蒙哥死后，接踵而来的长达4年的汗位争夺战，将成吉思汗用武力筑建的帝国篱笆撕开整段整段的缺口。从缺口中逸出的权利欲与财富欲，对忽必烈来说，是灾难的象征。尽管他击败了阿里不哥，大汗地位也即将被黄金家族公认，但当他环视一下蒙古帝国的篱笆，却不得不承认，致力于修复帝国的裂口已为时过晚。
追忆一下蒙古帝国缔造者成吉思汗的所作所为以及他裂土分民的思想，也许对我们理解忽必烈的处境会有些帮助。同时，如果我们不把忽必烈放在黄金家族历次的汗位攘夺与盘根错节、令人生厌的复杂关系中，我们也同样不能给予忽必烈以应有的理解与同情。
对于成吉思汗四个儿子的兀鲁思我们已能在蒙古帝国的地图上找到。不过蒙古帝国的篱笆却经常被他们的后王们挪来搬去，到忽必烈安定了中原汉地的秩序与情绪，阿里不哥到政敌处去寻找生路时，忽必烈惊讶地发现蒙古帝国的地图已被涂抹得面目全非。尽管忽必烈本人也是积极的绘制者之一。
忽必烈与阿里不哥兵戎相见的第一个硕果是伊利汗国的诞生。
在忽必烈远袭大理，精耕细作北中国时，他的同母弟旭烈兀在波斯也正忙于开疆拓土。经过成吉思汗和窝阔台的两次西征，蒙哥得以在波斯的大部分领土上建立直属汗庭——当然必属黄金家族公共财产的阿姆河等处行尚书省。1252年蒙哥命令从诸王所属军队中签发十分之二交付旭烈兀，进一步征讨尚未归附的波斯诸国。1256年旭烈兀攻灭盘踞玛拶答而（今伊朗马赞德兰省）诸山城的“木剌夷国”。1258年攻陷报达（伊拉克巴格达），灭黑衣大食（阿拉伯帝国阿拔斯朝）。1259年，旭烈兀分兵三路，侵入叙利亚。次年春，旭烈兀接到蒙哥死讯，留下大将怯的不花继续征进，自率其余蒙军退返波斯。当旭烈兀正拟东返故乡时，忽必烈与阿里不哥先后自立为汗的消息传来，旭烈兀决意观望，遂建帐波斯。
忽必烈与阿里不哥异口同声地宣称旭烈兀是自己的支持者，旭烈兀的身价于是成倍增长。胆大心细的忽必烈不惜再破陈规，以大汗名义将黄金家族的公共财产波斯地区划归旭烈兀，借此换得旭烈兀的支援。旭烈兀毫不客气，雷厉风行地自称伊利汗（意即大汗的属民），在东起阿姆河和印度河，西面包括小亚细亚大部分，南抵波斯湾、北至高加索的广大地区建立伊利汗国，建都蔑剌哈（今伊朗阿塞拜疆马腊格），任命各省长官。接着，旭烈兀遣使指责阿里不哥，并几度遣军东向，威胁支持阿里不哥的窝阔台后王海都。
伊利汗国像一笔交易就这样戏剧性地在忽必烈授意，旭烈兀的动手下绘制在蒙古帝国的新地图上。
忽必烈与阿里不哥不共戴天的第二个硕果是促成钦察汗国由半独立走向独立。尽管胜利者忽必烈收获到册封钦察汗即位的权利。
钦察汗国奠基于术赤，成型于拔都，独立于别儿哥。术赤的离心倾向曾使父哥暴跳如雷，但术赤的次子拔都却全然不顾祖父的激愤，继续沿着离心的道路高歌猛进。由拔都统率的长子西征本是黄金家族的共同事业，但所征服的包括过去已铁骑所至的东起也几的石河，西到斡罗思、南起巴乐喀什湖、里海、黑海，北到北极圈附近的辽阔区域，西征结束后都沦为拔都及其13位兄弟的世袭领地。拔都在伏尔加河下游萨莱（今阿斯特拉罕附近）扎下牙帐，术赤系后王，拔都的13位兄弟像群星拱月般地团聚在金帐周围，形成半独立的钦察汗国。
