黄瓜为葫芦科甜瓜属中一年生攀缘性草本植物。
（1）根。黄瓜为浅根型根系，主要根群分布在30厘米的耕作层中，吸收水肥能力较弱，故要求肥沃而湿润的土壤条件。黄瓜根系木栓化较早，再生能力弱，故而育苗中不宜多次移栽，移栽分苗应尽量提早，在子叶期最好。定植时应尽量少伤根系，以采用营养钵、育苗袋等育苗容器为宜。防止伤根过多，缓苗困难，影响成活率。黄瓜的根分为主根、侧根、须根和不定根。不定根发生容易且生长旺盛，故而移苗时可进行深栽，有利于扩大根群。
（2）茎。黄瓜的茎为蔓性，属攀缘植物，栽培中需立支架，以支持其直立生长。一般早熟品种茎较短而且分枝少，以主蔓结瓜为主。中晚熟品种茎较长，分枝多，以侧蔓结瓜为主。茎的粗细、颜色的深浅和刚毛的强度是植株长势强弱和产量高低的标志之一。
（3）叶。幼苗期先出子叶，子叶肥大，两侧对称生长，呈长圆形或椭圆形。子叶贮藏的养分和制造的养分是秧苗早期营养的主要来源。子叶的大小、厚薄、色泽和存留期的长短与环境条件及栽培管理技术有很大关系，是幼苗生长强弱的重要标志。真叶呈五角形，有刺毛，叶缘有缺刻，互生。
（4）花。黄瓜基本上是雌雄同株异花，偶而也有完全花株、雌性株、雄性株等类型。雌、雄花分化的早晚、多少及分布状态，因品种和环境条件不同而异。黄瓜花着生在叶腋，有雌花不经授粉单性结实的特性。
（5）果实、种子。黄瓜的果实为假果，是子房下陷于花托之中，由子房与花托合并形成的。果面平滑或有棱、瘤、刺。果形为筒状至长棒状。食用部分主要是嫩瓜。一般开花后8～18天即达商品成熟期。种子为长椭圆形，扁平，黄白色。一般每个果实有种子100～300粒。种子千粒重23～42克，寿命2～5年。