年羹尧在统领清军平定叛乱的过程中，有许多传奇的故事被后人所称颂，从中可以看出他作为统帅，平时善于学习，上知天文下晓地理，具有丰富的知识，战时则机警过人，思维敏捷，处事果断，不愧为合格的统帅。
过沼泽出奇兵。当年羹尧率大军在青海征讨发动叛乱的蒙古族叛军时，有一次，当清军隐蔽地接近叛军的营地时，却被一片沼泽地挡住了前进的道路。这片沼泽地虽然不很宽，但却又是积水，又是杂草，表面上看不出什么，但杂草下面却掩盖着许多深不见底的泥潭，人和马若踩上去就会立即陷入泥潭中，转瞬就会被潭中的淤泥所吞没。很显然，叛军是利用这道天然防线，阻止清军的突然攻击。得知年羹尧率几万清军前来围剿，他们并不十分惊恐，防守得也很松弛，他们想，有这道天然防线，清军就是有三头六臂也难打过来。
等年羹尧率领前锋部队几千人悄悄来到后，发现了这片沼泽，便传令部队在隐蔽处扎下营盘，自己只带少数侍卫前往沼泽地察看。他一边察看，一边思考着通过的办法，终于想出一条用草束、搭营帐的木板破敌的妙计。
回营后，马上传令：要求全军将士每人准备一块搭营帐的木板或一束干草，准备次日发起进攻。兵将们听到这一命令后都很奇怪，便纷纷议论说：“往常临阵之前，大将军总是要我们磨快刀，擦亮枪，可这次却让带这些东西，真是稀奇！”
第二天凌晨，天还未亮，年羹尧便把人马带到沼泽地边。当将士们面对着这样一片人迹罕至、遍地泥水、杂草丛生的沼泽地时，全都惊呆了。到这时，他们才明白了年大将军命令的含意。许多士兵看看眼前的沼泽地，又看看随身携带的木板和草束，无不由衷地佩服年大将军的远见和奇谋。在年羹尧的指挥下，清军先把草束抛到泥水中，上面再铺上木板，用不多时，便在沼泽地上搭起了一条通路，保证了大队人马顺利通过。
当清军通过沼泽攻入叛军营盘时，刚刚起床的叛军被突然出现在眼前的清军给吓蒙了，他们做梦也没有想到清军大队竟然能顺利通过这片沼泽，还以为是神兵天降，顿时乱作一团。而此时冲入敌阵的清军，却是个个精神抖擞，奋勇争先，左杀右砍，很快就把叛军杀得落花流水，取得了这场战斗的胜利。
辨风察敌。有一次，年羹尧率大军征讨叛乱，行至日落西山，正好来到一片丘陵地。这里丘陵起伏，有草地，有森林，有河流，年羹尧命令大军依山安营下寨，驻扎下来。
半夜时分，年羹尧正在大帐内看兵书，四周出奇地安静，忽然他听到一股疾风从西而来，掠过他的大帐上方，转瞬之间消失了。他吃了一惊，感觉到有什么意外情况将要发生，沉思良久，他预感到有敌情，便立即派人叫来一位精明的参将，让他火速率领轻骑兵300名，驰往西南方向的密林中搜查叛军。这位参将接受命令后，心想：大家都在议论，敌人大军离这里有千里之遥，怎么年大将军却让我带兵到不远处的密林中搜叛军，难道叛军身上长翅膀了？年大将军该不会草木皆兵吧。然而，他深知，年大将军一贯军令如山，必须执行命令，这位参将只好半信半疑地率领着几百名轻骑兵奔向西南方的树林。
经过搜查，果然发现有数百名叛军正集聚在那里，策划着袭击清军大营的阴谋，看到这一切，参将是既吃惊又兴奋，他指挥清军趁他们不备，突然发动袭击，一举歼灭了这股叛军。
当这位参将率军兵凯旋后，以敬佩的心情向年羹尧请教，问他怎么知道叛军会前来劫营的，年羹尧对他说：“半夜时分，突然刮过一阵风，来得急，去得快，那绝不是风，而是群鸟飞翔时双翼振动掀起的风声。在夜里，鸟群应该是留宿在树林中，它们突然飞出，肯定是受到惊吓。根据这一迹象，我才判断叛军有可能藏在西南方的树林中。事实证明，果不其然。”听了这番话，这位参将对年大将军更是由衷佩服。
战场上情况复杂，瞬息万变，年羹尧明察秋毫，见微知著，通过一个细小的情况变化，便透过现象，把握本质，从而做出正确的决策判断，真可谓机智过人。