拔都帮助蒙哥登上汗位，在打击窝阔台、察合台两系势力的同时，乘机占据汗中地区。曾主持蒙哥即位仪式的别儿哥于1257年继拔都登上术赤兀鲁思的汗位。他名义上仍对蒙古大汗称藩，但他却不再履行黄金家族的义务，蒙哥南征时我们已很难寻找到术赤系后王的从征军队。到忽必烈与阿里不哥挑起战争时，对汗位别儿哥显得十分冷漠，他周旋于拖雷后王两兄弟之间，只唱调和宗亲的高调。尽管他似乎从感情上倾向于草原气息较浓的阿里不哥，并在所铸的货币上称阿里不哥为大汗，但他却不发一兵一卒去给疲惫不堪的阿里不哥以实质的帮助。
一如对待旭烈兀，阿里不哥宣称别儿哥同意自己为蒙古大汗，而忽必烈也向别儿哥派去急使，翘首以待别儿哥承认既成的事实。
阿里不哥归降忽必烈后，忽必烈向别儿哥派去急使，征询处置阿里不哥的意见并邀请他来参加忽里台。别儿哥圆滑地回话忽必烈：“合罕、旭烈兀和全体宗亲们所作出的决定是正确的。我们也一定在牛年（1265年）出发，在虎年（1266年）走完全部路程，在兔年（1267年）出席忽里台。”
但实际上别儿哥没有时间分身，他正手忙脚乱于与旭烈兀和阿鲁忽的战事。
不管怎么说，别儿哥宁愿对忽必烈大汗致以口头上的尊重，但却不想在蒙古帝国地图上丢失哪怕是一小块草地。对钦察汗国的统御忽必烈只能保留一种象征性的权力。再也无力从术赤后王所属军队中抽调一兵一卒用于新的征服战争了。
忽必烈与阿里不哥逐鹿汗位的第三个硕果是促成察合台封地或兀鲁思的私有化，并逐步向独立汗国方向发展。
察合台的最初份地是从畏兀人境地一直延伸到河中的草原地区，而中亚的河中农耕地区和城廓地带——中亚地区东起吐鲁番盆地，西至阿姆河，北达塔尔巴哈台山，南抵阿富汗——则是黄金家族的共同财产，由蒙古大汗直辖，大汗委任官员，所得收益由黄金家族成员共享。
窝阔台时，察合台特汗兄、诸王之长的身份，企图吞并城廓地区，遭到窝阔台的斥责。但随后，窝阔台将从畏兀人之地到阿姆河沿岸的诸城廓交付察合台管辖，但大汗仍派大臣驻镇中亚诸城。
蒙哥时期，在河中、讹答剌、畏兀儿地、忽炭、可失哈耳、毡的、花剌子模和今费尔干纳地区之间的辽阔地域设立别18里等处行尚书省，直属汗庭。管理察合国封址的兀鲁忽乃仍留居在草原地带的城廓。这时，术赤后王势力已伸至河中地区。
忽必烈在开平一称汗，便着手控制原属汗庭的河中地区，这是中亚最富庶的地域。但他所派的察合台后王被阿里不哥擒获，阿里不哥则派出阿鲁忽去主持察合台兀鲁思。阿鲁忽从兀鲁忽从妃子手中夺取汗权后，将别儿哥在撤麻耳干、不花剌和河中地区的守军全部杀死，接着便发生了我们已熟悉的阿鲁忽倒向忽必烈、阿里不哥向阿鲁忽开战并据有察合台驻帐地阿力麻里的事。
忽必烈为争得阿鲁忽的支持，故伎重演，以蒙古大汗的身份将东自按台山（阿尔泰山），西至阿姆河的土地委付给阿鲁忽，鼓励地去发展自己的势力。
阿鲁忽败于阿里不哥后避居忽炭（今新疆和田），收集失散的军队后，事业多振，并向别儿哥再度开战，洗劫了讹答剌。
阿里不哥向忽必烈缴械后，忽必烈对古老的忽里台仍心存幻想，遣使征询如何处置阿里不哥并同样邀请阿鲁忽。阿鲁忽最关心的是自己的利益，他对忽必烈的使者说道：“我是未经大汗和兄长旭烈兀正式同意继承察合台之位的，现在全体宗宗们聚集在一起，正可判定我能否继位，我愿意前去参加忽里台。”
