（1）自根育苗。冬瓜自根从土壤中吸收营养，但也导致土壤病害从根部对植株造成污染，蔬菜染病的机会较大。因此，自根育苗往往要求苗床为重茬较轻的地块，且经过3～5年非瓜类作物轮作的地块。
（2）嫁接育苗。这种育苗方式是冬瓜优质栽培的重要手段之一。嫁接技术也被越来越多的农民接受，在冬春茬冬瓜优质栽培中，普遍进行嫁接育苗。嫁接育苗具有如下优势：①防病。由于不以冬瓜自根从土壤中吸收营养，也就避免了土壤病害从根部对蔬菜进行的直接污染，蔬菜染病的机会相应减少，发病明显减轻。②增强低温期蔬菜生长势。嫁接栽培可选用耐低温能力强的砧木来提高蔬菜的耐寒能力，使其在低温弱光的冬季维持较强的生长势。③延长结果期，有助于提高产量，防止早衰。不嫁接的冬瓜秧苗结果期为100天左右，嫁接后的可延长到150～200天，加上冬春茬冬瓜生长季节较长，正好符合一次简单投入、长期得到回报的要求。