（2）加强栽培管理。改进栽培管理措施，增强植株抗病能力。改秋植为春植，适当密植。施足基肥，争取当年种植当年收果，争取在发病高峰期来临前已获得可观的产量。从播种到开花结果这段时间，番木瓜一般需经过两个发病高峰期。第一次发病高峰期（4～5月），秋植番木瓜（南方地区11月播种，翌年3月定植）正在苗期，虽然感病但发病较少，第二次发病高峰期时（10～11月）已结果，产量基本定形，使得大量已开花结果的植株能避过感病高峰期正常开花结果。在7～8月回绿期，加强肥水管理，促进植株长势壮旺，对提高单位面积产量有显著效果。
（3）及时挖除病株。在果园里发现病株（特别在苗期）时要及时挖除，并用石灰消毒。已达盛果期的果园、发病率高达20％以上的果园可以只挖除失去结果能力的病株，对坐果多、发病轻的植株给予保留，利用回绿期加强肥水管理，让果实继续发育。
（4）消灭病源，适当隔离。旧果园种植前要清除病株，新果园距离旧番木瓜园要2km以上。果园不要套种瓜类蔬菜，也不邻近瓜类蔬菜园。在每行植株上拉2条5cm宽，有光泽的灰金属颜色的塑料带。
（5）药剂灭蚜。在蚜虫迁飞的高峰期，特别在干旱季节及时喷药。蚜虫喜欢栖息在果园周围的杂草上，要注意清除。在发病高峰期出现前和发病高峰期间，要做好治蚜防病工作。防治蚜虫要在大范围内进行方能收到较好的效果。
（6）利用病毒弱毒素。美国夏威夷大学筛选出来的病毒弱株系，对当地番木瓜花叶病有很好的防治效果，但对我国番木瓜花叶病的防治效果不显著。
（7）网室大棚育苗及种植。用网室大棚防蚜虫效果好，网室建设可采用低投入的竹木结构大棚或网室，钢管骨架大棚与网室使用年限长。
（8）药剂防治。蚜虫是番木瓜花叶病的主要传播媒介，药物防治主要针对防治蚜虫，可用50％避蚜威可湿性粉剂1000～1500倍液，或用吡虫啉2500倍液喷施。定期喷药灭蚜，在蚜虫飞前的高峰期，特别在干旱季节应该及时喷药。
2.番木瓜炭疽病
本病是仅次于番木瓜环斑花叶病的另一个重要病害，全年都可发病，以秋季最为严重，幼果及成熟果发病较多，在果实贮藏期可继续为害。
主要危害果实，其次危害叶片、叶柄和茎。被害果面首先出现黄色或暗褐色的水渍状小斑点。随后病斑逐渐扩大，病斑中间凹陷，出现同心轮纹，上生朱红黏粒，后变为小黑点。病斑整块可以剥离，叶片的症状多发生于叶尖和叶缘，呈不规则形、褐色病斑，斑上有小黑点。在叶柄上多发生于即将脱落或已脱落的叶柄上，病区与健康区交界不明显，上面密生黑色小点或朱红黏粒。
防治方法：
（1）加强栽培管理。要加强肥水管理，使植株生长健壮，减少病害发生。
（2）注意田间卫生。在生长季节里，随时摘除病果、病叶，及时收集烧毁地面上的病株残体，彻底清除菌源。
（3）适时采果。避免过熟采收和采摘时弄伤果实，在采果前2周喷施70％甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，可起到防腐保鲜作用。
（4）药剂防治。因炭疽菌有明显的潜伏浸染现象，所以药剂防治要在幼果期进行。常用的效药剂有：0.5％波尔多液，40％灭病威悬浮剂500倍液，70％甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液，50％多菌灵可湿性粉剂或75％百菌清可湿性粉剂600～800倍液。在8～9月的发病季节，每隔10～15天喷1次，连续喷药3～4次，并及时清除病果。
3.番木瓜白粉病
主要危害番木瓜幼苗叶片。叶面最初出现近圆形白色粉霉，随后，粉霉逐渐扩大并互相连合为粉状斑块，叶面大部分或几乎全部为白色粉状物所覆盖，影响光合作用，被害幼叶变黄，甚至枯黄脱落。
防治方法：
（1）改善设施的通风透气条件，可减少发病。
