果园的土壤管理就是对果园果树株间、行间及树盘的土壤进行合理的科学管理。其管理的具体内容，包括果园的土壤理化性状（如质地、结构等）的改善，土壤培肥，土壤耕作，行间作物的间作，除草剂的使用以及根据土壤诊断结果进行合理施肥（有关施肥技术将在下一章详述）和灌水。不同年龄和不同基础条件的果园土壤管理的具体要求不同。
对于新种植的幼龄荔枝园，首先考虑的是应如何充分利用行间空地，间种一些矮秆的并能增进土壤肥力或对土壤有改良作用的农作物，如豆科绿肥、花生、黄豆、蔬菜以及一些生长快、周期短的果树如番木瓜、菠萝、番荔枝、桃、李等。这不仅能增加土壤肥力和改良土壤结构，还能增加经济收入，不论是小面积还是大面积果园，间种都有实际收益。但行株间忌间种与幼树争光、争营养和妨碍荔枝树正常生长的高秆或攀缘作物如木薯、甘蔗、瓜类等；最好也不要间种结果晚和树龄长的果树，如20世纪80年代中期，广东不少间种柑橘的荔枝园，虽有一定收益但大都不够理想，结果造成荔枝投产迟，产量低。笔者调查发现广东间种番荔枝的荔枝园大都取得了可观的效益。幼龄果园另外几项重要的土壤管理措施主要是松土除草、深翻改土压青和树盘覆盖等。一般年松土除草5～7次，夏、秋高温多湿，杂草生长迅速，表土易板结，松土除草次数宜多，春、冬季杂草生长较缓，耕作次数可少。
为了迅速扩大树盘，必须从定植后第二年起进行深翻改土压青，具体做法是沿原定植坑的外围开环状沟或2～4条长方形改土沟，深50～60厘米，宽度和长度视有机质肥料和劳力条件而定，将枯枝落叶、作物茎秆、草料等分层埋入沟内，粗料在下，细料在上。但对于水位较高的果园，改土工作要注重培土、客土，加厚土层，增施腐熟有机质肥。树盘覆盖是指利用各种不同的有机或无机原料，对树盘的土壤进行地表覆盖。其优点为夏降土温，冬季保暖，减少水分蒸发，抑制杂草丛生，减轻水土流失，增加土壤养分。用于覆盖的原料有：绿肥作物干或群体、各种农作物秸秆、杂草、枯枝落叶、粗沙或煤渣（黏土果园内）、塘河泥（沙土果园内）和塑料薄膜（分白、银灰和黑色）等。有机物覆盖又可分为死体和活体两种。总之，树盘覆盖的方式和原料多种多样，覆盖厚度、时间、时期等可根据需要而定。
对于结果期荔枝树的土壤改良及管理的原则是使整个果园的土壤达到丰产果园的要求。丰产果园的基本特征为：①具有一定厚度的活土层（60厘米）；②土壤疏松，砾石度在20％左右，通气透水性好，不易积水成涝；③土壤有30%的黏粒来保持养分，保水保肥，供水供肥能力强，水分养分供应适宜而且稳定；④土壤有机质含量高（大于15％），养分充足，团粒结构好。
具体措施：①增施有机肥，有机肥的施用应结合深翻改土进行，以局部改良为主，逐渐实现全园改良。荔枝园多为山地和丘陵地，土壤的基础条件较差，改良土壤的任务非常艰巨，据调查广东省大部分荔枝园的有机质含量低于丰产园的要求；②重视土壤耕作，做好中耕除草和培土客土等工作，不少果农反应失管1～2年的荔枝树，产量明显下降，这也说明日常耕作的重要性。管理好的荔枝园每年中耕除草2～3次，第1次在采果前或采果后（7～8月）结合施肥进行，深度宜浅，10～15厘米，以免伤根太多，影响树势，延迟出梢。第2次在秋梢老熟后（10～12月）结合控制冬梢进行，深度宜深，20～25厘米，以达到促进深层土壤熟化，切断部分水平细根的目的。第3次在开花前约一个月进行，只宜浅耕，深度不宜超过10厘米，主要目的是促进新根生长，增强对肥水的吸收。另外，在杂草多的果园宜掌握在5月份大部分杂草已发芽并长至一定高度时全面除草1次，8～10月份视情况再行除草一次。如发现有露根或果园土壤瘦瘠，要培入新土，培土宜在秋冬进行。③做好水土保持和维修工作，这是坡地果园土壤熟化的基础，没有这个基础就谈不上有效地提高土壤保肥保水性能和有机营养的积累等。当前存在的比较普遍的问题是梯台间排水蓄水系统尚不够完善，许多排水沟淤积或忽略，梯埂坍损，果园上坡受水，地面的植被覆盖不良等，这些工作应在土壤管理工作中引起重视。