出菇期的通风管理极为重要，通风不仅增加氧气，而且可将室内的二氧化碳、氨气、硫化氢等有害气体排出，保持室内空气新鲜。如果通风不良，料面二氧化碳浓度过高，不仅会长成畸形菇，而且还会造成环境湿度大，容易出现病害。一般在喷水时，要进行通风换气。
子实体在生长期间，要求的通风量也不一样。幼菇在生长时空气流量要求相对稳定，要保持微弱通风；在出菇高峰期，新陈代谢旺盛，排出的二氧化碳多，更要加强通风换气；当菇体长到直径2厘米时，可少量通风，让棚内积累少量二氧化碳，以加速菇体膨大；当菇体直径达4厘米左右，一直到采收，每天应多通风换气，保持空气新鲜。