荔枝性喜温湿，雨量充沛与否是荔枝正常生长和开花结果的重要影响因素之一。“水果水果，没水就没果。”这充分说明水分在果树生产中的重要作用。虽然我国荔枝产区年降雨量在1 500毫米以上，但往往分布不均给荔枝生产带来诸多不利，实践也证明，许多丰产稳产的荔枝园都十分重视水分管理技术，并且有良好的配套设施。我们知道荔枝在不同生育期有不同的水分要求，因此，水分管理特点也因有所不同。
荔枝在营养生长期间需要温暖湿润的气候条件，秋冬季花芽分化期间则需冷凉干燥的天气，从整体来说，我国荔枝主产区基本满足这两个条件。但不同年份之间差异较大，秋梢抽梢期也经常遇到阶段性的干旱影响，造成发梢迟和梢质差，甚至不发梢的现象，严重影响了结果母枝的按要求培养，因此，秋梢期若遇10～15天干旱天气就应灌水，灌水量要保证土壤含水量维持在田间持水量的60％～80％。冬季多雨则会促生冬梢，导致来年成花困难，遇上这样的年份，管理上要作相应的调整，有条件的果园可考虑促发早冬梢并使促其尽快老熟（通过施肥和叶面补肥的办法），争取让早冬梢成为来年的结果母枝；对不具备让早冬梢挂果的果园，则因重视排水疏水，并要及时切断根系，认真做好控制冬梢的工作。据倪耀源观察，在花芽分化时，其芽体必须处于萌动状态，因大旱久旱，土壤干燥和大气湿度低，会抑制枝梢萌动；另外，在花穗轴分化期间，水分对荔枝花性也有一定的影响，一般冬旱的年份往往花量大，雄花多。据有关相关分析表明，荔枝处在1月上旬及下旬的降雨量与雌花比呈密切的正相关，在一定范围内，花穗轴分化期间水分充足，平均每穗总花数和雄花数减少，而雌花数不变或略有增加，则雌性比增加。因此，若遇干旱年份，荔枝进入花芽形态分化时，应适当灌水，以促使芽体萌动和增加雌花比例。
早在1059年，蔡襄在《荔枝谱》中就曾论述“荔枝花春生，簌簌然白色，其实多少，在风雨时不时也。”这说明花期遇雨导致不实或产量低而不稳是自古就有的问题。由于花期雨多或低温阴雨，使柱头黏液受冲刷，影响授粉受精。
荔枝坐果后，果实发育快，历时短，需要适量而均匀的降雨，这时如少雨干旱，会妨碍幼果发育长大，甚至引起大量落果；反之，如雨水过多或阴雨连绵，造成土壤通气不良，根系活动受阻，雨多则光合作用减弱，也会导致大量落果；近成熟期雨水过多则会导致大量烂果（霜疫霉引起），并且加剧某些易裂品种的裂果发生。因此，果实发育期间水分管理的原则是保持土壤水分的均衡供应，雨多注意排涝，干旱及时灌水，也可采用生草覆盖法或割草覆盖树盘来保持土壤湿度；有条件的山地缺水果园建议采用地膜覆盖穴贮肥水技术，在荔枝谢花至第1次生理落果结束期间，结合壮果肥施用进行。
具体做法是整好树盘后，在树冠边缘向内30～40厘米处，视树龄和树盘大小，挖深约40厘米，直径20～30厘米的穴4～8个，然后用稻草和杂草等捆成长约30厘米，直径15～20厘米的草把，用水或尿水浸透后放入穴中，将有机肥与土按2∶1比例，并事先混掺少许磷肥（每穴100克）混匀回填，回填少许土后，再在其上每穴施用尿素和硫酸钾肥各50～100克，随后每穴浇水4～5千克，用土填实，穴顶留一小洼，最后用002～003毫米厚的地膜，以树干为中心进行铺膜，贴于地面，边缘用土封严，并在贮穴洼处膜上穿一孔，便于灌水施肥和透入雨水之用。然后视天气状况、果实生长和土壤水分情况决定施肥和灌水次数。