清扫了阿里不哥的势力之后，忽必烈力图直接控制原属汗庭管辖，蒙哥时所设的别失八里等行尚书省之地。于是，“忽必烈合罕命一支大军前往阿姆河岸，使一切居于这一地区的打算独立的宗王统统从交通线上撤走，这样合罕的使臣可以没有任何一点困难地往返于旭烈兀大王与大汗之间。”同时，阿里不哥所据的察合台封地的东部也被忽必烈接收。
在忽必烈将触须伸向中亚的同时，窝阔台后王海都也趁机向阿鲁忽开战，争夺地盘，并联合别儿哥，击败阿鲁忽，进据察合台的驻帐地阿力麻里。
中亚的地理位置重要到忽必烈、海都、别儿哥都垂诞三尺的地步。钦察汗倾心于汉中的富庶，而海都则想图谋霸业，从这里可直扑别失八里，穿河西走廊直接威胁忽必烈领地的腹心。忽必烈如果控制了阿力麻里等城廓地，那么便可遏止西道诸王的东向，进而可对钦察、窝阔台、察合台兀鲁思发号施令，并便于和伊利汗国联系，形成东西相向的有利形势。因此，由于各系的插手，察合台领地便形成混战局面。
不幸的是，历史总是向忽必烈出难题，正当忽必烈致力于控制中亚的时候，体弱多病的阿鲁忽收娶了合剌旭烈的遗孀、体健貌美的兀鲁忽乃后竟染色身亡。曾经掌握察合台兀鲁思达10年之久的兀鲁忽乃雄心不减当年，将蒙古大汗忽必烈的尊严弃如敝履，擅立自己的儿子木八剌沙为察合台汗。
忽必烈为捍卫大汗的宗主权，并沿着控制中亚的战略思路向前挺进，急需寻找另一位代言人去代理察合台兀鲁思事务。效劳于忽必烈身边的察合台曾孙八剌察颜观色，向忽必烈进言：“木八剌沙凭什么继承我叔父阿鲁忽之位？如果大汗降旨让我继承我的叔父之位，今后我将效劳奉命于大汗。”于是，忽必烈便派八剌去协助管理察合台兀鲁思事务。
更不幸的是，忽必烈这种放虎归山的举动，收益到的只是被这只猛虎反咬一口，忽必烈强忍剧痛，噙泪吊唁着自己的失策。当然，这是后话。
忽必烈与阿里不哥自戕互残的第四个硕果是激发了窝阔台后王海都势力的崛起，并点燃起窝阔台系攫取大汗宝座的欲望。
海都是合失的儿子，而合失则是窝阔台的第五子。蒙哥曾使窝阔台系凋零不堪，当时年仅十几岁的海都被放逐在海押立（今哈萨克塔尔迪·库尔干尔）。海都人极聪明，聪明到狡诈奸猾的地步。他是一个天才的军事家和优秀的行政管理家，凡是接触过他的基督徒、旅行家，包括马可·波罗，全都对他赞不绝口。
在忽必烈与阿里不哥交战时，海都在自己的封地正训练着纯蒙古血统的骑兵，他对游牧祖先们弯弓射箭，纵马奔驰于草原的粗野生活方式极为眷恋，他以能保持祖先的传统而自豪。毫无疑问，他不欣赏忽必烈与征服地汉人的亲昵。他是阿里不哥情感上的支持者。
忽必烈在整个汗位战争期间对大多数蒙古诸王都满面笑容，除了阿里不哥及为阿里不哥卖命的。在领赏诸王时，忽必烈照例没有忘记海都。阿里不哥势衰后，忽必烈向海都遣去急使，十分有礼貌地引诱海都：“其他宗王全都到了开平，你们怎么迟迟不来呢？我衷心希望当面会晤，我们一起把一切事情都商议定好后，你们将获得各种恩典返回。”
海都曾捎口信给忽必烈，他要求依照成吉思汗的札撒，将黄金家族征服的汉地也分给他应该得到的那一份。忽必烈则要求他来参加忽里台。海都还记得蒙哥召开的忽里台。他无意自投罗网，遣使致歉道：“我们的牲畜很瘦，等养肥之后，我们遵命前去。”但他的牲畜三年也没有养肥。