（2）发病初期及时喷施25％粉锈宁可湿粉1500～2000倍液，或40％菌力克悬浮剂4000倍液，或70％托布津加75％百菌清（1：1）1000～1500倍液。视天气和病情连喷2～3次，隔7～15天喷1次，前密后疏，药要喷匀喷足。
4.番木瓜疮痂病
番木瓜疮痂病是番木瓜园普遍发生的一种病害，主要危害叶片，有时也危害果实，严重时会造成落叶。
番木瓜疮痂病多发生于叶背面的叶脉附近。病斑初为白色，后变为黄白色至灰褐色，圆形或椭圆形，凸起呈疮痂状，粗糙，后期黄斑转为灰褐色，天气潮湿时，在病斑上着生灰色或褐色的霉状物，此为病原菌的分生孢子梗及分生孢子。有时危害果实，症状与叶片上的症状相同。严重时果实早衰脱落。
防治方法：
（1）加强果园管理，防止果园积水，适当剪除部分老叶，使果园通风透光良好，可减少病害的发生。
（2）在发病初期可用50％多菌灵可湿性粉剂600～800倍液，或50％托布津可湿性粉剂500倍液药物喷洒，每隔10～14天喷药1次。防治效果明显。
5.番木瓜根腐病
根腐病主要危害根颈部和根部，苗期与刚定植不久的幼苗较易染病。初期地上部的茎叶表现出类似缺肥缺水症状，植株生长不良，叶片失绿。在茎基部出现水渍状，随后变褐色腐烂，拔出病株可见须根较少，且呈淡黄褐色。随着病情加重，植株长势越来越差，下部叶片开始变黄枯落，矮化植株更为明显，最后整株叶片萎蔫，植株枯死。枯死病株很容易从土中拔起，须根已完全腐烂不见，主根变黑褐色并逐渐腐烂，用手挤压根部，根部皮层很容易剥落。茎基部有时可见到粉红色霉层及胶液，这是病原菌的菌丝体和分生孢子团。
防治方法：
防治番木瓜根腐病最主要的措施是改善和加强农业耕作管理技术。
（1）种植番木瓜应选择地势较高的地块，种植前土壤需深翻晒白。种植园要挖好排水沟，避免积水。采用深沟高畦栽培，畦面整成馒头型，以利雨后能及时排水，防止畦面受淹。
（2）大棚温室栽培时要注意适当通风透气，保证光照充足，降低棚内湿度。
（3）基肥要施充分腐熟的有机肥，追肥应均匀撒施，勿过于靠近根部。
（4）避免连作，种植园附近最好不种瓜类蔬菜，定植时不宜种植太深。
（5）种植前结合整地穴施75％敌克松可溶性粉剂800～1000倍液；或苗期淋施50％多菌灵可湿性粉剂500～600倍液，每株浇250～300ml，有一定的预防作用。发现病株要及时拔除。药剂防治可用75％敌克松可溶性粉剂800～1000倍液；或50％多菌灵可湿性粉剂500～600倍液，每株浇250～300ml，每7～10天1次，连续2～3次。
6.番木瓜瘤肿病
叶片变小，叶柄缩短，幼叶叶尖变褐枯死，叶片卷曲、脱落，雌花可变雄花，花常枯死。果实很小时就大量脱落。在果实、嫩叶、花、茎秆上有乳汁流出，并在流出部位有白色干结物。果实从幼果期至成熟初期均有乳汁流出的症状，且多在果实向阳面流出，果皮流出汁液后会慢慢溃烂、变软，溃烂部分会变褐色，没有溃烂的果实会有瘤状突起，凹凸不平。严重的病果种子退化败育，幼嫩白色种子变成褐色坏死。
防治方法：
根际或根外补充硼元素是防治番木瓜瘤肿病的根本方法。常用土壤施硼或根外施硼，选用硼酸或硼砂，在植株旁挖一小穴，每穴施硼砂2～5g或硼酸3g，通常施1～2次。根外施硼可喷0.1％～0.2％硼酸溶液，每隔一周喷1次，连喷3～5次。施硼一定要在植株现蕾时完成。每年施硼肥是番木瓜栽培中的一个重要环节。
7.番木瓜灰褐斑病
灰褐斑病由真菌浸染所致。该病发生在叶片两面，病斑呈圆形或多角形，中部灰褐色至褐色，边缘暗褐色，斑上生灰褐色霉状物。防治方法同炭疽病。
8.白星病
由叶点霉属浸染所致。该病常发生在叶片两面，病斑近圆形，中部白至灰白色，周缘褐色，病斑上生有小黑点，后期病斑可连合在一起，易脱落成穿孔。