滑菇蜡质层是指在代料栽培滑菇的发菌后期，菌盘料面出现的一层光滑、具光泽、有韧性的角质化膜。蜡质层形成的好坏，对产量影响很大。正常的蜡质层有橘黄色和红褐色之分，厚度在0BF.BFQ5～0BF.BFQ8毫米，蜡质层对盘内菌丝起保护作用，既防止水分蒸发，又防止外部害虫和杂菌的侵入。形成良好的蜡质层，是菌丝健壮和高产的重要标志。有的栽培户忽视这个阶段的管理工作，以为只要菌丝长满盘，秋后就会有较好的产量。实践证明，蜡质层形成得不好，菌盘内菌丝对杂菌的抵抗力弱，容易烂盘。
影响蜡质层形成的因素有两个：一是劣质菌种，不按操作规程制备的菌种菌丝弱，一般不易形成蜡质层；二是散射光强度要合适，光线越强，蜡质层越厚，有时厚达1～1BF.BFQ5毫米，这样的蜡质层过多地消耗营养，不利于水分的吸收，往往影响产量。这个时期应适当提高菇房温度，使之达到18℃～22℃，加强通风和透光。一般是将菇房周围的保温帘撤掉，如果在空闲房屋内栽培，应将门窗打开，保持通风，并要给所有菌盘增加散射光，以促进表面菌丝转色，并逐渐形成蜡质层。