闻雁鸣破敌军。1723年深秋的一天，年羹尧率军由甘肃前往青海平定叛乱，由于军情紧急，一路急行，到达西宁附近时，天已经完全黑了，他便命令军队安营扎寨，将士们由于连续几天的行军，疲惫不堪，饭后便都入睡了。当夜入三更时，一群大雁带着凄惨的鸣叫声，从营帐上空飞过，年羹尧被这突如其来的雁叫声所惊醒，素来机警过人的他一跃而起，披衣握剑出帐，仔细观看，只见星光映照下的雁群，时隐时现地向东南方飞去。
年羹尧返回帐中，紧锁眉头，来回踱着步子，反复思索着其中的奥妙。今夜天黑无月光，按常理大雁应该群宿水边，倘若无人惊动，是不会夜间飞行的。况且群雁低飞，且鸣声不断，看来大雁的起飞地点距此不会太远，并且很可能是受到了惊吓。此时，年羹尧又联想到白天派出的侦探提供的情报，叛军活动区域距此已不远，而宿营地的前方隐约看到山脉。种种情况联系到一起综合分析后，他脑海中显现出一个清晰的判定，前面百里处可能是群山并且有河水或水泊，是叛军出入必经之地，估计是叛军想趁我远道而来，人地生疏，疲惫不堪，疏于防备，前来劫寨。刚才大雁悲鸣，可能是叛军夜间涉水而惊动了雁群的缘故。他还料定，叛军可能是骑马而来，估计四更后即可到达营寨。于是，他当即定下了夜间设伏，一举歼灭这股偷营劫寨的叛军的决心。
想到这里，处事果断的年羹尧来不及召集众部将具体商讨，便整装出帐，亲自指挥士兵分四路，在离营寨十里外设伏。年羹尧对众将士说：“四更时分，叛军将前来劫我营寨，大家设伏待敌，要沉着果敢，听命令，奋勇杀敌，誓灭乱军，功高者重赏。”这道军令，使众将士感到突然和困惑，然而大家都知道年大将军素来用兵如神，这次半夜突然命令大家设伏歼敌，虽然不明白其中的缘由，但还是遵令四面设伏，丝毫没有怠慢。
不到四更时分，诸将率领各路兵马便按照命令设下埋伏。将士们刀箭在手，火器待发，虎视眈眈，专等叛军到来。不多时，只见远处有三路骑兵，黑压压地朝着清军营地急驰而来。
将士们见此情景，无不佩服大将军年羹尧料敌如神。待叛军进入伏击圈后，清军伏兵骤然而起，喊杀声震天，叛军们被这突如其来的袭击惊呆了，没想到清军早有防备，随即个个惊慌失措，队伍如同马蜂巢被人捅了一样，立时大乱，清军官兵一拥而上，弓箭响，刀光闪，枪炮鸣，不一会儿，叛军们便被杀得人仰马翻，死伤无数，未死者只得掉转马头，大败而逃，天亮时，将士们凯旋。
当日，年羹尧传令全军将士，清理缴获的军马兵器，休整三天，并赐美酒佳肴慰劳大家，营寨内一片欢腾。众将领共同举杯，向年大将军祝贺。席间，有将领问他是如何知道有叛军来袭的。年羹尧说：“孙武子也在《行军篇》中讲过：鸟起者，伏也；兽骇者，覆也。意思是说，鸟雀惊起的地方，可能有敌人的伏兵；野兽惊骇奔跑，可能是敌军大举偷袭而来。望各位将领用心研讨，努力施行，每次征战必有长进，长此以往，不愁不能用兵如神。”
诸位将领听完此言，无不点头称是。三天后，年羹尧继续率军西进。经数次交战，在不到一年的时间内，即平定了十几万叛军，大获全胜。
年羹尧在率军征战中，一方面调兵遣将，指挥作战；另一方面不断学习古人的兵法战策，在实战中灵活运用，总结作战，写下了不少带兵打仗的经验和读书心得体会，整理编成了《治平胜算全书》《年将军兵法》等。其中《治平胜算全书》对战场选择、治军、兵器使用、城寨攻守、火攻水战等，均有所论述。书中关于治军、作战的论述，尤其精彩。书中特别提到军队的军容、军纪、军威、士气、号令等的整治与训练。他认为，平时对军队训练严格，战时才能指挥自如。无战事时，军队战斗力的保持和提高，在于根据未来作战需要选择训练内容，刻苦训练；战时则主要是通过鼓舞将士们的士气，提高军队的杀敌能力。出兵之前应严明军纪，坚定将士必胜的信心。由于年羹尧多年在边疆平乱，所以他特别强调战前充分准备，做到胜算在胸，作战中间，根据战场情况，趋利避害，调查土俗，以己之长击敌之短。此外，书中对攻守城战法，夜战、水战、火战原则以及火器、地雷的配备和使用也都有所论述。该书是理论与实战经验结合的一部有价值的兵书。
年羹尧作为封建统治阶级的忠实护卫者，为清王朝的统一和稳定，竭尽全力，东征西战，表现出非凡的军事才能，功绩是值得肯定的。