播种前通常要进行种子处理，一般经过以下三个过程：
（1）晒种。育苗多在1月份，气温较低，而浸种温度较高，浸种时温差过大易损伤种子。因此，有必要进行晒种，有利于贮存的种子逐渐适应浸种时的温度，并促使种子后熟，提高发芽率。具体做法是将种子放在阳光下晒2～3小时，然后再进行其他处理。
（2）浸种。浸种是保证种子在有利于吸水的温度条件下，在短时间内吸足从种子萌芽到出苗所需的全部水量的主要措施。通过浸种，可间接缩短催芽所需要的时间，还能消灭种子表皮所附着的病原物。具体浸种方式将在下文详述。
（3）催芽。冬瓜种子的种皮坚硬且厚，影响种子的发芽速率和整齐度，为缩短种子的发芽时间，便于集中播种，应当对冬瓜种子进行催芽处理。冬瓜种子的催芽处理主要采用以下方式：将浸过的冬瓜种子用多层潮湿的纱布（或麻布、毛巾等）包裹起来，不要包得过紧，应使包内种子保持松散状态，然后放入32℃的催芽箱中催芽（或在热炕、电热毯上催芽），要注意防湿、导电。催芽期间每隔4～5小时翻动种子1次，便于种皮进行气体交换；如果种子量大，则每隔20～24小时用温水搓洗种子1次，洗净黏液，方便换气。最后洗净种子装包后，把水分甩掉，随即松散包内种子，再继续催芽。72小时后，当有75％左右的冬瓜种子“破嘴”时，即停止催芽，准备播种。