自从信长从长岛撤兵后，横山城的藤吉郎便转战于江州各地。暴乱的火苗处理起来相当棘手。灭了这里，那里又会燃烧起来。奔向那边，后方又会再次燃起。就连英勇的信长，亲身讨伐长岛，了解当地的实际情况之后，也立即引兵而去。他感叹道：“攻打长岛实乃愚蠢之举。就像没有找到真正的火源，却朝着远处映出火光的墙上浇水一般。”此后，对于各地的暴乱，他不再采用逐一剿灭的救火型打法了。
藤吉郎也收到了同样的命令，他观察信长的心思，想：“主公果然贤明，他是想让我在这个夏天好好休息，放松一下吧。”
他立即返回横山城，犒劳将士，在江北的山城里度过了一个轻松凉爽的夏天。
然而，也有士兵认为：武士的休养，要比上战场还辛苦。每天，不能停止训练。休养的时间大约持续了一百天。到了九月，出阵命令来了。山城的城门被打开。士兵们走下横山，来到湖岸边，但并不知道战场在哪里。
湖畔停着三艘大船。战马和士兵都噔噔地走了上去，士兵们这才明白这次的战场不在石山而在比睿山。
兵船都带着一种新造的木头的清香。这些是今年正月以来，丹羽长秀负责造出来的船只。
渡过秋天的大湖，来到对岸的坂本。信长以下的佐佐、柴田、佐久间、明智、丹羽等各大将已经先行抵达了。织田军近逼比睿山的山麓。
“什么时候来的？”就连己方的士兵也对他们迅速的行动惊奇不已。去年冬天，信长解开这里的包围，向岐阜城撤军时，命令丹羽五郎左卫门长秀准备好大船，要求随时可以横渡大湖。众人将当时的事情和现在的结果联系起来，才明白这是信长的深谋远虑。
同时想起来的，还有下令停止进攻长岛时，信长所说的话。信长看着各处的暴乱和骚动的火苗，他一定认为这些只是映在墙上的火光而已，而真正的祸根就在这比睿山上。
今日信长再次大举出兵，试图夺下此山。他的眉毛里露出一种前所未有的决绝和勇猛。不知是不是这个原因，他的声音也显得特别激昂，远远地传到营外，听上去像是在战场上大声激励将士一样。
“什么？你们说放火烧山可能会烧掉山上的寺院，所以不想采用火计？一派胡言！战斗是什么？我又为何而战？你们都是统领一方的将军，作战多年，居然连这都没弄清楚！”
里面传来信长的声音。信长所坐的折椅旁，围着佐久间信盛、武井夕庵、明智十兵卫光秀等骁将，众人都低着头。看上去极像是儿子们向父母提意见的场面。虽然是主公，但说得未免太过分。佐久间信盛、武井夕庵和明智十兵卫光秀这样想着，都愤愤地抬起了头，直视着信长的眼睛。为何而战？正因为想到这些，正因为感到担忧，他们才会冒犯君颜，提出劝谏的。
“主公所言极是。我等并非不知道这些常识，然而，要将数百年来庇佑国家的圣地比睿山付之一炬的粗暴命令，我等为臣之人，或者说正因为是为臣之人，才无法遵从您的旨意啊！”信盛的眉宇之间可以看出决死的气概。如果他不是做好了从容赴死的准备，在信长面前应该不会说出这番话来。
平日里，这位主公就不易接受直言劝谏，但今天的模样，却宛如斩魔利剑或者是怒火烈焰一般，根本无法说动。
“住嘴，住嘴！”信长直接制止了准备向他进谏的夕庵和光秀等人。“各国的僧人们误传教化之道，煽动民众，聚敛财富，储积兵器，走出寺门便妖言惑众，扰乱朝纲，利用宗教势力获取私权……种种无法忍受的丑态，以及四处爆发的暴乱，你们平时是如何痛骂的？”
“这些我们也实在是无法坐视，对于清除这些弊害，也毫无异议，但要改革这些得到众人信仰，并且具有特殊职能的宗教团体，并非一朝一夕之事。”