马可·波罗对我们说：“海都对他的伯父——大汗心存疑忌，拒绝接受这个条件。他只表示愿意在自己的国家里，向大汗称臣纳贡，而不愿意到大汗的宫廷去，因为他害怕被处死。”的确，海都宁愿死在疆场，也不想死在忽必烈的智谋里。
海都在“马瘦”的三年里，依托海押立，倾心驯养战马和蒙古战士。很快，他便成为窝阔台系的领袖，并恢复了被分割成数块的窝阔台兀鲁恩。其大致范围包括叶密立海流域，也儿的失河流域、阿尔泰山的一部分，其重要的首府有两个，一个是叶密立，一个是海押立。其正西为钦察汗国，偏西与南部则是察合台汗国。但海都不久即挥师南侵，并将行营迁至察合台的驻帐地阿里麻里。占据了原窝阔台封地全境与察合台封地一部分的海都迅速崛起，大有和成吉思汗媲美之势。
这时，他潜隐多年，发誓要从拖雷系夺回汗位的夙愿开始提上议事日程。
八剌到达察合台封地后，施展高超的阴谋诡计，废木八剌沙而自立。接着率军进攻海都，且初战告捷，但海都却请来自己原来的宿敌——钦察的蒙古大军，合兵反攻八剌，八剌不敌，退走河中。海都更加志得意满，此时，他已不需要以马疲的借口来敷衍忽必烈了。
忽必烈与阿里不哥大打出手的第五个硕果是揭开蒙古帝国全面内讧战争的序幕，从而使汹涌的向西征服浪潮停息。
因为忽必烈的抢班夺权，旭烈兀放松了对叙利亚的战争。大将怯的不花于是败在埃及军队的马蹄下，向西南非洲挺进的计划遂成泡影。因为追随旭烈兀西征的三个术赤后王一个因巫蛊罪被处死。另两个也莫名其妙地仙逝，再加上已改信伊斯兰教的别儿哥，以其初入教的狂热，对旭烈兀大肆蹂躏伊斯兰教圣地并虐杀哈里发而极为恼怒；同时他又垂诞伊利汗国的高加索地区，于是征发大军，气势汹汹扑向旭烈兀。旭烈兀也不甘示弱，亲统30万大军迎击。在这种情况下，蒙古帝国再向西扩张已成纸上谈兵。西欧因此而得以长喘一口气。
1262年蒙古帝国东部忽必烈亲兄弟正鏖战得兵尘蔽日，帝国的西部旭烈兀、别儿哥两亲堂兄弟在汗国的篱笆墙边也已厮杀得难解难分。所不同的是东部的战争接近尾声时，而西部的内战还方兴未艾。
1265年，喜欢以各种各样方式杀人的旭烈兀病死。他是个基督教徒，这是受他母亲的影响之故，固此他求助于罗马的基督教会，企图组织十字军东征；别儿哥则向埃及的算端们伸出联盟之手，幻想夹攻旭烈兀。黄金家族本已激情四溢，现在又浇上燃烧的宗教之火，无以复加的结果只能是不因旭烈兀的死而结束形同对恃敌国的内战。
阿八哈继承旭烈兀遗志，再度与别儿哥展开激战，战斗的结果是别儿哥病死出征的途中。
此时，在钦察汗国、窝阔台封地、察合台封地的交界处也不清静。三方混战一番后，天生就具有领袖才能的海都预见到这种内耗无疑于自杀，而他们的共同敌人应是忽必烈。在征得钦察新汗忙哥帖木儿的同意后，他向察合台汗国已濒于崩溃的八剌汗派去自己的兄弟乞卜察克（窝阔台孙）去约和，尽管八剌沉思良久，并自言自语道：“真不知道在这种和平之后隐藏着什么战争。”但他还是决定接待乞卜察克，并向乞卜察克满噙亲情的泪花诉苦说：“我们荣耀的父辈用剑征服了世界，并交给了我们。为什么我们不享受世间的幸福，而去内讧、争吵呢？我们家族中的其他宗王们都占有众多大城和繁荣的牧场，而我只有这一小块兀鲁思。海都与忙哥帖木儿还因这一小块分地反对我，要把我这个悲惨、窘迫、可怜的人赶走。”
