拥有政治靠山，他们还从事商业活动，掌握了巨大的资本，这使罗马教皇也感受到了危机，18世纪，教皇克莱芒十三、十四世因欲解散耶稣会，遭暗杀。法王亨利四世，美国总统林肯，据传也为耶稣会所谋杀。1814年，教皇庇护七世恢复耶稣会。至今，耶稣会在全世界拥有60所大学，500所学院和8500所小学，此外还拥有1000多种报纸期刊，24个广播电台。