“这些谁都明白。八百年来，正因为有这些常识，所以虽然早就有人慨叹佛家的腐败堕落，但却无人能将其改革一新。就连白河法皇也曾说过：‘不遂朕心者，唯双六骰子与贺茂川之河水。’史书上记载：山上的法师们，抬着日吉神轿来的时候，就连朝廷的威严也暗淡无光了。源平骚乱，以及后来的乱世中，这座山有哪点尽到了庇佑国家的职责？谈何为民众带来了心灵的慰藉？”
信长说完，突然将右手使劲横着挥了一下，接着说道：“就像现在的社会一样，数百年来，无论国家遇到什么样的大难，他们都只知道拼命维护自己的特权。利用愚民献上来的财富，建造着如同城池一样的石墙和山门，里面积聚着枪支弹药，而且平日的行为更是骄奢淫逸，所作所为令人不齿。他们岂止荒废了法灯修学，简直可以说是破戒乱行的末代景象了。焚毁这样的东西，有何可惜？你们作色进谏，反倒让我不解。休要阻拦，我信长定要说到做到！”“主公所言，句句在理，但我等三人定要劝阻大人。死也不会起身！”
信盛、夕庵和光秀三人同时俯身围住主公。比睿山的门派为天台宗，石山的门派为净土真宗，两者虽派别不同，但都同为佛教徒。在教义上，他们互相称对方为其他门派，但在对抗信长这点上，达成了完全的一致，态度完全相同。
他们联合浅井、朝仓，利用将军家为各地残党提供便利，向越后及甲斐等地派遣密使，此外还以信长的领地为中心，四处策划暴乱，意图让信长疲于奔命。这一切都是住在灵山大堂的僧人们的策略。
这个特殊的世界，被认为是不可抗拒的力量。三位将军也深知，如果不清扫法城，织田军的行动将无法自由，信长的理想也无法实现。然而，信长抵达这里后，便下令：“包围全山，山五二十一社及山上的中堂、寺庙堂塔等，一切房屋、经书及佛像，一律烧毁！”
他的话本来已经十分过激，而且说到火攻的时候，他还补充说道：“所有僧人，无论其人如何，不分高僧与仆人，凡是僧人打扮的，不可放过一人。即使是儿童和女人也不得饶恕。俗人打扮的，藏在山中，见到火光而逃出的人，视为敌人亦无妨。所有人等，一概杀光，要将这座山烧得片甲不存！”
便是罗刹，也做不到如此残忍之举。接到命令的众将都战栗不已。“主公是不是疯了？”听到武井夕庵在嘟囔，佐久间信盛和明智光秀，以及其余将领也表示反对，但只有三人走上前去劝谏。他们对其他将领说：“我等如果冒犯主公，最终切腹自尽，你们也要一个个地死在主公面前，绝不能让他实行这鲁莽至极的计划。”
攻打比睿山，占领比睿山都是非常正常的，但放火烧山，而且还进行这样的杀戮，根本没有必要。如果执意采取如此暴举，天下人心必然远离信长。
遍布各地的反信长阵营，肯定会抓住各种机会来利用这一事件，诋毁信长。最终，信长将承受几百年来人人避之唯恐不及的恶名。
代表众将的三人说道：“我们不参加误主的战争。”当然，为了传达自己的意见，他们声泪俱下地表明真心，但信长心意已决，对于三人缕缕千言，没有表现出一点重新考虑的意思，甚至可以说他坚定的意志变得更加不可动摇了。
“退下，休要再提此事，我不想再听了。你们如果不接受命令，那我就命其他人去。其他将士也不从的话，我信长一人也要办到。此事必须完成！”“只为了攻下这一座山，为何要做出如此暴虐的举动呢？臣以为兵不血刃，不战而屈人之兵，才是真正的兵家，才是真正的兵法。”“不要再举这些看似机巧的常识！它是生长了八百年的毒草，如果不连根一起烧掉，又会冒出新芽……你们说这只是一座山，但我信长并非为这一座山而勃然大怒，烧掉这座山，便可拯救其他山上的寺庙。杀光这一山的僧俗，各国的反对者就会醒悟过来，从而获救。眼前的惨叫，在我看来什么也算不上。除了我信长，还有谁能做到这一步？上天让我信长来到人世，就是为了让我完成今天的使命。”