乞卜察克完成了自己的使命，八剌同意握手言和。三系和好时刻，也就是拖雷系倒霉时分。忽必烈总是被自己的人反咬一口，八剌势力刚能达到自立，他就开始驱逐忽必烈伸向中亚的势力。忽必烈派火你赤率6千骑兵去收复失地，而八剌则遣3万大军去迎击，火你赤有自知之明，含泪退兵，八剌洗劫并占据了忽炭。现在八剌又驱散了与另外两系的战争乌云，正式背叛忽必烈的时机已经成熟。
对似乎已变种的忽必烈，海都没有丝毫好感。当海都感化了八剌并稳定了其情绪后，他携着免除后顾之忧的轻快感，1268年正式举兵东犯。
忽必烈命令自己的儿子那末罕去与海都对杀。马可·波罗，他为我们绘声绘色地讲述了忽必烈与海都间的惊心动魄的最残酷战争。即使连细节也没有漏过，他首先对蒙古人阵营前的礼貌表示惊奇，接着他便感觉到“呐喊声和兵器的撞击声，震天动地，即使上帝的雷声，也会被淹没得听不见。”随着他称赏海都刀法特别娴熟，舍生忘死、武功高强，战场上便开始伏尸累累，连这个冒险家也觉得惨不忍睹。最后，他万分感叹地说：“在这一天里，有多少妇女变成寡妇，又有多少儿童变成了孤儿。”
战后第二天，忽必烈派来一支更加强悍的军队，海都察觉风向不对，勒马撤退。忽必烈军既败之于别失八里，复又乘胜追击，长驱至海都的新巢阿力麻里。而海都则远遁2000多里，殊避兵锋。
这可能是忽必烈对西道诸王的最有力一击，也可能是他的军队到达中亚的最远地方。此后，那木罕就驻镇阿力麻里了。
阿力麻里的军事战略地位十分重要，它位于察合台汗国的草原上，对海都及忙哥帖木儿的兀鲁思都可构成威胁，足以对他们发号施令。可以肯定，这是忽必烈作为蒙古大汗其权威达到顶峰的时候，如果阿力麻里能够长期占领，中亚的历史则势必要重写。然而，很遗憾，历史并不迁就忽必烈。
军事上的胜利并不能填补忽必烈精神上的空虚，那袅袅炊烟似的失落感却反而使忽必烈更加遗憾与不安。在1264～1263年间，忙于内战的阿鲁忽、旭烈兀、别儿哥的相继谢世，那1267年齐聚开平或者和林的忽里台，自然也像一缕青烟化为乌有。很矛盾，的确很矛盾，忽必烈亲自砸碎了忽里台的神圣，但他却不断地幻想去重塑它。制度的古老使忽必烈不安甚至愤怒，但他一旦将之摧毁，并以胜利者的心情再去追忆它的时候，却又俯就于它曾经焕发过青春的魅力下，缅怀它、向往它。
黄金家族内部的自相残杀，使忽必烈这位大汗、宗主也同样将数年岁月消磨在这种历史怪圈中。与其说他这位大汗还能统御黄金家族众多的后王，还不如说他和诸王一道沉醉在对共同祖先光辉业绩的回忆与崇敬中。
忽必烈的忽里台没能如愿召开，但除拖雷系外，其它三系的忽里台却开展得有声有色。
1269年春，三系后王欢宴于塔剌恩河畔的草原上，经过一星期的酩酊大醉，第八天海都首先讲话：“我们荣耀的祖先成吉思汗以其明智审慎，用剑和箭征服了世界，筹划好后交给了我们。按照父军，我们都是至亲，其他宗王也是我们的兄弟，我们之间为什么不利和纷争呢？”八剌接着发言：“是啊，须知我也是那颗树上结出的果实。窝阔台的后人是海都，察会台的后人是我，他们的兄弟术赤的后人是忙哥帖木儿，而幼弟拖雷的后人是忽必烈和阿八哈。如今忽必烈夺得了东方汉地，其境土之广大，只有长生天知道。阿八哈及其兄弟们占有了西方从阿姆河直到叙利亚和密昔儿的辽阔土地。这两个兀鲁思之间则是海都你的辖境和钦察巴失地区。作为成吉思汗的后人，也应该给我指定兀鲁思，而如今你们都反对我。我想了又想，不管想了多少次，都想不通我有什么错。”
