查理五世那著名的“哈布斯堡下巴”差点没掉下来，他震惊了，自己签署的通行证，怎么会带来这么一个不知天高地厚的顽固教士。
但他意识到，烧死一个教士，仅仅是毁灭了他的肉体，而天主教的天下，从来不缺少火刑的威慑。如果路德能够反悔自己的异端立场，应该是一个最为合理的结果。于是皇帝又耐心的给了路德两天的时间，以期待他能够忏悔自己的言行。可是两天过去了，年轻皇帝失去了耐心，他将一些重要的德意志诸侯召集过来，向他们说道：“一个教士要对抗千年以来的基督教传统，肯定是错误的事…..我不会再为路德做什么事了，他可以凭借安全通行证返回，但是我将把他作为声名狼藉的异端加以反对，他以后的安全我无意去保证，我也希望你们能够和我站在同一个立场上。”
大多数选帝侯接受了皇帝的意见，而萨克森的腓特烈三世心里却另有一副算盘。4月26日，路德启程离开沃尔姆斯，利奥十世特别下令尊重安全通行的承诺，但是安全通行证还有10天即将到期，过了期限，谁也无法保证其没有危险。
路德和几位随从骑马穿行在一片森林之中，没有人知道他们能否平安的返回维滕堡。
突然，一队人马拦住去路，不由分说的用斗篷遮住路德的脑袋，推上了另一匹马，就在随从们不知所措之际，这些人带着路德转瞬之间消失在莽莽密林中。这群人马在森林中翻山越岭，辗转数日，最后来到了一座隐藏在森林中的古堡。一个人将路德领到一间密室里，指了指摆在那里的一副盔甲：“脱下你的衣服，穿上这个，从今天开始，你是乔治骑士，必须要把头发和胡须留起来。”
路德现在才知道，原来是腓特烈三世派人“劫持”了自己，而那个在沃尔姆斯大出风头的马丁.路德，已经人间蒸发了。腓特烈不想得罪查理，也不想与利奥撕破脸，当然更不想失去路德，于是想出了这个半路绑架的计策，如果不这样，路德就有可能像胡斯一样，在火刑柱上蒸发了。
“这里是哪啊？”路德推开密室的窗户，眼前尽是一望无际的森林。这里叫做瓦特堡，距离路德的目的地维滕堡，还有150多公里呢。
人们以为路德被秘密处死了，除了腓特烈三世，没有人知道他在何处。路德在瓦特堡蛰伏了近一年时间，像威克利夫一样，这期间他将《圣经》翻译成了德文，这是德国文化史中的重要一页，德文《圣经》使更多的德国人可以直接阅读，不必要经过掌握拉丁文教士的转述。这本《圣经》还真正使德语从口语转变成规范的书面文字，滋养了后世德国文学和文化的繁荣。其实这份翻译的工作并不难，懂希腊文的德国人也不在少数，但是只有马丁.路德第一个这样做了。
腓特烈三世的侠肝义胆，当然有其自己的目的，作为对罗马教皇和帝国皇帝都心存不满的诸侯，腓特烈清楚，路德就是他手中一件锋利的武器。反之，路德也是心知肚明，具备像自己这种思想觉悟和理论水平的教士，如播种撒豆般遍布德意志各地。没有一个合适的政治靠山，自己恐怕早就跟胡斯一样，成为火刑柱上的一块焦状物了。
1522年，马丁.路德返回维滕堡，继续领导宗教改革。路德鼓励教士结婚，因为在《圣经》中找不到这种压抑人类本能的证据，于是萨克森的修道士和修女们纷纷还俗，谈婚论嫁。但是路德却迟迟没有娶妻，他说道：“不是我没有男人的情感，只是因罪恶的罗马教会判我为异端，我每天都准备去死。”
毗邻一个信奉天主教的诸侯领地内，一些修女们恳请路德帮助她们离开修道院。路德找来一位商人，将12桶鲱鱼运往那座修道院，并神不知鬼不觉的将12位修女隐藏腥臭在木桶中，帮助她们来到萨克森。路德许诺为这些修女找到婆家，但是最后一位叫做凯瑟琳的修女却无人问津，路德决定兑现诺言，于是娶她为妻，这一年马丁.路德已经42岁，妻子26岁。两人的感情一直很平稳，并生育了六个儿女。之后，越来越多的德意志教士与修女选择离开修道院，投入婚姻的怀抱。