2012年4月13日，“3Q大战”已过去一年多，就在人们逐渐遗忘的时候，奇虎360公司向广东省高院提起反垄断诉讼，称腾讯公司在“3Q大战”期间滥用其即时通讯工具QQ的市场支配地位，强制用户卸载已安装的360软件，导致360公司大量的用户流失，使360公司遭受了巨大的经济损失，要求腾讯公司赔偿其经济损失1.5亿元，并公开道歉。
360公司总裁齐向东说：“360是腾讯滥用市场地位的受害者，腾讯的‘二选一’给360带来了巨大的经济损失。我们提起针对腾讯的反垄断诉讼，希望通过社会各界的积极参与和讨论，以及司法机构对这个案例的判决，能够遏制腾讯的滥用市场地位的行为，建立一个公平竞争、有利于创新的互联网环境。”
被业内戏称为“3Q大战第二季”的又一次激烈交锋就此展开。
市场竞争以法律诉讼的途径展开，这种桥段在“3Q大战”中并不陌生。早在2010年9月，“3Q大战”最激烈的时候，腾讯就曾诉“360隐私保护器”不正当竞争。腾讯认为，“360隐私保护器”监测了腾讯QQ聊天软件的运行，并利用虚假宣传手段，误导和欺骗用户，诬蔑腾讯“窥视”用户的隐私，给腾讯声誉造成极大损害，要求360停止开发“隐私保护器”及相关软件，赔偿400万元，并连续三个月道歉。在这次诉讼中，360败诉。
一直以来，腾讯在法律诉讼中都有一种天生的幸运。2008年，在引起社会关注的珊瑚虫版QQ侵权案中，制作珊瑚虫版QQ的陈寿福被判侵犯著作权罪，处有期徒刑3年，并处罚金人民币120万元。按常理来讲，周鸿祎应该主动规避与腾讯在公堂对峙，可周鸿祎偏偏迎难而上。
4月18日，360与腾讯围绕垄断所发起的诉讼战在广东省高级人民法院拉开帷幕。这起诉讼是国内互联网行业围绕垄断所进行的第一起诉讼，同时也是广东省首例反垄断纠纷案，因此关注度非常高。
有数十家媒体从全国各地飞至广州，多名人大代表及政协委员也对这起诉讼表示关注。另外，诉讼双方在得到广东高院的许可下，都邀请了重量级人物到庭。360邀请的是英国学者大卫·斯塔利布拉斯，他曾担任英国伦敦公平贸易局局长，是欧洲独立提供竞争法调查经济意见的机构RBB的顾问；而腾讯方面邀请的是中国社会科学院信息化研究中心秘书长姜奇平，对中国互联网行业和相关法规非常熟悉，曾当选中国互联网十大“启蒙人物”。这起诉讼在互联网行业、法律业界、媒体都引起了极大的轰动。
由于互联网的特殊性决定了自然垄断的形成，再加上反垄断法和反不正当竞争法难以界定滥用市场支配行为，360的这起诉讼注定是一场难判胜负的官司。周鸿祎为什么还要打这场官司呢？
周鸿祎这样解释：“我认为这不是两家公司的私人恩怨，今天很多创业公司可能被垄断集团给拍死了，死了都没人知道，他们应该才是最悲惨的，他们没有这种实力，可能也没有这种声音。输赢我认为没有那么重要，重要的是一定要有人公开出来对这个事说不，最后结果所谓叫谋事在人成事在天，可能没有预期，但我一定要去做。”
前几轮的征战中，周鸿祎一直站在用户的角度，以捍卫用户利益的形象出现，现在他站在行业角度，以维持行业正义为使命，先不论诉讼成败与否，周鸿祎的这种做法为自己在行业内树立了积极的正面形象。
同一时间，腾讯在广东省高级法院提交了针对“360扣扣保镖”的诉讼。腾讯称，“360扣扣保镖”实质是打着保护用户利益的旗号，污蔑、破坏和篡改腾讯QQ软件的功能，并借机宣传和推广自己的产品，是一种“不正当竞争”的行为，请求法院驳回360全部诉讼请求，并索赔1.25亿元。
早在2011年9月，腾讯就曾对“360隐私保护器”提出不正当竞争的诉讼，经法庭判决，360一方败诉。现在腾讯又重提“不正当竞争”的话题，再加上360对腾讯的“反垄断”诉讼一直悬而未决，这使得双方的诉讼战显得扑朔迷离。
互联网专家刘兴亮认为，360和腾讯从“口水战”到对簿公堂，其真正意义不是为了赔偿金额，它更像是一种公关手段。从公关角度看，通过此次诉讼，QQ被打上了“霸气、霸道、霸权”的标签，而360的品牌形象和品牌知名度都得到了大幅度的提升。
2011年是360高速发展的一年，周鸿祎一口气推出以360安全网址导航、360安全桌面、360安全浏览器、360极速浏览器为代表的平台级产品，助力360的全面提升。除此之外，周鸿祎还推出一系列网民喜爱的移动互联网产品，包括360手机助手、360手机桌面、360手机/Pad浏览器、360优化大师、360电池卫士等一系列手机系统优化产品应用，逐步在移动互联网上构建出开放的系统平台。
“酒香还怕巷子深”，有了好的产品，如果推广力度不够，这些产品很可能会被埋没。借助360与腾讯诉讼事件的影响力，360品牌知名度得到最大范围的传播，旗下的产品也受益其中。从这个角度看，虽然诉讼没有成功，但周鸿祎毫无疑问是交战中的胜方。
2013年3月28日，“360诉腾讯案一审宣判，全部请求遭驳回”的消息在网络上传播开来，广东省高级人民法院驳回了奇虎360对腾讯“滥用市场支配地位”的诉讼，诉讼产生的79万元费用由360方面承担。在人们刚要把这次战役淡忘的时候，这一消息又披露出来，它好似告诉人们：“3Q大战”永没有结束。