海都说：是你有理。就这样决定吧，我们将夏营地和冬营地公平划分，迁居到草原。河中地区三分之二归八剌你所有，三分之一则归我和忙哥帖木儿管辖。
宣誓完三系后王保持蒙古传统的游牧风俗和习惯后，会议最后决定：明年（1270年）春天由八剌率军，海都支援渡阿姆河，攻取伊利汗阿八哈的呼罗珊，为八剌扩大牧场、土地和畜群。
但他们没有忘记派出一个气势汹汹的使团去厉声质问忽必烈：“蒙古旧络，与汉法迥异。如今你留居汉地，建造都邑城廓，创设汉文制度，遵从汉法、究竟是为什么？”
“塔剌恩忽里台收益最大的是海都”。以大会所衍生的战争后果我们将确信这句话不是一时糊涂的胡言乱语。
海都与伊利河阿八哈原是宿敌，海都怂恿并支持八剌向阿姆河以西发展，既可泄愤，又能解除对自己的压力。
1270年，八剌遵约集结大军，渡阿姆河向呼罗珊疾进。海都也践行诸言，派窝阔台孙乞卜察克、贵由孙察八忒斡忽勒率军从征。但海都只是装装门面而已。还没有开战，八剌因为袒护他的仆人扬言用匕首扎破乞卜察克肚子的不礼貌举动，乞卜察克愤而率窝阔台系援军返回海都营帐地。八剌恼羞成怒，对你沙不儿进行了屠杀和掠夺。他穷凶极恶的军队，粗鲁、放肆，令呼罗珊居民害怕。阿八哈采取诱敌深入的诡计，让八剌洗劫了只涅平原上布荡的帐幕。但第二天，八剌即由高兴变为烦恼，因为他看到了无垠的原野上阿八哈的军队像蝗虫般扑来，结果可想而知，他惨败而逃回阿姆河东部。惊慌、哀号的八剌以致衰弱得不能骑马，退至不花剌。
八剌聚拢溃兵，对临阵叛逃者大开杀戒，并邀请海都发兵征讨叛军。海都正欲乘势翦除八剌，这消息不啻天降喜讯，亲率大军，突然包围八剌营帐。八剌含恨而死。海都将八剌的全部牲畜、军队与财产据为已有。海都势力急剧膨胀。
自1270年，海都不仅是窝阔台系留在其兀鲁思后王的领袖，而且他已身为察合台兀鲁思实际的主人。事实上，他已成为中亚的真正合罕。对忽必烈来说这是一个预示着灾难的事实。
塔剌恩忽里台对蒙古帝国的影响其意义之深远，也许不亚于忽必烈的开平忽里台，但最起码它不逊色于阿里不哥的和林忽里台。当忽必烈突然感到西部压力减轻时，八剌正率军西向，但这种不正常的现象，不久便得到验证，海都已成长为巨人。忽必烈站在大汗的高位上，环视一下蒙古部国，他悲哀地发现：钦察与伊利已成独立汗国，察合台与窝阔台的兀鲁思已属海都，自从阿鲁忽、八剌将自己的势力从河中地区驱走，中亚已不再直辖于自己。自己能发号施令的只有蒙古及东道诸王领地、汉地、畏兀儿地附近，吐蕃和大理，显得七零八碎，犹如老和尚的百衲衣。
如果说蒙哥曾使蒙古帝国濒于崩溃，那么，忽必烈已使蒙古帝国的分裂转变成事实了，尽管它还名义上保留着大汗的形式与帝国的躯壳。
忽必烈挑起的内战使蒙古绵延长达40多年的对西征服停息，而停息的结果却改变了欧亚大陆东部的历史。忽必烈无力组织起由黄金家族诸系参加的征服欧洲的恢宏战争，但他却有能力组织起对中国南部及东南亚，甚至对日本的征服战争，对中亚的无力控制迫使忽必烈强烈的征服欲也只能向东、南渲泄，中国的命运为之一改。