信长的英才和伟略，他所有的伟大之处，三名将领比任何人都清楚，但现在信长自己说出“除了我信长，还有谁能做到这一步”这种话，让三名将领觉得很是悲伤，他们感觉信长已经中邪了。
武井夕庵也随着信盛，伏在主公的折椅边，说道：“无论您如何说，我等为臣之人，也只能加以劝助。将桓武天皇时代起，传教以来的灵地付之一炬，这也……”
“多嘴！你还不闭嘴吗？信长是奉桓武天皇的勅谕才烧山的。信长心中带着传教大师的大慈大悲向你们下达杀戮的命令，你们不明白吗？”
“不明白！”“不明白就一边去，不要妨碍我！”“除非意见统一，否则我们将一直进谏。”“顽固不化的家伙！站起来！”
“我为何要站起来？与其活着看到大人的狂态，任主家自取灭亡，不如以死相阻。从古至今，以入道清盛为首，众多的例子足以说明，烧毁佛舍灵阁，杀戮僧人之人，是没有得到好下场的。”
“清盛所为是出于一己之怒，只是为了保护自己一族人，而我信长则不同。我不是为了在世上实现缥缈虚幻的美梦而放火杀人。信长不为自己一人而战。我的战斗，都是为了破除各种旧弊，并让人们创建新的世界。不论是神是人，还是世间，一切都为自己所承担的使命而战。你们气度太小，眼界狭窄，你们的哀叹，不过是小人的悲伤。你们所说的利害，并没有跳出信长一人的圈子。比睿山之流，即使是化为灰烬，在无边的国土和无数民众的未来面前，算得了什么呢？”
“您虽然有此大志，但民心所见，却是恶魔所为。常常是小爱之仁得到民众拥戴，但过于严厉和苛刻，却往往不得人心，即使是出于我主的大爱。”“如此患得患失，在当今之时，能成何事？古代的英雄们，都畏惧一时的人心，才贻祸至今，但我信长定要斩草除根。既然要做，便放手去做。如若不然，我出兵中原也就没有意义了。”怒涛终有平息的片刻。信长的声音也变得稍稍平静了一些。也许是三名将领几乎没有话再进行抗辩，只是低头不语的缘故。
藤吉郎恰好在那天中午时分，渡湖前来此处。他准备来中军寒暄一番，见此情景，便一直站在外面，这时他便从军帐的开口处探出头，向里面问道：
“现在方面吗？在下木下藤吉郎……可以进来吗？”
见到藤吉郎，怒气冲冲的信长也顿时冷静下来，而三名以死劝谏的将领，如同获救一般，脸色缓和了起来。
“船刚刚到，湖上的秋景别有特色，竹生岛等处的树叶已经变红了，完全不是奔赴战场的心情。我还在船上写了首拙劣的和歌……等战争结束了，我就给各位展示一下吧。”进来之后，藤吉郎便自顾自地聊了起来，他的脸上完全没有严肃的感觉，也不见一丝担忧的神情。
“……各位是怎么了？”藤吉郎吃了一惊，看着一言不发的君臣们，只有自己一人说道，“哈哈，我刚才在军帐外听到了，原来大家是为此事沉默啊。臣下为了主君，以死进谏，而主君也不是那种虽然明白臣下的衷肠，却仍要执意实现自己的想法、即使处死手下也在所不惜的暴君……确实是让人为难啊，哪一方都不能说是对，哪一方都不能说是错啊。”
信长猛地转过头说道：“藤吉郎，你来的正是时候，你既然听到大致内容了，那么应该也知道我的想法以及这三位所说的了吧？”
“这个我明白。”“你是否愿意接受我的命令，还是说你也认为信长的命令是错误的？”
“我不认为错，我愿意听从主公差遣，不过请稍等一下。您所下的命令，本来应该是我藤吉郎发函向大人所献之计，主公的决断应该是来自在下所荐吧？”