鉴别滑菇母种质量的方法有两种：
1直接观察法。对引进的母种用肉眼观察包装是否符合要求，如棉塞有无松动，试管有无破损，棉塞有无杂菌和病虫害侵染，菌丝是否正常、洁白粗壮、均匀一致、有无老化现象。母种瓶内菌丝应粗壮整齐、色白、呈绒毛状。如果瓶底部出现黄水、菌丝萎缩且与瓶壁脱离，说明菌种已经老化，应及时淘汰。
2菌种纯度检验。将购入的滑菇菌种2支瓶在26℃～28℃条件下继续恒温培养7～10天，观察菌种表面是否有其他颜色杂菌出现，是否有拮抗线和白色脓状物等，如有其他颜色和拮抗线出现则说明菌种中含有霉菌，有菌脓说明有细菌，这些症状表明菌种纯度有问题，应找销售单位退换。